RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558671.1

AC107980.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AC107980.1, Length 3,355 nt, Biotype sense intronic.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC107980.1-201ENST00000558671 ESM1Q9NQ30 184 aa5.08□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 LINC00588Q9Y4M8 146 aa5.08□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 IGF2RP11717 2491 aa5.08□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 SPG11Q96JI7 2443 aa5.08□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 CHD8Q9HCK8 2581 aa5.08□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 NCOR2Q9Y618 2525 aa5.08□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 TECTAO75443 2155 aa5.08□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 C10orf142B7Z368 130 aa5.08□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 PRYO14603 147 aa5.08□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 COX7A1P24310 79 aa5.08□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 UBE2AP49459 152 aa5.08□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 DEFB1P60022 68 aa5.08□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 NOTCH3Q9UM47 2321 aa5.07□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 A8MU10 97 aa5.07□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 TTTY12Q9BZ98 90 aa5.07□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 IGKV3-15P01624 115 aa5.07□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa5.07□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.07□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 LINC00315P59091 139 aa5.06□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 Q6ZRP5 223 aa5.06□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 CCL17Q92583 94 aa5.06□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.06□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 LINC00574Q9H8X3 128 aa5.06□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 SPTBN4Q9H254 2564 aa5.06□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.06□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 CTSGP08311 255 aa5.06□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 LINC00269Q8N2A0 174 aa5.06□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 MUC4Q99102 2169 aa5.06□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 TRAV22A0A0B4J277 110 aa5.05□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 DEFB123Q8N688 67 aa5.05□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 LINC00337Q8N6G1 96 aa5.05□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa5.05□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.05□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa5.05□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 E7EQL1 145 aa5.05□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 MP68P56378 58 aa5.05□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.05□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa5.05□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.05□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa5.04□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 BPY2O14599 106 aa5.04□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 GNLYP22749 145 aa5.04□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 LINC00158P58513 81 aa5.04□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa5.04□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 CSMD1Q96PZ7 3565 aa5.04□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa5.04□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 M0QY20 66 aa5.04□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 REG3AQ06141 175 aa5.04□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 C22orf34Q6ZV56 151 aa5.04□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 AKAP13Q12802 2813 aa5.04□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 PRR4Q16378 134 aa5.04□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 Q1T7F1 81 aa5.04□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.04□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 SYCNQ0VAF6 134 aa5.03□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 LINC01356Q8N9X3 169 aa5.03□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 HIGD2AQ9BW72 106 aa5.03□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 SVEP1Q4LDE5 3571 aa5.03□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 MED14OSP0DP75 135 aa5.03□□□□□ -1.6
AC107980.1-201ENST00000558671 IGHV1-8P0DP01 117 aa5.02□□□□□ -1.61
AC107980.1-201ENST00000558671 LENEPQ9Y5L5 61 aa5.02□□□□□ -1.61
AC107980.1-201ENST00000558671 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa5.02□□□□□ -1.61
AC107980.1-201ENST00000558671 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa5.02□□□□□ -1.61
AC107980.1-201ENST00000558671 hDV103S1A0JD37 113 aa5.02□□□□□ -1.61
AC107980.1-201ENST00000558671 F8W735 103 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
AC107980.1-201ENST00000558671 Q6ZTC4 211 aa5.02□□□□□ -1.61
AC107980.1-201ENST00000558671 PRSS33Q8NF86 280 aa5.02□□□□□ -1.61
AC107980.1-201ENST00000558671 LRBAP50851 2863 aa5.02□□□□□ -1.61
AC107980.1-201ENST00000558671 HTN1P15515 57 aa5.02□□□□□ -1.61
AC107980.1-201ENST00000558671 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.02□□□□□ -1.61
AC107980.1-201ENST00000558671 HCG22E2RYF7 251 aa5.01□□□□□ -1.61
AC107980.1-201ENST00000558671 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
AC107980.1-201ENST00000558671 ZFHX3Q15911 3703 aa5.01□□□□□ -1.61
AC107980.1-201ENST00000558671 IGHV1-46P01743 117 aa5.01□□□□□ -1.61
AC107980.1-201ENST00000558671 LYPD2Q6UXB3 125 aa5.01□□□□□ -1.61
AC107980.1-201ENST00000558671 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
AC107980.1-201ENST00000558671 A6NED7 52 aa5□□□□□ -1.61
AC107980.1-201ENST00000558671 IGKV3-20P01619 116 aa5□□□□□ -1.61
AC107980.1-201ENST00000558671 COX6A2Q02221 97 aa5□□□□□ -1.61
AC107980.1-201ENST00000558671 LINC01554Q52M75 96 aa5□□□□□ -1.61
AC107980.1-201ENST00000558671 ZNF843Q8N446 348 aa5□□□□□ -1.61
AC107980.1-201ENST00000558671 DIRC1Q969H9 104 aa5□□□□□ -1.61
AC107980.1-201ENST00000558671 LINC00313P59037 77 aa5□□□□□ -1.61
AC107980.1-201ENST00000558671 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa4.99□□□□□ -1.61
AC107980.1-201ENST00000558671 IGKV2D-28P01615 120 aa4.99□□□□□ -1.61
AC107980.1-201ENST00000558671 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.99□□□□□ -1.61
AC107980.1-201ENST00000558671 C19orf54Q5BKX5 351 aa4.99□□□□□ -1.61
AC107980.1-201ENST00000558671 COX7B2Q8TF08 81 aa4.99□□□□□ -1.61
AC107980.1-201ENST00000558671 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
AC107980.1-201ENST00000558671 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
AC107980.1-201ENST00000558671 C16orf90A8MZG2 172 aa4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 160.4 ms