Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAN6

Gtsf1, Gametocyte-specific factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtsf1Q9DAN6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gtsf1Q9DAN6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gtsf1Q9DAN6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtsf1Q9DAN6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtsf1Q9DAN6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtsf1Q9DAN6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gtsf1Q9DAN6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtsf1Q9DAN6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtsf1Q9DAN6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtsf1Q9DAN6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtsf1Q9DAN6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtsf1Q9DAN6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtsf1Q9DAN6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtsf1Q9DAN6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtsf1Q9DAN6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtsf1Q9DAN6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtsf1Q9DAN6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtsf1Q9DAN6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtsf1Q9DAN6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtsf1Q9DAN6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gtsf1Q9DAN6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtsf1Q9DAN6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtsf1Q9DAN6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtsf1Q9DAN6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtsf1Q9DAN6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtsf1Q9DAN6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtsf1Q9DAN6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtsf1Q9DAN6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtsf1Q9DAN6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtsf1Q9DAN6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtsf1Q9DAN6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtsf1Q9DAN6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtsf1Q9DAN6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtsf1Q9DAN6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtsf1Q9DAN6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtsf1Q9DAN6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtsf1Q9DAN6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gtsf1Q9DAN6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtsf1Q9DAN6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtsf1Q9DAN6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtsf1Q9DAN6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtsf1Q9DAN6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtsf1Q9DAN6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtsf1Q9DAN6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtsf1Q9DAN6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtsf1Q9DAN6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtsf1Q9DAN6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtsf1Q9DAN6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtsf1Q9DAN6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtsf1Q9DAN6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtsf1Q9DAN6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtsf1Q9DAN6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtsf1Q9DAN6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtsf1Q9DAN6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtsf1Q9DAN6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtsf1Q9DAN6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtsf1Q9DAN6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtsf1Q9DAN6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtsf1Q9DAN6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtsf1Q9DAN6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtsf1Q9DAN6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtsf1Q9DAN6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtsf1Q9DAN6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtsf1Q9DAN6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtsf1Q9DAN6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtsf1Q9DAN6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtsf1Q9DAN6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtsf1Q9DAN6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtsf1Q9DAN6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtsf1Q9DAN6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtsf1Q9DAN6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtsf1Q9DAN6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtsf1Q9DAN6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtsf1Q9DAN6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtsf1Q9DAN6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtsf1Q9DAN6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtsf1Q9DAN6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtsf1Q9DAN6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtsf1Q9DAN6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtsf1Q9DAN6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtsf1Q9DAN6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtsf1Q9DAN6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtsf1Q9DAN6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtsf1Q9DAN6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtsf1Q9DAN6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtsf1Q9DAN6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtsf1Q9DAN6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtsf1Q9DAN6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtsf1Q9DAN6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtsf1Q9DAN6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtsf1Q9DAN6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtsf1Q9DAN6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtsf1Q9DAN6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtsf1Q9DAN6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtsf1Q9DAN6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtsf1Q9DAN6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtsf1Q9DAN6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtsf1Q9DAN6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtsf1Q9DAN6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtsf1Q9DAN6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms