Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ElobP62869 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ElobP62869 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ElobP62869 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ElobP62869 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ElobP62869 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ElobP62869 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ElobP62869 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ElobP62869 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ElobP62869 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ElobP62869 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ElobP62869 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ElobP62869 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ElobP62869 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ElobP62869 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ElobP62869 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ElobP62869 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ElobP62869 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ElobP62869 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ElobP62869 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ElobP62869 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ElobP62869 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ElobP62869 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ElobP62869 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ElobP62869 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ElobP62869 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ElobP62869 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ElobP62869 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ElobP62869 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ElobP62869 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ElobP62869 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ElobP62869 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ElobP62869 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ElobP62869 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ElobP62869 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ElobP62869 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ElobP62869 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ElobP62869 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ElobP62869 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ElobP62869 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ElobP62869 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ElobP62869 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ElobP62869 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ElobP62869 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ElobP62869 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ElobP62869 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ElobP62869 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ElobP62869 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ElobP62869 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ElobP62869 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ElobP62869 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ElobP62869 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ElobP62869 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ElobP62869 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ElobP62869 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ElobP62869 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ElobP62869 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ElobP62869 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ElobP62869 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ElobP62869 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ElobP62869 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ElobP62869 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ElobP62869 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ElobP62869 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ElobP62869 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ElobP62869 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ElobP62869 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ElobP62869 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ElobP62869 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ElobP62869 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ElobP62869 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ElobP62869 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ElobP62869 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ElobP62869 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ElobP62869 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ElobP62869 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ElobP62869 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ElobP62869 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ElobP62869 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ElobP62869 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ElobP62869 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ElobP62869 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ElobP62869 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ElobP62869 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ElobP62869 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ElobP62869 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ElobP62869 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ElobP62869 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ElobP62869 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ElobP62869 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ElobP62869 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ElobP62869 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ElobP62869 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ElobP62869 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ElobP62869 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ElobP62869 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ElobP62869 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ElobP62869 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ElobP62869 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ElobP62869 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms