RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552331.1

CS-232, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-232ENST00000552331 IGIPA6NJ69 53 aa1.42□□□□□ -2.18
CS-232ENST00000552331 SPINK9Q5DT21 86 aa1.42□□□□□ -2.18
CS-232ENST00000552331 DEFB123Q8N688 67 aa1.42□□□□□ -2.18
CS-232ENST00000552331 LCE3DQ9BYE3 92 aa1.42□□□□□ -2.18
CS-232ENST00000552331 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP1.42□□□□□ -2.18
CS-232ENST00000552331 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP1.41□□□□□ -2.18
CS-232ENST00000552331 K7EQZ3 153 aa1.41□□□□□ -2.18
CS-232ENST00000552331 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa1.41□□□□□ -2.18
CS-232ENST00000552331 CCL22O00626 93 aa1.4□□□□□ -2.19
CS-232ENST00000552331 COX6B2Q6YFQ2 88 aa1.4□□□□□ -2.19
CS-232ENST00000552331 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
CS-232ENST00000552331 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa1.39□□□□□ -2.19
CS-232ENST00000552331 KRTAP12-4P60329 112 aa1.39□□□□□ -2.19
CS-232ENST00000552331 C4AP0C0L4 1744 aa1.39□□□□□ -2.19
CS-232ENST00000552331 C4BP0C0L5 1744 aa1.39□□□□□ -2.19
CS-232ENST00000552331 TRPM2O94759 1503 aa1.39□□□□□ -2.19
CS-232ENST00000552331 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa1.39□□□□□ -2.19
CS-232ENST00000552331 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP1.39□□□□□ -2.191e-7■□□□□ 10.5
CS-232ENST00000552331 SORL1Q92673 2214 aa1.39□□□□□ -2.19
CS-232ENST00000552331 DEPDC5O75140 1603 aa1.38□□□□□ -2.19
CS-232ENST00000552331 H0YGX0 51 aa1.38□□□□□ -2.19
CS-232ENST00000552331 COX6B1P14854 86 aa1.38□□□□□ -2.19
CS-232ENST00000552331 PRO0255Q9UI72 69 aa1.38□□□□□ -2.19
CS-232ENST00000552331 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
CS-232ENST00000552331 COX6A2Q02221 97 aa1.37□□□□□ -2.19
CS-232ENST00000552331 CRIP1P50238 77 aa1.36□□□□□ -2.19
CS-232ENST00000552331 Q6ZSA8 131 aa1.36□□□□□ -2.19
CS-232ENST00000552331 Q8IZM0 81 aa1.36□□□□□ -2.19
CS-232ENST00000552331 PLCE1Q9P212 2302 aa1.36□□□□□ -2.19
CS-232ENST00000552331 COL6A6A6NMZ7 2263 aa1.35□□□□□ -2.19
CS-232ENST00000552331 LINC01546A6NGU7 62 aa1.35□□□□□ -2.19
CS-232ENST00000552331 C10orf95Q9H7T3 257 aa1.35□□□□□ -2.19
CS-232ENST00000552331 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa1.35□□□□□ -2.19
CS-232ENST00000552331 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa1.35□□□□□ -2.19
CS-232ENST00000552331 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP1.34□□□□□ -2.19
CS-232ENST00000552331 ROS1P08922 2347 aa1.34□□□□□ -2.19
CS-232ENST00000552331 IQGAP1P46940 1657 aa1.34□□□□□ -2.19
CS-232ENST00000552331 ATP7AQ04656 1500 aa1.34□□□□□ -2.2
CS-232ENST00000552331 HMCN1Q96RW7 5635 aa1.34□□□□□ -2.2
CS-232ENST00000552331 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa1.33□□□□□ -2.2
CS-232ENST00000552331 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.33□□□□□ -2.2
CS-232ENST00000552331 PRO3102Q9H379 93 aa1.33□□□□□ -2.2
CS-232ENST00000552331 TMEM167BQ9NRX6 74 aa1.33□□□□□ -2.2
CS-232ENST00000552331 NFAT5O94916 1531 aa1.32□□□□□ -2.2
CS-232ENST00000552331 NDUFA3O95167 84 aa1.32□□□□□ -2.2
CS-232ENST00000552331 LINC00158P58513 81 aa1.32□□□□□ -2.2
CS-232ENST00000552331 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP1.32□□□□□ -2.2
CS-232ENST00000552331 HIVEP2P31629 2446 aa1.32□□□□□ -2.2
CS-232ENST00000552331 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP1.31□□□□□ -2.2
CS-232ENST00000552331 LYNX1G3V0Z9 82 aa1.31□□□□□ -2.2
CS-232ENST00000552331 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa1.31□□□□□ -2.2
CS-232ENST00000552331 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa1.31□□□□□ -2.2
CS-232ENST00000552331 BPTFQ12830 3046 aa1.3□□□□□ -2.2
CS-232ENST00000552331 LMO7Q8WWI1 1683 aa1.3□□□□□ -2.2
CS-232ENST00000552331 Q5VSD8 79 aa1.3□□□□□ -2.2
CS-232ENST00000552331 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa1.3□□□□□ -2.2
CS-232ENST00000552331 A0A0D9SG42 100 aa1.29□□□□□ -2.2
CS-232ENST00000552331 SPINK4O60575 86 aa1.29□□□□□ -2.2
CS-232ENST00000552331 KRTAP12-3P60328 96 aa1.28□□□□□ -2.2
CS-232ENST00000552331 USF3Q68DE3 2245 aa1.28□□□□□ -2.2
CS-232ENST00000552331 C2CD3Q4AC94 2353 aa1.28□□□□□ -2.2
CS-232ENST00000552331 SPRR1AP35321 89 aa1.27□□□□□ -2.21
CS-232ENST00000552331 MINOS1Q5TGZ0 78 aa1.27□□□□□ -2.21
CS-232ENST00000552331 LINC00308Q8TCZ7 52 aa1.27□□□□□ -2.21
CS-232ENST00000552331 APLNQ9ULZ1 77 aa1.27□□□□□ -2.21
CS-232ENST00000552331 DEFB105AQ8NG35 78 aa1.26□□□□□ -2.21
CS-232ENST00000552331 KIF21BO75037 1637 aa1.26□□□□□ -2.21
CS-232ENST00000552331 LOC730098B7Z3J9 87 aa1.25□□□□□ -2.21
CS-232ENST00000552331 H0YAA0 97 aa1.25□□□□□ -2.21
CS-232ENST00000552331 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa1.25□□□□□ -2.21
CS-232ENST00000552331 SPTBN2O15020 2390 aa1.24□□□□□ -2.21
CS-232ENST00000552331 SPRR1BP22528 89 aa1.24□□□□□ -2.21
CS-232ENST00000552331 LELP1Q5T871 98 aa1.24□□□□□ -2.21
CS-232ENST00000552331 WFDC13Q8IUB5 93 aa1.24□□□□□ -2.21
CS-232ENST00000552331 C6orf48Q9UBA6 75 aa1.24□□□□□ -2.21
CS-232ENST00000552331 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.23□□□□□ -2.21
CS-232ENST00000552331 ZNF462Q96JM2 2506 aa1.23□□□□□ -2.21
CS-232ENST00000552331 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
CS-232ENST00000552331 CACNA1HO95180 2353 aa1.22□□□□□ -2.21
CS-232ENST00000552331 IAPPP10997 89 aa1.22□□□□□ -2.21
CS-232ENST00000552331 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP1.21□□□□□ -2.22
CS-232ENST00000552331 ALMS1Q8TCU4 4167 aa1.21□□□□□ -2.22
CS-232ENST00000552331 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
CS-232ENST00000552331 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP1.2□□□□□ -2.22
CS-232ENST00000552331 PKDREJQ9NTG1 2253 aa1.2□□□□□ -2.22
CS-232ENST00000552331 WNK2Q9Y3S1 2297 aa1.2□□□□□ -2.22
CS-232ENST00000552331 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
CS-232ENST00000552331 SMIM2Q9BVW6 85 aa1.19□□□□□ -2.22
CS-232ENST00000552331 DUOX1Q9NRD9 1551 aa1.18□□□□□ -2.22
CS-232ENST00000552331 GCC2Q8IWJ2 1684 aa1.18□□□□□ -2.22
CS-232ENST00000552331 DEFB130BP0DP73 79 aa1.17□□□□□ -2.22
CS-232ENST00000552331 DEFB130AP0DP74 79 aa1.17□□□□□ -2.22
CS-232ENST00000552331 TFF3Q07654 80 aa1.17□□□□□ -2.22
CS-232ENST00000552331 KLK9Q2XQG4 91 aa1.17□□□□□ -2.22
CS-232ENST00000552331 TTC28Q96AY4 2481 aa1.17□□□□□ -2.22
CS-232ENST00000552331 MROH2BQ7Z745 1585 aa1.17□□□□□ -2.22
CS-232ENST00000552331 CLTCL1P53675 1640 aa1.16□□□□□ -2.22
CS-232ENST00000552331 RPS27P42677 84 aaKnown RBP1.16□□□□□ -2.22
CS-232ENST00000552331 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP1.16□□□□□ -2.22
CS-232ENST00000552331 POLQO75417 2590 aa1.15□□□□□ -2.22
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