RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W TVP38P36164 337 aa2.5□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W BRN1P38170 754 aa2.5□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W YHL026CP38740 315 aa2.5□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W SFB3P38810 929 aa2.5□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W DAS1P47005 663 aa2.5□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W AMA1P50082 593 aa2.5□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W UBA2P52488 636 aa2.5□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W TAD1P53065 400 aa2.5□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W RPS15Q01855 142 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W ADY4Q05955 493 aa2.5□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W FRE5Q08908 694 aa2.5□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W TAH18Q12181 623 aa2.5□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W GPR1Q12361 961 aa2.5□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W RPS14AP06367 137 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W PEX2P32800 271 aa2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W SPC29P33419 253 aa2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W YBR053CP38235 358 aa2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W YNG2P38806 282 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W SET5P38890 526 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W RPS14BP39516 138 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W VHR1P40522 640 aa2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W HXT16P47185 567 aa2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W SPO1P53541 631 aa2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W TMN2Q04562 672 aa2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W POB3Q04636 552 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W YOR022CQ12204 715 aa2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W YBR182C-AQ8TGU6 64 aa2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W NCB2Q92317 146 aa2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W YLR415CO13578 112 aa2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W HOM2P13663 365 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W ANP1P32629 500 aa2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W YHL017WP38745 532 aa2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W YHR202WP38887 602 aa2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W GDH3P39708 457 aa2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W ECM1P39715 212 aa2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W PZF1P39933 429 aa2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W YEL025CP39991 1188 aa2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W HMF1P40037 129 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W ESL1P40456 1118 aa2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W PFA3P42836 336 aa2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W HSV2P50079 448 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W MLC1P53141 149 aa2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W LSB1P53281 241 aa2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W MRPS35P53292 345 aa2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W RPT6Q01939 405 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W LRS4Q04087 347 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W YDR514CQ04408 483 aa2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W MRI1Q06489 411 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W NSE1Q07913 336 aa2.49□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W MRN1Q08925 612 aaKnown RBP RIP-Chip data2.49□□□□□ -2.01not detected
SSQ1YLR369W LAA1P39526 2014 aa2.48□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W SGF29P25554 259 aa2.48□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W YCL002CP25565 263 aa2.48□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W UBP11P36026 717 aa2.48□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W YPT35P38815 214 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W RRP8P38961 392 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W SNM1P40993 198 aa2.48□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W FKH2P41813 862 aa2.48□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W STU2P46675 888 aa2.48□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W SSY5P47002 699 aa2.48□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W STB4P50104 949 aa2.48□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W MUP1P50276 574 aa2.48□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W TAM41P53230 385 aa2.48□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W GYL1Q04322 720 aa2.48□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W MYO5Q04439 1219 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W RSC3Q06639 885 aa2.48□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W ARP6Q12509 438 aa2.48□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W PCD1Q12524 340 aa2.48□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W PCK1P10963 549 aa2.47□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W LAT1P12695 482 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W MSH2P25847 964 aa2.47□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W DID4P36108 232 aa2.47□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W MNN1P39106 762 aa2.47□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W DSS1P39112 969 aa2.47□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W CSM2P40465 213 aa2.47□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W SDS3P40505 327 aa2.47□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W YJL163CP46996 555 aa2.47□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W TY4A-JP47023 414 aa2.47□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W ENP2P48234 707 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W ZIP2P53061 704 aa2.47□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W MDR1P53258 950 aa2.47□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W YNL134CP53912 376 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W MDM1Q01846 1127 aa2.47□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W NRG1Q03125 231 aa2.47□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W YHM2Q04013 314 aa2.47□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W PDR18P53756 1333 aa2.47□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W ADE2P21264 571 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W CSE2P33308 149 aa2.47□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W SPC42P36094 363 aa2.47□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W CCL1P37366 393 aa2.47□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W FMO1P38866 432 aa2.47□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W SAK1P38990 1142 aa2.47□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W YIL092WP40497 633 aa2.47□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W RLP7P40693 322 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W YNR061CP53747 219 aa2.47□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W LEE1Q02799 301 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W NTG2Q08214 380 aa2.47□□□□□ -2.01
SSQ1YLR369W DSE3Q08729 430 aa2.47□□□□□ -2.01
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