RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372904.7

TTPAL-202, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,234 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-202ENST00000372904 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.58□□□□□ -1.36
TTPAL-202ENST00000372904 Q6ZRX8 168 aa6.58□□□□□ -1.36
TTPAL-202ENST00000372904 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.58□□□□□ -1.36
TTPAL-202ENST00000372904 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.58□□□□□ -1.36
TTPAL-202ENST00000372904 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.57□□□□□ -1.36
TTPAL-202ENST00000372904 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.57□□□□□ -1.36
TTPAL-202ENST00000372904 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.57□□□□□ -1.36
TTPAL-202ENST00000372904 MP68P56378 58 aa6.57□□□□□ -1.36
TTPAL-202ENST00000372904 CCDC179H3BU77 68 aa6.56□□□□□ -1.36
TTPAL-202ENST00000372904 Q6ZVQ6 151 aa6.56□□□□□ -1.36
TTPAL-202ENST00000372904 C20orf197Q8N268 126 aa6.56□□□□□ -1.36
TTPAL-202ENST00000372904 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TTPAL-202ENST00000372904 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.55□□□□□ -1.36
TTPAL-202ENST00000372904 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.55□□□□□ -1.36
TTPAL-202ENST00000372904 Q6Q795 121 aa6.55□□□□□ -1.36
TTPAL-202ENST00000372904 EPM2AB3EWF7 344 aa6.55□□□□□ -1.36
TTPAL-202ENST00000372904 FBN2P35556 2912 aa6.55□□□□□ -1.36
TTPAL-202ENST00000372904 UQCRQO14949 82 aa6.54□□□□□ -1.36
TTPAL-202ENST00000372904 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.54□□□□□ -1.36
TTPAL-202ENST00000372904 A0A087WSZ3 146 aa6.54□□□□□ -1.36
TTPAL-202ENST00000372904 Q6ZQT0 140 aa6.53□□□□□ -1.36
TTPAL-202ENST00000372904 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TTPAL-202ENST00000372904 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
TTPAL-202ENST00000372904 SNURFQ9Y675 71 aa6.53□□□□□ -1.36
TTPAL-202ENST00000372904 ZANQ9Y493 2812 aa6.52□□□□□ -1.37
TTPAL-202ENST00000372904 Q8N9L7 120 aa6.52□□□□□ -1.37
TTPAL-202ENST00000372904 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.52□□□□□ -1.37
TTPAL-202ENST00000372904 SERP2Q8N6R1 65 aa6.52□□□□□ -1.37
TTPAL-202ENST00000372904 SVIPQ8NHG7 77 aa6.51□□□□□ -1.37
TTPAL-202ENST00000372904 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.51□□□□□ -1.37
TTPAL-202ENST00000372904 IGKV4-1P06312 121 aa6.51□□□□□ -1.37
TTPAL-202ENST00000372904 MAST4O15021 2626 aa6.5□□□□□ -1.37
TTPAL-202ENST00000372904 A0A087WTM6 91 aa6.5□□□□□ -1.37
TTPAL-202ENST00000372904 A0A1W2PNN7 141 aa6.5□□□□□ -1.37
TTPAL-202ENST00000372904 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.49□□□□□ -1.37
TTPAL-202ENST00000372904 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.49□□□□□ -1.37
TTPAL-202ENST00000372904 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.49□□□□□ -1.37
TTPAL-202ENST00000372904 COX7CP15954 63 aa6.49□□□□□ -1.37
TTPAL-202ENST00000372904 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
TTPAL-202ENST00000372904 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.48□□□□□ -1.37
TTPAL-202ENST00000372904 BCE1O60756 84 aa6.48□□□□□ -1.37
TTPAL-202ENST00000372904 ITPR2Q14571 2701 aa6.48□□□□□ -1.37
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM258P61165 79 aa6.48□□□□□ -1.37
TTPAL-202ENST00000372904 MOBPQ13875 183 aa6.48□□□□□ -1.37
TTPAL-202ENST00000372904 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
TTPAL-202ENST00000372904 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.47□□□□□ -1.37
TTPAL-202ENST00000372904 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.47□□□□□ -1.37
TTPAL-202ENST00000372904 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.47□□□□□ -1.37
