RNA–Protein interactions for RNA: YJL050W

MTR4, Transcript of ATP-dependent 3'-5' RNA helicase of the DExD/H family, yeast

Gene MTR4, Length 3,222 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTR4	YJL050W	RMT2	Q03305	412 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	RCF1	Q03713	159 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YDR222W	Q04925	415 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	SEC10	Q06245	871 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	CUR1	Q06469	252 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	FMP45	Q07651	309 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	PSR2	Q07949	397 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YRM1	Q12340	786 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	VPS3	P23643	1011 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	PTP2	P29461	750 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	RTG1	P32607	177 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	ECM31	P38122	312 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	SOL3	P38858	249 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	MEF2	P39677	819 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	MTW1	P39731	289 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	ADI1	Q03677	179 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	ATG29	Q12092	213 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	ACF2	Q12168	779 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	HRT3	Q12347	344 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	ENT1	Q12518	454 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	ARG82	P07250	355 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	TRK2	P28584	889 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	SMC1	P32908	1225 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	KRE29	P40026	464 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	ALG2	P43636	503 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	MUK1	Q02866	612 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	TVP15	Q03860	143 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	DYN3	Q04949	312 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	MDM36	Q06820	579 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	PEX15	Q08215	383 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	DSE3	Q08729	430 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	GTT2	Q12390	233 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	JIP3	O13555	125 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	TPK3	P05986	398 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	KAR4	P25583	335 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	PTC6	P25646	442 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	SRB2	P34162	210 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	LRG1	P35688	1017 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	MSR1	P38714	643 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	FAA2	P39518	744 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	TWF1	P53250	332 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	SDH1	Q00711	640 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	HER2	Q03557	464 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	ADY4	Q05955	493 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	RUP1	Q12242	671 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YDL206W	Q12424	762 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	OM45	P16547	393 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	UGA1	P17649	471 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	GPI10	P30777	616 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.56	□□□□□ -1.84	not detected
MTR4	YJL050W	HIS2	P38635	335 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YJL070C	P40361	888 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	CHS6	P40955	746 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	PHO86	P46956	311 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	CLD1	P53264	445 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YLR413W	Q06689	675 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	CDA1	Q06702	301 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	MED2	Q12124	431 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	NTO1	Q12311	748 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	STE2	D6VTK4	431 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	ATP12	P22135	325 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	POL4	P25615	582 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	THI4	P32318	326 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YRO2	P38079	344 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	BOL3	P39724	118 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	FRT2	P39734	528 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YMR134W	P40207	237 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	TOS3	P43637	560 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	GLO2	Q05584	274 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84

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