RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636483.1

SPTAN1-232, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-232ENST00000636483 SPTA1P02549 2419 aa-0.21□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 ALKQ9UM73 1620 aa-0.21□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 KIF20BQ96Q89 1820 aa-0.22□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 UQCRHLA0A096LP55 91 aa-0.22□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 F8WEM9 126 aa-0.22□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 M0R143 59 aa-0.22□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 M0R2T5 61 aa-0.22□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 LINC00032P0C843 101 aa-0.22□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 ETDBQ3ZM63 59 aa-0.22□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 DPY30Q9C005 99 aa-0.22□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 PSENENQ9NZ42 101 aa-0.22□□□□□ -2.44
SPTAN1-232ENST00000636483 TENM2Q9NT68 2774 aa-0.23□□□□□ -2.45
SPTAN1-232ENST00000636483 STAB1Q9NY15 2570 aa-0.23□□□□□ -2.45
SPTAN1-232ENST00000636483 QSER1Q2KHR3 1735 aa-0.23□□□□□ -2.45
SPTAN1-232ENST00000636483 BCORQ6W2J9 1755 aa-0.23□□□□□ -2.45
SPTAN1-232ENST00000636483 I3L3M4 83 aa-0.23□□□□□ -2.45
SPTAN1-232ENST00000636483 DEFB112Q30KQ8 113 aa-0.23□□□□□ -2.45
SPTAN1-232ENST00000636483 LELP1Q5T871 98 aa-0.23□□□□□ -2.45
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SPTAN1-232ENST00000636483 FANCAO15360 1455 aa-0.23□□□□□ -2.45
SPTAN1-232ENST00000636483 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
SPTAN1-232ENST00000636483 RGPD2P0DJD1 1756 aa-0.24□□□□□ -2.45
SPTAN1-232ENST00000636483 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa-0.24□□□□□ -2.45
SPTAN1-232ENST00000636483 LEPROTL1O95214 131 aa-0.24□□□□□ -2.45
SPTAN1-232ENST00000636483 SPRR2BP35325 72 aa-0.24□□□□□ -2.45
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF720Q7Z2F6 126 aa-0.24□□□□□ -2.45
SPTAN1-232ENST00000636483 DNAJC13O75165 2243 aa-0.24□□□□□ -2.45
SPTAN1-232ENST00000636483 VPS8Q8N3P4 1428 aa-0.24□□□□□ -2.45
SPTAN1-232ENST00000636483 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
SPTAN1-232ENST00000636483 D6R8Y8 96 aa-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1-232ENST00000636483 IGLC2P0DOY2 106 aa-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1-232ENST00000636483 IGLC3P0DOY3 106 aa-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1-232ENST00000636483 MUSTN1Q8IVN3 82 aa-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1-232ENST00000636483 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1-232ENST00000636483 SNHG12Q9BXW3 62 aa-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1-232ENST00000636483 HIGD1BQ9P298 99 aa-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1-232ENST00000636483 ATP10BO94823 1461 aa-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1-232ENST00000636483 LRRC7Q96NW7 1537 aa-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1-232ENST00000636483 PREX1Q8TCU6 1659 aa-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1-232ENST00000636483 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1-232ENST00000636483 MYH4Q9Y623 1939 aa-0.25□□□□□ -2.45
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SPTAN1-232ENST00000636483 RGPD1P0DJD0 1748 aa-0.26□□□□□ -2.45
SPTAN1-232ENST00000636483 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP-0.26□□□□□ -2.45
SPTAN1-232ENST00000636483 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa-0.26□□□□□ -2.45
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SPTAN1-232ENST00000636483 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
SPTAN1-232ENST00000636483 WNK1Q9H4A3 2382 aa-0.27□□□□□ -2.45
SPTAN1-232ENST00000636483 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa-0.27□□□□□ -2.45
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SPTAN1-232ENST00000636483 C20orf78Q9BR46 151 aa-0.28□□□□□ -2.45
SPTAN1-232ENST00000636483 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa-0.28□□□□□ -2.45
SPTAN1-232ENST00000636483 CHD8Q9HCK8 2581 aa-0.28□□□□□ -2.45
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SPTAN1-232ENST00000636483 SVEP1Q4LDE5 3571 aa-0.29□□□□□ -2.46
SPTAN1-232ENST00000636483 C4AP0C0L4 1744 aa-0.29□□□□□ -2.46
SPTAN1-232ENST00000636483 C4BP0C0L5 1744 aa-0.29□□□□□ -2.46
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SPTAN1-232ENST00000636483 REV3LO60673 3130 aa-0.29□□□□□ -2.46
SPTAN1-232ENST00000636483 MAGI2Q86UL8 1455 aa-0.29□□□□□ -2.46
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SPTAN1-232ENST00000636483 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
SPTAN1-232ENST00000636483 ACANP16112 2415 aa-0.3□□□□□ -2.46
SPTAN1-232ENST00000636483 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
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SPTAN1-232ENST00000636483 TTC37Q6PGP7 1564 aa-0.32□□□□□ -2.46
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SPTAN1-232ENST00000636483 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
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SPTAN1-232ENST00000636483 PEA15Q15121 130 aa-0.32□□□□□ -2.46
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SPTAN1-232ENST00000636483 TIAM2Q8IVF5 1701 aa-0.33□□□□□ -2.46
SPTAN1-232ENST00000636483 UBR3Q6ZT12 1888 aa-0.33□□□□□ -2.46
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SPTAN1-232ENST00000636483 GYPAP02724 150 aa-0.33□□□□□ -2.46
SPTAN1-232ENST00000636483 NMSQ5H8A3 153 aa-0.33□□□□□ -2.46
SPTAN1-232ENST00000636483 ALKAL2Q6UX46 152 aa-0.33□□□□□ -2.46
SPTAN1-232ENST00000636483 C9orf62Q8N4C0 152 aa-0.33□□□□□ -2.46
SPTAN1-232ENST00000636483 AKAP13Q12802 2813 aa-0.33□□□□□ -2.46
SPTAN1-232ENST00000636483 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP-0.34□□□□□ -2.46
SPTAN1-232ENST00000636483 KIF14Q15058 1648 aa-0.34□□□□□ -2.46
SPTAN1-232ENST00000636483 LTN1O94822 1766 aa-0.34□□□□□ -2.46
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