Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B638

Trav4-2, T cell receptor alpha variable 4-2 (Fragment), mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav4-2A0A075B638 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trav4-2A0A075B638 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trav4-2A0A075B638 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trav4-2A0A075B638 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Trav4-2A0A075B638 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Trav4-2A0A075B638 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trav4-2A0A075B638 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trav4-2A0A075B638 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trav4-2A0A075B638 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trav4-2A0A075B638 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trav4-2A0A075B638 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trav4-2A0A075B638 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trav4-2A0A075B638 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trav4-2A0A075B638 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trav4-2A0A075B638 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trav4-2A0A075B638 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trav4-2A0A075B638 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trav4-2A0A075B638 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trav4-2A0A075B638 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trav4-2A0A075B638 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trav4-2A0A075B638 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trav4-2A0A075B638 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Trav4-2A0A075B638 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trav4-2A0A075B638 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trav4-2A0A075B638 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trav4-2A0A075B638 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trav4-2A0A075B638 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trav4-2A0A075B638 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trav4-2A0A075B638 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trav4-2A0A075B638 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trav4-2A0A075B638 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trav4-2A0A075B638 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trav4-2A0A075B638 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trav4-2A0A075B638 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trav4-2A0A075B638 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trav4-2A0A075B638 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trav4-2A0A075B638 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trav4-2A0A075B638 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trav4-2A0A075B638 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trav4-2A0A075B638 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trav4-2A0A075B638 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trav4-2A0A075B638 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trav4-2A0A075B638 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trav4-2A0A075B638 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trav4-2A0A075B638 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trav4-2A0A075B638 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trav4-2A0A075B638 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trav4-2A0A075B638 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trav4-2A0A075B638 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trav4-2A0A075B638 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trav4-2A0A075B638 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trav4-2A0A075B638 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trav4-2A0A075B638 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trav4-2A0A075B638 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trav4-2A0A075B638 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trav4-2A0A075B638 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trav4-2A0A075B638 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trav4-2A0A075B638 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trav4-2A0A075B638 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trav4-2A0A075B638 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trav4-2A0A075B638 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trav4-2A0A075B638 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trav4-2A0A075B638 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trav4-2A0A075B638 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trav4-2A0A075B638 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trav4-2A0A075B638 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trav4-2A0A075B638 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trav4-2A0A075B638 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trav4-2A0A075B638 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trav4-2A0A075B638 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trav4-2A0A075B638 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trav4-2A0A075B638 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trav4-2A0A075B638 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Trav4-2A0A075B638 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trav4-2A0A075B638 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trav4-2A0A075B638 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trav4-2A0A075B638 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trav4-2A0A075B638 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trav4-2A0A075B638 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trav4-2A0A075B638 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trav4-2A0A075B638 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trav4-2A0A075B638 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trav4-2A0A075B638 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trav4-2A0A075B638 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trav4-2A0A075B638 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trav4-2A0A075B638 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trav4-2A0A075B638 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trav4-2A0A075B638 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trav4-2A0A075B638 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trav4-2A0A075B638 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trav4-2A0A075B638 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trav4-2A0A075B638 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trav4-2A0A075B638 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trav4-2A0A075B638 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trav4-2A0A075B638 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trav4-2A0A075B638 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trav4-2A0A075B638 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trav4-2A0A075B638 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trav4-2A0A075B638 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trav4-2A0A075B638 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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