RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CRNKL1-205	ENST00000496549		H7BZZ5	65 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CRNKL1-205	ENST00000496549	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CRNKL1-205	ENST00000496549	ABCA4	P78363	2273 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CRNKL1-205	ENST00000496549	DSCAM	O60469	2012 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CRNKL1-205	ENST00000496549	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CRNKL1-205	ENST00000496549	CDSN	Q15517	529 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CRNKL1-205	ENST00000496549	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CRNKL1-205	ENST00000496549	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
CRNKL1-205	ENST00000496549	DKK4	Q9UBT3	224 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
CRNKL1-205	ENST00000496549	PDE6G	P18545	87 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CRNKL1-205	ENST00000496549	UBE2B	P63146	152 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CRNKL1-205	ENST00000496549	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CRNKL1-205	ENST00000496549	KLKP1	Q107X0	134 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CRNKL1-205	ENST00000496549	SAP25	Q8TEE9	199 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CRNKL1-205	ENST00000496549	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CRNKL1-205	ENST00000496549	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLPI	P03973	132 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRB1	P04280	392 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CRNKL1-205	ENST00000496549	NBAS	A2RRP1	2371 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CRNKL1-205	ENST00000496549	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
CRNKL1-205	ENST00000496549	LAMA5	O15230	3695 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CRNKL1-205	ENST00000496549	AKAP6	Q13023	2319 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CRNKL1-205	ENST00000496549		M0QY20	66 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CRNKL1-205	ENST00000496549	STH	Q8IWL8	128 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZZEF1	O43149	2961 aa		6.02	□□□□□ -1.44
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	NREP	Q16612	68 aa		6.02	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	LITAF	Q99732	161 aa		6.02	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		6.02	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	CFHR3	Q02985	330 aa		6.02	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		6.02	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	CACNA1A	O00555	2505 aa		6.02	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		6.02	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRY	O14603	147 aa		6.01	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRR9	Q5T870	116 aa		6.01	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		6.01	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGLV1-47	P01700	117 aa		6.01	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		6.01	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A087WYN8	130 aa		6.01	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		6.01	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGF1	P05019	195 aa		6.01	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	GNLY	P22749	145 aa		6.01	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRR15	Q8IV56	129 aa		6.01	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	NPB	Q8NG41	125 aa		6.01	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	COX7B2	Q8TF08	81 aa		6.01	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		6.01	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	AKAP13	Q12802	2813 aa		6.01	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		6	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	6	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q8N2B8	174 aa		6	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q8N3U1	123 aa		6	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	MDS2	Q8NDY4	140 aa		6	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		6	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		6	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549		H3BQ85	93 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	ATRX	P46100	2492 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	PSPHP1	O15172	72 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	NDUFS5	O43920	106 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	MSMP	Q1L6U9	139 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	SORL1	Q92673	2214 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A087WZ39	114 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	UBE2A	P49459	152 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	MGA	Q8IWI9	3026 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q96MF0	132 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	BPY2	O14599	106 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	ATP6V0E1	O15342	81 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	NDUFA4	O00483	81 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV3-11	P01762	117 aa		5.97	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	BSPH1	Q075Z2	132 aa		5.97	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		5.97	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q8N6K4	173 aa		5.97	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		5.97	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		5.97	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		5.97	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	DEFB124	Q8NES8	71 aa		5.97	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		5.96	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		5.96	□□□□□ -1.45
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	DEFB1	P60022	68 aa		5.96	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	SCX	Q7RTU7	201 aa		5.96	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		5.96	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		5.96	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		5.95	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		5.95	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549		G3V318	75 aa		5.95	□□□□□ -1.46
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		5.95	□□□□□ -1.46

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