TTPAL-202ENST00000372904 Q8NDZ9 215 aa6.46□□□□□ -1.37
TTPAL-202ENST00000372904 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
TTPAL-202ENST00000372904 CSMD2Q7Z408 3487 aa6.46□□□□□ -1.38
TTPAL-202ENST00000372904 CXCL6P80162 114 aa6.45□□□□□ -1.38
TTPAL-202ENST00000372904 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.45□□□□□ -1.38
TTPAL-202ENST00000372904 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.44□□□□□ -1.38
TTPAL-202ENST00000372904 VPS13CQ709C8 3753 aa6.44□□□□□ -1.38
TTPAL-202ENST00000372904 A0A0G2JQZ4 141 aa6.43□□□□□ -1.38
TTPAL-202ENST00000372904 Q8N377 158 aa6.43□□□□□ -1.38
TTPAL-202ENST00000372904 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.43□□□□□ -1.38
TTPAL-202ENST00000372904 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.43□□□□□ -1.38
TTPAL-202ENST00000372904 FAM236CP0DP71 79 aa6.43□□□□□ -1.38
TTPAL-202ENST00000372904 J3KT08 172 aa6.42□□□□□ -1.38
TTPAL-202ENST00000372904 Q8NBF4 154 aa6.42□□□□□ -1.38
TTPAL-202ENST00000372904 ERC2-IT1O76042 136 aa6.42□□□□□ -1.38
TTPAL-202ENST00000372904 CASC2Q6XLA1 102 aa6.42□□□□□ -1.38
TTPAL-202ENST00000372904 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa6.42□□□□□ -1.38
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.42□□□□□ -1.38
TTPAL-202ENST00000372904 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.42□□□□□ -1.38
TTPAL-202ENST00000372904 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
TTPAL-202ENST00000372904 SEC61GP60059 68 aa6.41□□□□□ -1.38
TTPAL-202ENST00000372904 HIVEP1P15822 2718 aa6.41□□□□□ -1.38
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.41□□□□□ -1.38
TTPAL-202ENST00000372904 TENM4Q6N022 2769 aa6.41□□□□□ -1.38
TTPAL-202ENST00000372904 HCG22E2RYF7 251 aa6.41□□□□□ -1.38
TTPAL-202ENST00000372904 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.41□□□□□ -1.38
TTPAL-202ENST00000372904 SMIM29Q86T20 159 aa6.4□□□□□ -1.38
TTPAL-202ENST00000372904 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
TTPAL-202ENST00000372904 PRR4Q16378 134 aa6.39□□□□□ -1.39
TTPAL-202ENST00000372904 V9GYY9 64 aa6.39□□□□□ -1.39
TTPAL-202ENST00000372904 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.39□□□□□ -1.39
TTPAL-202ENST00000372904 ZFHX3Q15911 3703 aa6.38□□□□□ -1.39
TTPAL-202ENST00000372904 IGFL1Q6UW32 110 aa6.38□□□□□ -1.39
TTPAL-202ENST00000372904 TNP2Q05952 138 aa6.38□□□□□ -1.39
TTPAL-202ENST00000372904 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.37□□□□□ -1.39
TTPAL-202ENST00000372904 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.37□□□□□ -1.39
TTPAL-202ENST00000372904 C5orf47Q569G3 176 aa6.36□□□□□ -1.39
TTPAL-202ENST00000372904 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
TTPAL-202ENST00000372904 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
TTPAL-202ENST00000372904 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.36□□□□□ -1.39
TTPAL-202ENST00000372904 PDZD2O15018 2839 aa6.36□□□□□ -1.39
TTPAL-202ENST00000372904 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.35□□□□□ -1.39
TTPAL-202ENST00000372904 LINC00208Q96KT6 92 aa6.35□□□□□ -1.39
TTPAL-202ENST00000372904 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.35□□□□□ -1.39
TTPAL-202ENST00000372904 NDUFC1O43677 76 aa6.34□□□□□ -1.39
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF861PO60384 105 aa6.34□□□□□ -1.4
TTPAL-202ENST00000372904 A0A1B0GW54 56 aa6.33□□□□□ -1.4
TTPAL-202ENST00000372904 LIMD2Q9BT23 127 aa6.33□□□□□ -1.4
TTPAL-202ENST00000372904 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.33□□□□□ -1.4
TTPAL-202ENST00000372904 H0Y9P7 68 aa6.33□□□□□ -1.4
TTPAL-202ENST00000372904 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.33□□□□□ -1.4
TTPAL-202ENST00000372904 COL6A5A8TX70 2615 aa6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms