RNA–Protein interactions for RNA: YML009C

MRPL39, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit, yeast

Gene MRPL39, Length 213 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPL39	YML009C	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	RIP-Chip
MRPL39	YML009C	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	SEY1	Q99287	776 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	HSF1	P10961	833 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	MIH1	P23748	554 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	SAK1	P38990	1142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	YEL028W	P39989	153 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	ASG1	P40467	964 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	SNG1	P46950	547 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	STR2	P47164	639 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	TCB2	P48231	1178 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	YTP1	P53584	459 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	INP2	Q03824	705 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	VPS38	Q05919	439 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	YDL129W	Q07555	291 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	TPO1	Q07824	586 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	DAS2	Q12084	232 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	YLR046C	Q12253	270 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	GPM3	Q12326	303 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	IZH4	Q99393	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	PMS1	P14242	873 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	GEX1	P25596	615 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	MEI4	P29467	408 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	MCM2	P29469	868 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	TFB1	P32776	642 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	LIP5	P32875	414 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	SRX1	P36077	127 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	GEX2	P36173	615 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	RRT2	P38332	387 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	BIT2	P38346	545 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	YHL041W	P38730	149 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	YHR078W	P38799	552 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	COQ5	P49017	307 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	AMA1	P50082	593 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	AIM14	P53109	570 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	NPY1	P53164	384 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	VPS9	P54787	451 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	NGL3	Q03210	505 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	UFO1	Q04511	668 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	OPI10	Q08202	246 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	APL4	Q12028	832 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	PER33	Q12144	273 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	PEX11	Q12462	236 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	AFI1	Q99222	893 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	SEC63	P14906	663 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	MRPL8	P22353	238 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	KAR9	P32526	644 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	APM3	P38153	483 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	AIM18	P38884	321 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	FAA3	P39002	694 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	SER33	P40510	469 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	RRN7	P40992	514 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	RRT5	P43607	289 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	RFX1	P48743	811 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	KAP114	P53067	1004 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	YGR127W	P53275	312 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	PRM1	P53835	661 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	AQR1	P53943	586 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	ORC3	P54790	616 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	PIR1	Q03178	341 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	SOV1	Q04748	898 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	THI7	Q05998	598 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	SFI1	Q12369	946 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MRPL39	YML009C	ERG11	P10614	530 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL39	YML009C	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MRPL39	YML009C	SLY1	P22213	666 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL39	YML009C	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MRPL39	YML009C	RAD57	P25301	460 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL39	YML009C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MRPL39	YML009C	RML2	P32611	393 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL39	YML009C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MRPL39	YML009C	PCA1	P38360	1216 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL39	YML009C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MRPL39	YML009C	TCD1	P38756	429 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL39	YML009C	KTR7	P40504	517 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL39	YML009C	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MRPL39	YML009C	OSW7	P43611	510 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MRPL39	YML009C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MRPL39	YML009C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MRPL39	YML009C	BRO1	P48582	844 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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