RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628545.1

GLIS1-202, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-202ENST00000628545 A0A096LNT2 108 aa12.29□□□□□ -0.44
GLIS1-202ENST00000628545 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
GLIS1-202ENST00000628545 H3BUX3 64 aa12.29□□□□□ -0.44
GLIS1-202ENST00000628545 M0R2N4 97 aa12.28□□□□□ -0.44
GLIS1-202ENST00000628545 LMO4P61968 165 aa12.28□□□□□ -0.44
GLIS1-202ENST00000628545 Q6ZQT0 140 aa12.28□□□□□ -0.44
GLIS1-202ENST00000628545 Q6ZVQ6 151 aa12.28□□□□□ -0.44
GLIS1-202ENST00000628545 CHD6Q8TD26 2715 aa12.28□□□□□ -0.44
GLIS1-202ENST00000628545 UBE2L6O14933 153 aa12.28□□□□□ -0.44
GLIS1-202ENST00000628545 DEFB131AP59861 70 aa12.28□□□□□ -0.44
GLIS1-202ENST00000628545 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
GLIS1-202ENST00000628545 NREPQ16612 68 aa12.26□□□□□ -0.45
GLIS1-202ENST00000628545 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
GLIS1-202ENST00000628545 Q6ZTC4 211 aa12.26□□□□□ -0.45
GLIS1-202ENST00000628545 CREBBPQ92793 2442 aa12.25□□□□□ -0.45
GLIS1-202ENST00000628545 TMEM89A2RUT3 159 aa12.25□□□□□ -0.45
GLIS1-202ENST00000628545 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
GLIS1-202ENST00000628545 CXCL6P80162 114 aa12.25□□□□□ -0.45
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF843Q8N446 348 aa12.25□□□□□ -0.45
GLIS1-202ENST00000628545 PRR3P79522 188 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
GLIS1-202ENST00000628545 C10orf99Q6UWK7 81 aa12.24□□□□□ -0.45
GLIS1-202ENST00000628545 C6orf223Q8N319 242 aa12.24□□□□□ -0.45
GLIS1-202ENST00000628545 C2CD3Q4AC94 2353 aa12.24□□□□□ -0.45
GLIS1-202ENST00000628545 A6NDX4 124 aa12.24□□□□□ -0.45
GLIS1-202ENST00000628545 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa12.23□□□□□ -0.45
GLIS1-202ENST00000628545 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
GLIS1-202ENST00000628545 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP12.23□□□□□ -0.45
GLIS1-202ENST00000628545 DAD1P61803 113 aa12.23□□□□□ -0.45
GLIS1-202ENST00000628545 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
GLIS1-202ENST00000628545 ERC2-IT1O76042 136 aa12.22□□□□□ -0.45
GLIS1-202ENST00000628545 C19orf84I3L1E1 186 aa12.21□□□□□ -0.45
GLIS1-202ENST00000628545 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa12.21□□□□□ -0.46
GLIS1-202ENST00000628545 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa12.21□□□□□ -0.46
GLIS1-202ENST00000628545 PRYO14603 147 aa12.21□□□□□ -0.46
GLIS1-202ENST00000628545 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa12.2□□□□□ -0.46
GLIS1-202ENST00000628545 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa12.2□□□□□ -0.46
GLIS1-202ENST00000628545 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa12.2□□□□□ -0.46
GLIS1-202ENST00000628545 DYNLRB2Q8TF09 96 aa12.2□□□□□ -0.46
GLIS1-202ENST00000628545 A8MTW9 85 aa12.19□□□□□ -0.46
GLIS1-202ENST00000628545 SCXQ7RTU7 201 aa12.19□□□□□ -0.46
GLIS1-202ENST00000628545 LRRK2Q5S007 2527 aa12.19□□□□□ -0.46
GLIS1-202ENST00000628545 ABCA2Q9BZC7 2435 aa12.18□□□□□ -0.46
GLIS1-202ENST00000628545 A0A1W2PPR1 153 aa12.18□□□□□ -0.46
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa12.18□□□□□ -0.46
GLIS1-202ENST00000628545 Q1T7F1 81 aa12.18□□□□□ -0.46
GLIS1-202ENST00000628545 Q6ZRP5 223 aa12.18□□□□□ -0.46
GLIS1-202ENST00000628545 FAM208BQ5VWN6 2430 aa12.18□□□□□ -0.46
GLIS1-202ENST00000628545 BPY2O14599 106 aa12.17□□□□□ -0.46
GLIS1-202ENST00000628545 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa12.16□□□□□ -0.46
