RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.04□□□□□ -1.44
POLR1A-202ENST00000409024 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.04□□□□□ -1.44
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1B0GW54 56 aa6.03□□□□□ -1.44
POLR1A-202ENST00000409024 ERC2-IT1O76042 136 aa6.03□□□□□ -1.44
POLR1A-202ENST00000409024 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.03□□□□□ -1.44
POLR1A-202ENST00000409024 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.03□□□□□ -1.44
POLR1A-202ENST00000409024 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.03□□□□□ -1.44
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
POLR1A-202ENST00000409024 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.02□□□□□ -1.45
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF861PO60384 105 aa6.02□□□□□ -1.45
POLR1A-202ENST00000409024 Q6ZQT0 140 aa6.02□□□□□ -1.45
POLR1A-202ENST00000409024 SCXQ7RTU7 201 aa6.02□□□□□ -1.45
POLR1A-202ENST00000409024 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.02□□□□□ -1.45
POLR1A-202ENST00000409024 VPS25Q9BRG1 176 aa6.02□□□□□ -1.45
POLR1A-202ENST00000409024 MYCBP2O75592 4640 aa6.02□□□□□ -1.45
POLR1A-202ENST00000409024 C1orf137Q5JT78 98 aa6.01□□□□□ -1.45
POLR1A-202ENST00000409024 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.01□□□□□ -1.45
POLR1A-202ENST00000409024 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
POLR1A-202ENST00000409024 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6□□□□□ -1.45
POLR1A-202ENST00000409024 F8WEM9 126 aa6□□□□□ -1.45
POLR1A-202ENST00000409024 IGLV7-43P04211 117 aa6□□□□□ -1.45
POLR1A-202ENST00000409024 GAGE2AQ6NT46 116 aa6□□□□□ -1.45
POLR1A-202ENST00000409024 SMIM29Q86T20 159 aa5.99□□□□□ -1.45
POLR1A-202ENST00000409024 CDIP1Q9H305 208 aa5.99□□□□□ -1.45
POLR1A-202ENST00000409024 FAT1Q14517 4588 aa5.99□□□□□ -1.45
POLR1A-202ENST00000409024 DNAH8Q96JB1 4490 aa5.99□□□□□ -1.45
POLR1A-202ENST00000409024 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00483Q53H64 154 aa5.98□□□□□ -1.45
POLR1A-202ENST00000409024 Q6JHZ5 121 aa5.97□□□□□ -1.45
POLR1A-202ENST00000409024 SPRR4Q96PI1 79 aa5.97□□□□□ -1.45
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00643Q86TS7 51 aa5.96□□□□□ -1.46
POLR1A-202ENST00000409024 SIGMAR1Q99720 223 aa5.96□□□□□ -1.46
POLR1A-202ENST00000409024 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.96□□□□□ -1.46
POLR1A-202ENST00000409024 UBL5Q9BZL1 73 aa5.94□□□□□ -1.46
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1B0GV72 72 aa5.93□□□□□ -1.46
POLR1A-202ENST00000409024 J3QL48 77 aa5.93□□□□□ -1.46
POLR1A-202ENST00000409024 Q6Q795 121 aa5.93□□□□□ -1.46
POLR1A-202ENST00000409024 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.93□□□□□ -1.46
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00846Q9NV44 126 aa5.93□□□□□ -1.46
POLR1A-202ENST00000409024 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.92□□□□□ -1.46
POLR1A-202ENST00000409024 Q8NBF4 154 aa5.92□□□□□ -1.46
POLR1A-202ENST00000409024 IMUPQ9GZP8 106 aa5.92□□□□□ -1.46
POLR1A-202ENST00000409024 XGP55808 180 aa5.91□□□□□ -1.46
POLR1A-202ENST00000409024 CRYGAP11844 174 aa5.9□□□□□ -1.46
POLR1A-202ENST00000409024 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.9□□□□□ -1.46
POLR1A-202ENST00000409024 IGFL1Q6UW32 110 aa5.9□□□□□ -1.46
POLR1A-202ENST00000409024 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.89□□□□□ -1.47
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1W2PNM2 257 aa5.89□□□□□ -1.47
POLR1A-202ENST00000409024 SCGB1A1P11684 91 aa5.89□□□□□ -1.47
