Protein–RNA interactions for Protein: P84102

Serf2, Small EDRK-rich factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serf2P84102 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Serf2P84102 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Serf2P84102 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Serf2P84102 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Serf2P84102 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Serf2P84102 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Serf2P84102 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Serf2P84102 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Serf2P84102 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Serf2P84102 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Serf2P84102 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Serf2P84102 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Serf2P84102 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Serf2P84102 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Serf2P84102 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Serf2P84102 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Serf2P84102 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Serf2P84102 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Serf2P84102 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Serf2P84102 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Serf2P84102 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Serf2P84102 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Serf2P84102 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Serf2P84102 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Serf2P84102 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Serf2P84102 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Serf2P84102 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Serf2P84102 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Serf2P84102 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Serf2P84102 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Serf2P84102 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Serf2P84102 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Serf2P84102 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Serf2P84102 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Serf2P84102 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Serf2P84102 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Serf2P84102 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Serf2P84102 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Serf2P84102 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Serf2P84102 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Serf2P84102 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Serf2P84102 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Serf2P84102 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Serf2P84102 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Serf2P84102 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Serf2P84102 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Serf2P84102 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Serf2P84102 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Serf2P84102 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Serf2P84102 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Serf2P84102 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Serf2P84102 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Serf2P84102 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Serf2P84102 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Serf2P84102 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Serf2P84102 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Serf2P84102 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Serf2P84102 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Serf2P84102 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Serf2P84102 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Serf2P84102 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Serf2P84102 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Serf2P84102 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Serf2P84102 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Serf2P84102 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Serf2P84102 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Serf2P84102 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Serf2P84102 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Serf2P84102 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Serf2P84102 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Serf2P84102 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Serf2P84102 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Serf2P84102 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Serf2P84102 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Serf2P84102 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Serf2P84102 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Serf2P84102 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Serf2P84102 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Serf2P84102 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Serf2P84102 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Serf2P84102 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Serf2P84102 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Serf2P84102 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serf2P84102 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Serf2P84102 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Serf2P84102 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Serf2P84102 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Serf2P84102 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Serf2P84102 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Serf2P84102 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Serf2P84102 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Serf2P84102 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Serf2P84102 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Serf2P84102 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Serf2P84102 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Serf2P84102 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Serf2P84102 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Serf2P84102 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Serf2P84102 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Serf2P84102 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms