RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
NISCH-213ENST00000489895 FOXI1Q12951 378 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-213ENST00000489895 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-213ENST00000489895 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
NISCH-213ENST00000489895 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa12.57□□□□□ -0.4
NISCH-213ENST00000489895 SORL1Q92673 2214 aa12.57□□□□□ -0.4
NISCH-213ENST00000489895 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa12.57□□□□□ -0.4
NISCH-213ENST00000489895 EP400Q96L91 3159 aa12.57□□□□□ -0.4
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP10-9P60411 292 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-213ENST00000489895 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
NISCH-213ENST00000489895 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
NISCH-213ENST00000489895 PRR9Q5T870 116 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-213ENST00000489895 NRACQ8N912 160 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-213ENST00000489895 ATOX1O00244 68 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-213ENST00000489895 CNFNQ9BYD5 112 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-213ENST00000489895 PROK1P58294 105 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-213ENST00000489895 RBX1P62877 108 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-213ENST00000489895 LELP1Q5T871 98 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-213ENST00000489895 C11orf21Q9P2W6 132 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-213ENST00000489895 PLXNB1O43157 2135 aa12.54□□□□□ -0.4
NISCH-213ENST00000489895 HCFC1P51610 2035 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-213ENST00000489895 TSHBP01222 138 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-213ENST00000489895 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
NISCH-213ENST00000489895 MP68P56378 58 aa12.52□□□□□ -0.4
NISCH-213ENST00000489895 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.4
NISCH-213ENST00000489895 CD164L2Q6UWJ8 174 aa12.52□□□□□ -0.4
NISCH-213ENST00000489895 SYCNQ0VAF6 134 aa12.52□□□□□ -0.4
NISCH-213ENST00000489895 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
NISCH-213ENST00000489895 A0A1W2PPR1 153 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-213ENST00000489895 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
NISCH-213ENST00000489895 Q8N976 141 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-213ENST00000489895 A0A1B0GX51 115 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-213ENST00000489895 SMIM20Q8N5G0 67 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-213ENST00000489895 LINC00308Q8TCZ7 52 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-213ENST00000489895 WFDC10AQ9H1F0 79 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-213ENST00000489895 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-213ENST00000489895 TIMM17BO60830 172 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-213ENST00000489895 C16orf95Q9H693 158 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-213ENST00000489895 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
NISCH-213ENST00000489895 TCL1BO95988 128 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-213ENST00000489895 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-213ENST00000489895 HIGD2AQ9BW72 106 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-213ENST00000489895 IGLV1-51P01701 117 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-213ENST00000489895 ODF3L2Q3SX64 289 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-213ENST00000489895 TMEM258P61165 79 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-213ENST00000489895 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-213ENST00000489895 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-213ENST00000489895 LINC00643Q86TS7 51 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-213ENST00000489895 ABCA2Q9BZC7 2435 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-213ENST00000489895 TP73-AS1Q9UF72 201 aa12.46□□□□□ -0.41
NISCH-213ENST00000489895 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa12.46□□□□□ -0.42
NISCH-213ENST00000489895 UBE2D3P61077 147 aa12.46□□□□□ -0.42
NISCH-213ENST00000489895 UBE2D2P62837 147 aa12.46□□□□□ -0.42
NISCH-213ENST00000489895 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-213ENST00000489895 SMR3AQ99954 134 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-213ENST00000489895 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-213ENST00000489895 A0A087WZ39 114 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-213ENST00000489895 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-213ENST00000489895 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-213ENST00000489895 G3V4G9 280 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-213ENST00000489895 MUC7Q8TAX7 377 aa12.45□□□□□ -0.42
NISCH-213ENST00000489895 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-213ENST00000489895 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-213ENST00000489895 OXLD1Q5BKU9 147 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-213ENST00000489895 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-213ENST00000489895 TANC2Q9HCD6 1990 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-213ENST00000489895 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-213ENST00000489895 C14orf132Q9NPU4 83 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-213ENST00000489895 DSCAML1Q8TD84 2053 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-213ENST00000489895 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-213ENST00000489895 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
NISCH-213ENST00000489895 PTH2Q96A98 100 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-213ENST00000489895 XAGE1AQ9HD64 81 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-213ENST00000489895 COX8CQ7Z4L0 72 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-213ENST00000489895 CLUHP3Q96NS8 147 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-213ENST00000489895 MYO9AB2RTY4 2548 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-213ENST00000489895 CHCHD7Q9BUK0 85 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-213ENST00000489895 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-213ENST00000489895 UBE2D1P51668 147 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-213ENST00000489895 C7orf33Q8WU49 177 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-213ENST00000489895 H0Y9J4 135 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-213ENST00000489895 COX17Q14061 63 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-213ENST00000489895 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
NISCH-213ENST00000489895 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
NISCH-213ENST00000489895 BPY2O14599 106 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-213ENST00000489895 A0A0J9YWU9 116 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-213ENST00000489895 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-213ENST00000489895 B5MCH6 92 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-213ENST00000489895 M0R378 163 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-213ENST00000489895 TRIAP1O43715 76 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-213ENST00000489895 PRM2P04554 102 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-213ENST00000489895 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-213ENST00000489895 Q8IZM0 81 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-213ENST00000489895 C6orf99Q4VX62 202 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-213ENST00000489895 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-213ENST00000489895 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-213ENST00000489895 EDN2P20800 178 aa12.37□□□□□ -0.43
NISCH-213ENST00000489895 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
NISCH-213ENST00000489895 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-213ENST00000489895 IGIPA6NJ69 53 aa12.36□□□□□ -0.43
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