POLR1A-202ENST00000409024 Q5VSD8 79 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1A-202ENST00000409024 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1A-202ENST00000409024 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1A-202ENST00000409024 MT-ATP8P03928 68 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1A-202ENST00000409024 NREPQ16612 68 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1A-202ENST00000409024 Q6ZVQ6 151 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1A-202ENST00000409024 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR1A-202ENST00000409024 CXCL6P80162 114 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR1A-202ENST00000409024 HAMPP81172 84 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR1A-202ENST00000409024 CD164Q04900 197 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR1A-202ENST00000409024 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR1A-202ENST00000409024 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.84□□□□□ -1.47
POLR1A-202ENST00000409024 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
POLR1A-202ENST00000409024 MOBPQ13875 183 aa5.82□□□□□ -1.48
POLR1A-202ENST00000409024 SS18L2Q9UHA2 77 aa5.82□□□□□ -1.48
POLR1A-202ENST00000409024 FAM229AH3BQW9 127 aa5.81□□□□□ -1.48
POLR1A-202ENST00000409024 A0A087WSZ3 146 aa5.8□□□□□ -1.48
POLR1A-202ENST00000409024 BPY2O14599 106 aa5.8□□□□□ -1.48
POLR1A-202ENST00000409024 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.8□□□□□ -1.48
POLR1A-202ENST00000409024 RNF213Q63HN8 5207 aa5.8□□□□□ -1.48
POLR1A-202ENST00000409024 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa5.79□□□□□ -1.48
POLR1A-202ENST00000409024 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
POLR1A-202ENST00000409024 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
POLR1A-202ENST00000409024 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.79□□□□□ -1.48
POLR1A-202ENST00000409024 J3KT08 172 aa5.78□□□□□ -1.48
POLR1A-202ENST00000409024 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
POLR1A-202ENST00000409024 Q5XG85 94 aa5.77□□□□□ -1.49
POLR1A-202ENST00000409024 A0A0G2JQZ4 141 aa5.76□□□□□ -1.49
POLR1A-202ENST00000409024 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.76□□□□□ -1.49
POLR1A-202ENST00000409024 A0A087X002 238 aa5.75□□□□□ -1.49
POLR1A-202ENST00000409024 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
POLR1A-202ENST00000409024 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.75□□□□□ -1.49
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.75□□□□□ -1.49
POLR1A-202ENST00000409024 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.74□□□□□ -1.49
POLR1A-202ENST00000409024 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
POLR1A-202ENST00000409024 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.73□□□□□ -1.49
POLR1A-202ENST00000409024 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
POLR1A-202ENST00000409024 SPINK1P00995 79 aa5.72□□□□□ -1.49
POLR1A-202ENST00000409024 C4orf48Q5BLP8 95 aa5.72□□□□□ -1.49
POLR1A-202ENST00000409024 LIMD2Q9BT23 127 aa5.72□□□□□ -1.49
POLR1A-202ENST00000409024 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.71□□□□□ -1.5
POLR1A-202ENST00000409024 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.71□□□□□ -1.5
POLR1A-202ENST00000409024 ATOX1O00244 68 aa5.71□□□□□ -1.5
POLR1A-202ENST00000409024 IGKV4-1P06312 121 aa5.71□□□□□ -1.5
POLR1A-202ENST00000409024 DSCR10P59022 87 aa5.71□□□□□ -1.5
POLR1A-202ENST00000409024 A8MWP4 228 aa5.7□□□□□ -1.5
POLR1A-202ENST00000409024 NDUFB1O75438 58 aa5.7□□□□□ -1.5
POLR1A-202ENST00000409024 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.7□□□□□ -1.5
POLR1A-202ENST00000409024 LRP2P98164 4655 aa5.7□□□□□ -1.5
POLR1A-202ENST00000409024 SMIM20Q8N5G0 67 aa5.69□□□□□ -1.5
POLR1A-202ENST00000409024 Q96NJ1 140 aa5.69□□□□□ -1.5
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