RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	YDR444W	Q04093	687 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	THI73	Q07904	523 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	YLR046C	Q12253	270 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	GEX1	P25596	615 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	YIH1	P25637	258 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	CWP1	P28319	239 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	CSG2	P35206	410 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	GEX2	P36173	615 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	YMC2	P38087	329 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	STL1	P39932	569 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	YEL075C	P39972	122 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	LSC2	P53312	427 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
YNL057W	YNL057W	PIR1	Q03178	341 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	AIM32	Q04689	311 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	YLR012C	Q07927	99 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
YNL057W	YNL057W	EMP46	Q12396	444 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	SUC2	P00724	532 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	YER152C	P10356	443 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	CYC8	P14922	966 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	MUM2	P38236	366 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	HSL7	P38274	827 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	DYS1	P38791	387 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	CTM1	P38818	585 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	LAM1	P38851	1228 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	FIG4	P42837	879 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	NBP35	P52920	328 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	INA17	Q02888	182 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	ATG10	Q07879	167 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	THI20	Q08224	551 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	MET32	Q12041	191 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	GNT1	Q12096	491 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNL057W	YNL057W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	GYP6	P32806	458 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	PMT1	P33775	817 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	UBS1	P38290	277 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	ELO1	P39540	310 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	COS5	P47187	383 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	AIM14	P53109	570 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	YNR063W	P53749	607 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	PRM1	P53835	661 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	KTR6	P54070	446 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	ADI1	Q03677	179 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	ENT2	Q05785	613 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	ABF1	P14164	731 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	RED1	P14291	827 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	PTP1	P25044	335 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	CYM1	P32898	989 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	YKL151C	P36059	337 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	YLR297W	Q05899	129 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	SRO7	Q12038	1033 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	YDR061W	Q12298	539 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	GPR1	Q12361	961 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	PNS1	Q12412	539 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	SKM1	Q12469	655 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	RPL43B	P0CX26	92 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	BEM1	P29366	551 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	LIP5	P32875	414 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	MRP4	P32902	394 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	SRB2	P34162	210 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	VAC8	P39968	578 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	KTR7	P40504	517 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	MNT2	P53059	558 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	HST3	P53687	447 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	SUR7	P54003	302 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	ARA2	Q04212	335 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	AAD4	Q07747	329 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	PEX11	Q12462	236 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	TFC3	P34111	1160 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	SLD2	P34252	453 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	ADD66	P36040	267 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL057W	YNL057W	APM3	P38153	483 aa		4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 38.2 ms