GLIS1-202ENST00000628545 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa12.16□□□□□ -0.46
GLIS1-202ENST00000628545 INSP01308 110 aa12.16□□□□□ -0.46
GLIS1-202ENST00000628545 C6orf99Q4VX62 202 aa12.16□□□□□ -0.46
GLIS1-202ENST00000628545 VPS13CQ709C8 3753 aa12.15□□□□□ -0.46
GLIS1-202ENST00000628545 hDV103S1A0JD37 113 aa12.15□□□□□ -0.47
GLIS1-202ENST00000628545 LRCOL1A6NCL2 159 aa12.14□□□□□ -0.47
GLIS1-202ENST00000628545 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
GLIS1-202ENST00000628545 LINC00575Q6W349 94 aa12.13□□□□□ -0.47
GLIS1-202ENST00000628545 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa12.11□□□□□ -0.47
GLIS1-202ENST00000628545 PSPHP1O15172 72 aa12.1□□□□□ -0.47
GLIS1-202ENST00000628545 CUBNO60494 3623 aa12.1□□□□□ -0.47
GLIS1-202ENST00000628545 TENM4Q6N022 2769 aa12.1□□□□□ -0.47
GLIS1-202ENST00000628545 OCR1Q9BZK8 76 aa12.1□□□□□ -0.47
GLIS1-202ENST00000628545 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
GLIS1-202ENST00000628545 C11orf44Q8N8P7 122 aa12.09□□□□□ -0.47
GLIS1-202ENST00000628545 SPATA3Q8NHX4 192 aa12.09□□□□□ -0.47
GLIS1-202ENST00000628545 UBE2E2Q96LR5 201 aa12.09□□□□□ -0.47
GLIS1-202ENST00000628545 HIGD2AQ9BW72 106 aa12.09□□□□□ -0.47
GLIS1-202ENST00000628545 MAP6D1Q9H9H5 199 aa12.08□□□□□ -0.48
GLIS1-202ENST00000628545 C9orf66Q5T8R8 295 aa12.08□□□□□ -0.48
GLIS1-202ENST00000628545 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa12.08□□□□□ -0.48
GLIS1-202ENST00000628545 CSMD2Q7Z408 3487 aa12.07□□□□□ -0.48
GLIS1-202ENST00000628545 CD164L2Q6UWJ8 174 aa12.07□□□□□ -0.48
GLIS1-202ENST00000628545 CENPEQ02224 2701 aa12.07□□□□□ -0.48
GLIS1-202ENST00000628545 MUC7Q8TAX7 377 aa12.06□□□□□ -0.48
GLIS1-202ENST00000628545 PDE6GP18545 87 aa12.06□□□□□ -0.48
GLIS1-202ENST00000628545 TRAV22A0A0B4J277 110 aa12.05□□□□□ -0.48
GLIS1-202ENST00000628545 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
GLIS1-202ENST00000628545 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa12.05□□□□□ -0.48
GLIS1-202ENST00000628545 A8MU10 97 aa12.05□□□□□ -0.48
GLIS1-202ENST00000628545 SLURP1P55000 103 aa12.05□□□□□ -0.48
GLIS1-202ENST00000628545 CELSR2Q9HCU4 2923 aa12.05□□□□□ -0.48
GLIS1-202ENST00000628545 Q6ZQY7 126 aa12.04□□□□□ -0.48
GLIS1-202ENST00000628545 LINC01356Q8N9X3 169 aa12.04□□□□□ -0.48
GLIS1-202ENST00000628545 C1orf64Q8NEQ6 169 aa12.04□□□□□ -0.48
GLIS1-202ENST00000628545 Q8NDZ9 215 aa12.04□□□□□ -0.48
GLIS1-202ENST00000628545 FBN2P35556 2912 aa12.03□□□□□ -0.48
GLIS1-202ENST00000628545 Q8IZM0 81 aa12.03□□□□□ -0.48
GLIS1-202ENST00000628545 Q8N9L7 120 aa12.03□□□□□ -0.48
GLIS1-202ENST00000628545 DEFB136Q30KP8 78 aa12.03□□□□□ -0.48
GLIS1-202ENST00000628545 SPG11Q96JI7 2443 aa12.02□□□□□ -0.49
GLIS1-202ENST00000628545 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
GLIS1-202ENST00000628545 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
GLIS1-202ENST00000628545 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa12.01□□□□□ -0.49
GLIS1-202ENST00000628545 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa12.01□□□□□ -0.49
GLIS1-202ENST00000628545 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa12.01□□□□□ -0.49
GLIS1-202ENST00000628545 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa12.01□□□□□ -0.49
GLIS1-202ENST00000628545 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa12.01□□□□□ -0.49
GLIS1-202ENST00000628545 NOTCH3Q9UM47 2321 aa12□□□□□ -0.49
GLIS1-202ENST00000628545 C4orf48Q5BLP8 95 aa12□□□□□ -0.49
GLIS1-202ENST00000628545 IGHV4-59P01825 116 aa11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms