RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487939.1

PTEN-204, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 3

Gene PTEN, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-204ENST00000487939 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP-1.12□□□□□ -2.59
PTEN-204ENST00000487939 ACACBO00763 2458 aa-1.12□□□□□ -2.59
PTEN-204ENST00000487939 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP-1.12□□□□□ -2.59
PTEN-204ENST00000487939 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa-1.12□□□□□ -2.59
PTEN-204ENST00000487939 H0YGG7 62 aa-1.12□□□□□ -2.59
PTEN-204ENST00000487939 WFDC13Q8IUB5 93 aa-1.12□□□□□ -2.59
PTEN-204ENST00000487939 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa-1.13□□□□□ -2.59
PTEN-204ENST00000487939 C2orf88Q9BSF0 95 aa-1.13□□□□□ -2.59
PTEN-204ENST00000487939 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-1.13□□□□□ -2.59
PTEN-204ENST00000487939 PKD1L3Q7Z443 1732 aa-1.14□□□□□ -2.59
PTEN-204ENST00000487939 GNGT2O14610 69 aa-1.14□□□□□ -2.59
PTEN-204ENST00000487939 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP-1.14□□□□□ -2.59
PTEN-204ENST00000487939 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP-1.15□□□□□ -2.59
PTEN-204ENST00000487939 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa-1.15□□□□□ -2.59
PTEN-204ENST00000487939 TLN2Q9Y4G6 2542 aa-1.15□□□□□ -2.59
PTEN-204ENST00000487939 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP-1.15□□□□□ -2.59
PTEN-204ENST00000487939 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa-1.15□□□□□ -2.59
PTEN-204ENST00000487939 SAMD9Q5K651 1589 aa-1.15□□□□□ -2.59
PTEN-204ENST00000487939 LINC00587B1AMM8 73 aa-1.15□□□□□ -2.59
PTEN-204ENST00000487939 UQCRHP07919 91 aa-1.15□□□□□ -2.59
PTEN-204ENST00000487939 DSPP15924 2871 aaKnown RBP-1.16□□□□□ -2.59
PTEN-204ENST00000487939 H3BNG1 76 aa-1.16□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 NDUFC1O43677 76 aa-1.16□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 HIGD1BQ9P298 99 aa-1.16□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 QSER1Q2KHR3 1735 aa-1.16□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 FAM135AQ9P2D6 1515 aa-1.16□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 DNAH7Q8WXX0 4024 aa-1.16□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 CLIP1P30622 1438 aa-1.16□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 C4AP0C0L4 1744 aa-1.17□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 C4BP0C0L5 1744 aa-1.17□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 H7BZZ5 65 aa-1.17□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa-1.18□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 ITPR1Q14643 2758 aa-1.18□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 UBR3Q6ZT12 1888 aa-1.18□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP-1.18□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa-1.18□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 PREX1Q8TCU6 1659 aa-1.18□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 TRGV9Q99603 122 aa-1.18□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 PMCHL2Q9BQD1 86 aa-1.18□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 CEP295Q9C0D2 2601 aa-1.18□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa-1.18□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 COL12A1Q99715 3063 aa-1.18□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 NRXN1Q9ULB1 1477 aa-1.18□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 FRYQ5TBA9 3013 aa-1.18□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 C5orf42Q9H799 3197 aa-1.18□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 MYH4Q9Y623 1939 aa-1.19□□□□□ -2.6
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PTEN-204ENST00000487939 DEFA5Q01523 94 aa-1.19□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 AP4S1Q9Y587 144 aa-1.19□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 DNAH8Q96JB1 4490 aa-1.19□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 TMEM218A2RU14 115 aa-1.2□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 C9orf92A6NGG3 77 aa-1.2□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 PSENENQ9NZ42 101 aa-1.2□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 MYO9AB2RTY4 2548 aa-1.2□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa-1.21□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 C20orf202A1L168 122 aa-1.21□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 MPC2O95563 127 aa-1.22□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 MT-ATP8P03928 68 aa-1.22□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 IGLC2P0DOY2 106 aa-1.22□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 IGLC3P0DOY3 106 aa-1.22□□□□□ -2.6
PTEN-204ENST00000487939 ALKQ9UM73 1620 aa-1.22□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 TIAM2Q8IVF5 1701 aa-1.23□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa-1.23□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 ATOX1O00244 68 aa-1.23□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 ETDBQ3ZM63 59 aa-1.23□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 D6R8Y8 96 aa-1.24□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 LEPROTL1O95214 131 aa-1.24□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 MUSTN1Q8IVN3 82 aa-1.24□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 SERP2Q8N6R1 65 aa-1.24□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 SCN11AQ9UI33 1791 aa-1.24□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 CFAP46Q8IYW2 2715 aa-1.25□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 F8WEM9 126 aa-1.25□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP-1.25□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 COL6A5A8TX70 2615 aa-1.25□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 MAP3K1Q13233 1512 aa-1.25□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP-1.26□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 RGPD5Q99666 1765 aa-1.26□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 S100A10P60903 97 aa-1.26□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 SARNPP82979 210 aaKnown RBP-1.26□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 ZNF720Q7Z2F6 126 aa-1.26□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa-1.26□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 MAGI2Q86UL8 1455 aa-1.26□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 FYCO1Q9BQS8 1478 aa-1.26□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 TRIOO75962 3097 aa-1.26□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP-1.27□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 LRBAP50851 2863 aa-1.27□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa-1.27□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 CHD7Q9P2D1 2997 aa-1.28□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 RGPD1P0DJD0 1748 aa-1.28□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 LRRC7Q96NW7 1537 aa-1.28□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 COX7BP24311 80 aa-1.28□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 HMGN3Q15651 99 aa-1.28□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 NMSQ5H8A3 153 aa-1.28□□□□□ -2.61
PTEN-204ENST00000487939 UQCRHLA0A096LP55 91 aa-1.29□□□□□ -2.62
PTEN-204ENST00000487939 H0YAA0 97 aa-1.29□□□□□ -2.62
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