RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389413.7

PTPRN2-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,723 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-201ENST00000389413 CXCL5P42830 114 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRN2-201ENST00000389413 NDUFA1O15239 70 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRN2-201ENST00000389413 LINC00308Q8TCZ7 52 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRN2-201ENST00000389413 SPANXCQ9NY87 97 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRN2-201ENST00000389413 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 CITED1Q99966 193 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 AVPP01185 164 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 Q6ZSV7 163 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 DEFB135Q30KP9 77 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 TMEM126AQ9H061 195 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 Q9HAA7 133 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 H7C423 109 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 BRI3O95415 125 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 A8MZ25 164 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 CAMK2N2Q96S95 79 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 TIMM17BO60830 172 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 DNAH14Q0VDD8 3507 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 EDN2P20800 178 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 C1orf43Q9BWL3 253 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 DEFB4AO15263 64 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 LINC00643Q86TS7 51 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 ATOX1O00244 68 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 ABCA2Q9BZC7 2435 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 INSL3P51460 131 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 SPAG11BQ08648 103 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 PRM2P04554 102 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 WFDC11Q8NEX6 87 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 RMI2Q96E14 147 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 C18orf65Q6ZTR6 163 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 SPATA25Q9BR10 227 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
PTPRN2-201ENST00000389413 RNF183Q96D59 192 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRN2-201ENST00000389413 TLN2Q9Y4G6 2542 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRN2-201ENST00000389413 NCR3O14931 201 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRN2-201ENST00000389413 UBE2D1P51668 147 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRN2-201ENST00000389413 A0A1B0GX51 115 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRN2-201ENST00000389413 KLK12Q9UKR0 248 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRN2-201ENST00000389413 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PTPRN2-201ENST00000389413 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRN2-201ENST00000389413 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRN2-201ENST00000389413 PCSK5Q92824 1860 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRN2-201ENST00000389413 SZT2Q5T011 3432 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRN2-201ENST00000389413 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRN2-201ENST00000389413 C14orf132Q9NPU4 83 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRN2-201ENST00000389413 H3BQ85 93 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRN2-201ENST00000389413 SMIM9A6NGZ8 99 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRN2-201ENST00000389413 LINC00269Q8N2A0 174 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRN2-201ENST00000389413 SMIM20Q8N5G0 67 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRN2-201ENST00000389413 FAM222AQ5U5X8 452 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF580Q9UK33 172 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRN2-201ENST00000389413 LST1O00453 97 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRN2-201ENST00000389413 CHD9Q3L8U1 2897 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRN2-201ENST00000389413 TSPEAR-AS2P59090 65 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRN2-201ENST00000389413 LINC01546A6NGU7 62 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 RBM3P98179 157 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 POM121L12Q8N7R1 296 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 LYRM9A8MSI8 78 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 REG3AQ06141 175 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 CHD8Q9HCK8 2581 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 DEFB105AQ8NG35 78 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 DIRC1Q969H9 104 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 VCANP13611 3396 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 SPTBN4Q9H254 2564 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 XGP55808 180 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 UBE2D3P61077 147 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 UBE2D2P62837 147 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 SPEGQ15772 3267 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 LINC01006Q8NI28 216 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 ODF3L2Q3SX64 289 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 LINC00242Q5T6M2 205 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF843Q8N446 348 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 ABCA12Q86UK0 2595 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP11.72□□□□□ -0.531e-6■■■□□ 15.1
PTPRN2-201ENST00000389413 AMELXQ99217 191 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 CHCHD7Q9BUK0 85 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 PTPRBP23467 1997 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 WFDC10AQ9H1F0 79 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 PDE6GP18545 87 aa11.71□□□□□ -0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 hADV29S1A0JD25 119 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 CDK2AP2O75956 126 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 SLPIP03973 132 aa11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.2 ms