RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
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HOXD8-201ENST00000313173 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa16.8■□□□□ 0.28
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HOXD8-201ENST00000313173 HIGD2AQ9BW72 106 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXD8-201ENST00000313173 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
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HOXD8-201ENST00000313173 BCE1O60756 84 aa16.64■□□□□ 0.26
HOXD8-201ENST00000313173 UBE2AP49459 152 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXD8-201ENST00000313173 PLAC8Q9NZF1 115 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXD8-201ENST00000313173 C9orf153Q5TBE3 101 aa16.62■□□□□ 0.25
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HOXD8-201ENST00000313173 LCE6AA0A183 80 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXD8-201ENST00000313173 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa16.6■□□□□ 0.25
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