RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000108593.7

Ctdnep1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdnep1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PpifQ99KR7 206 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr15P23275 312 aa23.14■■□□□ 1.29
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 SrstQ06666 185 aa23.14■■□□□ 1.29
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cdkn2aQ64364 169 aa23.14■■□□□ 1.29
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Prss22Q9ER10 306 aa23.13■■□□□ 1.29
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Eda2rQ8BX35 297 aa23.08■■□□□ 1.29
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr860Q8VFF7 317 aa23.08■■□□□ 1.29
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 3110018I06RikQ9CXS0 120 aa23.08■■□□□ 1.29
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Bex3Q9WTZ9 124 aa23.08■■□□□ 1.29
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PpyP10601 100 aa23.07■■□□□ 1.28
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sdc1P18828 311 aa23.06■■□□□ 1.28
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Trav8d-1Q5R1H8 112 aa23.06■■□□□ 1.28
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ly6c2P0CW03 131 aa23.05■■□□□ 1.28
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Eif5aP63242 154 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr1394Q8VET2 312 aa23.05■■□□□ 1.28
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr1440Q8VFV4 315 aa23.05■■□□□ 1.28
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rnf126Q91YL2 313 aa23.05■■□□□ 1.28
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1700025B11RikA0A087WNZ6 93 aa23.02■■□□□ 1.28
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Hspg2Q05793 3707 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.27
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr1532-ps1A0A0R4J8U2 307 aa23.01■■□□□ 1.27
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Igkv1-132A0A0B4J1H9 120 aa23■■□□□ 1.27
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr1256Q8VGP1 306 aa23■■□□□ 1.27
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