RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440016.6

HOXD-AS2-202, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 999 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SMIM6P0DI80 62 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXD-AS2-202ENST00000440016 K7ERJ3 54 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FAM218AQ96MZ4 157 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TPRXLQ17RH7 258 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXD-AS2-202ENST00000440016 F8WEM9 126 aa15.31■□□□□ 0.04
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRIAP1O43715 76 aa15.31■□□□□ 0.04
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CD164Q04900 197 aa15.31■□□□□ 0.04
HOXD-AS2-202ENST00000440016 A0A0G2JQZ4 141 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SNCGO76070 127 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PPDPFLQ8WWR9 84 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LIMD2Q9BT23 127 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXD-AS2-202ENST00000440016 A0A1B0GX51 115 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXD-AS2-202ENST00000440016 OCIAD2Q56VL3 154 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PSMB2P49721 201 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SNHG12Q9BXW3 62 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CDIP1Q9H305 208 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CLEC2BQ92478 149 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD-AS2-202ENST00000440016 Q6JHZ5 121 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD-AS2-202ENST00000440016 COX6CP09669 75 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXD-AS2-202ENST00000440016 Q5XG85 94 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IGFL1Q6UW32 110 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXD-AS2-202ENST00000440016 M0R143 59 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 H3BUT2 72 aa15.12■□□□□ 0.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GHRHP01286 108 aa15.12■□□□□ 0.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TSTD3H0UI37 97 aa15.1■□□□□ 0.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DNAL4O96015 105 aa15.09■□□□□ 0.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FABP2P12104 132 aa15.07■□□□□ 0
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa15.05■□□□□ -0
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ORMDL1Q9P0S3 153 aa15.05■□□□□ -0
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TCL1BO95988 128 aa15.04■□□□□ -0
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SCGB1C2P0DMR2 95 aa15.04■□□□□ -0
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C1orf195Q5TG92 126 aa15.04■□□□□ -0
HOXD-AS2-202ENST00000440016 H3BMG7 143 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MUC17Q685J3 4493 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 H3BQ85 93 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LST1O00453 97 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRACP01848 142 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXD-AS2-202ENST00000440016 Q6Q795 121 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXD-AS2-202ENST00000440016 XP32Q5T750 250 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TEN1Q86WV5 123 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BATFQ16520 125 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C9orf92A6NGG3 77 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD-AS2-202ENST00000440016 A0A1B0GV72 72 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXD-AS2-202ENST00000440016 UBE2V1Q13404 147 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MUC2Q02817 5179 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXD-AS2-202ENST00000440016 A0A1W2PNM2 257 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ANKRD29Q8N6D5 301 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SS18L2Q9UHA2 77 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ATXN8Q156A1 80 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXD-AS2-202ENST00000440016 A0A087WSZ3 146 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BAALC-AS2P0C853 105 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LYRM7Q5U5X0 104 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RBM3P98179 157 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C9orf118A6NHY6 69 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TAX1BP3O14907 124 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CCKP06307 115 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD-AS2-202ENST00000440016 Q96NJ1 140 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DSCR8Q96T75 97 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXD-AS2-202ENST00000440016 A0A0U1RQV1 116 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD-AS2-202ENST00000440016 VPS25Q9BRG1 176 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 A0A1W2PPM0 123 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C9JAW5 83 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PCOTHQ58A44 107 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RPL37P61927 97 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SIGMAR1Q99720 223 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LINC00472Q9H8W2 130 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IGKV4-1P06312 121 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 Q6ZQT0 140 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DEFB116Q30KQ4 102 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FAT4Q6V0I7 4981 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C14orf132Q9NPU4 83 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 H3BT86 120 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MTURNQ8N3F0 131 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PDE6GP18545 87 aa14.46□□□□□ -0.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 Q75L30 129 aa14.45□□□□□ -0.1
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SPCS1Q9Y6A9 102 aa14.45□□□□□ -0.1
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DSCR10P59022 87 aa14.44□□□□□ -0.1
HOXD-AS2-202ENST00000440016 A0A1B0GW54 56 aa14.4□□□□□ -0.1
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PCP4L1A6NKN8 68 aa14.4□□□□□ -0.1
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa14.38□□□□□ -0.11
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LINC00313P59037 77 aa14.37□□□□□ -0.11
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
HOXD-AS2-202ENST00000440016 A8MUU9 505 aa14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.8 ms