Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
9030612E09RikQ8CE20 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
9030612E09RikQ8CE20 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
9030612E09RikQ8CE20 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
9030612E09RikQ8CE20 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
9030612E09RikQ8CE20 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
9030612E09RikQ8CE20 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
9030612E09RikQ8CE20 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
9030612E09RikQ8CE20 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
9030612E09RikQ8CE20 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
9030612E09RikQ8CE20 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
9030612E09RikQ8CE20 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
9030612E09RikQ8CE20 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
9030612E09RikQ8CE20 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
9030612E09RikQ8CE20 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
9030612E09RikQ8CE20 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
9030612E09RikQ8CE20 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
9030612E09RikQ8CE20 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
9030612E09RikQ8CE20 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
9030612E09RikQ8CE20 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
9030612E09RikQ8CE20 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
9030612E09RikQ8CE20 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
9030612E09RikQ8CE20 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
9030612E09RikQ8CE20 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
9030612E09RikQ8CE20 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
9030612E09RikQ8CE20 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
9030612E09RikQ8CE20 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
9030612E09RikQ8CE20 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
9030612E09RikQ8CE20 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
9030612E09RikQ8CE20 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
9030612E09RikQ8CE20 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
9030612E09RikQ8CE20 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
9030612E09RikQ8CE20 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
9030612E09RikQ8CE20 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
9030612E09RikQ8CE20 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
9030612E09RikQ8CE20 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
9030612E09RikQ8CE20 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
9030612E09RikQ8CE20 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
9030612E09RikQ8CE20 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
9030612E09RikQ8CE20 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
9030612E09RikQ8CE20 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
9030612E09RikQ8CE20 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
9030612E09RikQ8CE20 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
9030612E09RikQ8CE20 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
9030612E09RikQ8CE20 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
9030612E09RikQ8CE20 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
9030612E09RikQ8CE20 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
9030612E09RikQ8CE20 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
9030612E09RikQ8CE20 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
9030612E09RikQ8CE20 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
9030612E09RikQ8CE20 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
9030612E09RikQ8CE20 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
9030612E09RikQ8CE20 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
9030612E09RikQ8CE20 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
9030612E09RikQ8CE20 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
9030612E09RikQ8CE20 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
9030612E09RikQ8CE20 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
9030612E09RikQ8CE20 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
9030612E09RikQ8CE20 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
9030612E09RikQ8CE20 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
9030612E09RikQ8CE20 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
9030612E09RikQ8CE20 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
9030612E09RikQ8CE20 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
9030612E09RikQ8CE20 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
9030612E09RikQ8CE20 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
9030612E09RikQ8CE20 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
9030612E09RikQ8CE20 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
9030612E09RikQ8CE20 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
9030612E09RikQ8CE20 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
9030612E09RikQ8CE20 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
9030612E09RikQ8CE20 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
9030612E09RikQ8CE20 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
9030612E09RikQ8CE20 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
9030612E09RikQ8CE20 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
9030612E09RikQ8CE20 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
9030612E09RikQ8CE20 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
9030612E09RikQ8CE20 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
9030612E09RikQ8CE20 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
9030612E09RikQ8CE20 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
9030612E09RikQ8CE20 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
9030612E09RikQ8CE20 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
9030612E09RikQ8CE20 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
9030612E09RikQ8CE20 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
9030612E09RikQ8CE20 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
9030612E09RikQ8CE20 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
9030612E09RikQ8CE20 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
9030612E09RikQ8CE20 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
9030612E09RikQ8CE20 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
9030612E09RikQ8CE20 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
9030612E09RikQ8CE20 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
9030612E09RikQ8CE20 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
9030612E09RikQ8CE20 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
9030612E09RikQ8CE20 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
9030612E09RikQ8CE20 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
9030612E09RikQ8CE20 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
9030612E09RikQ8CE20 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
9030612E09RikQ8CE20 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
9030612E09RikQ8CE20 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
9030612E09RikQ8CE20 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
9030612E09RikQ8CE20 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms