RNA–Protein interactions for RNA: YCL028W

RNQ1, Transcript of [PIN(+)] prion, yeast

Gene RNQ1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RNQ1	YCL028W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	SFB3	P38810	929 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	YEL028W	P39989	153 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	SCC4	P40090	624 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	MND2	P40577	368 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	RTT101	P47050	842 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	YJR079W	P47126	109 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	PIG1	Q06216	648 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.5	□□□□□ -0.57	not detected
RNQ1	YCL028W	YPQ1	Q12010	308 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	HMG2	P12684	1045 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	YME1	P32795	747 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	AIM26	P32858	118 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	YBP1	P38315	674 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	YJL132W	P47014	750 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	TCB2	P48231	1178 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	PCL10	P53124	433 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	PIR3	Q03180	325 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	YMR027W	Q04371	470 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	ATM1	P40416	690 aa		11.48	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	UFE1	P41834	346 aa		11.48	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	RTA1	P53047	317 aa		11.48	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	RNT1	Q02555	471 aa		11.48	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	GRX8	Q05926	109 aa		11.48	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	FRA1	Q07825	749 aa		11.48	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	AAD15	Q08361	143 aa		11.48	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	NRT1	Q08485	598 aa		11.48	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	PEX34	P25584	144 aa		11.47	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	SEC6	P32844	805 aa		11.47	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	PPE1	P38796	400 aa		11.47	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	PEX28	P38848	579 aa		11.47	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	SHR3	Q02774	210 aa		11.47	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	BSP1	Q06604	576 aa		11.47	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	IMA3	P0CW40	589 aa		11.46	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	IMA4	P0CW41	589 aa		11.46	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	HEM15	P16622	393 aa		11.46	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	COQ8	P27697	501 aa		11.46	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	SAF1	P38352	637 aa		11.46	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	SNG1	P46950	547 aa		11.46	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	URB2	P47108	1174 aa		11.46	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	MRX6	P48564	524 aa		11.46	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	COQ6	P53318	479 aa		11.46	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	DOS2	P54858	310 aa		11.46	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	MSH6	Q03834	1242 aa		11.46	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	SFH1	Q06168	426 aa		11.46	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	IMA2	Q08295	589 aa		11.46	□□□□□ -0.57
RNQ1	YCL028W	KAR4	P25583	335 aa		11.45	□□□□□ -0.58
RNQ1	YCL028W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
RNQ1	YCL028W	KTR4	P38131	464 aa		11.45	□□□□□ -0.58
RNQ1	YCL028W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
RNQ1	YCL028W	MOB1	P40484	314 aa		11.45	□□□□□ -0.58
RNQ1	YCL028W	BST1	P43571	1029 aa		11.45	□□□□□ -0.58
RNQ1	YCL028W	IML2	P47031	731 aa		11.45	□□□□□ -0.58
RNQ1	YCL028W	TAH11	P47112	604 aa		11.45	□□□□□ -0.58
RNQ1	YCL028W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
RNQ1	YCL028W	ZIP2	P53061	704 aa		11.45	□□□□□ -0.58
RNQ1	YCL028W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
RNQ1	YCL028W	YPR003C	P53394	754 aa		11.45	□□□□□ -0.58
RNQ1	YCL028W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.45	□□□□□ -0.58	not detected
RNQ1	YCL028W	INP2	Q03824	705 aa		11.45	□□□□□ -0.58
RNQ1	YCL028W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
RNQ1	YCL028W	MRPL25	P23369	157 aa		11.44	□□□□□ -0.58
RNQ1	YCL028W	UTR2	P32623	467 aa		11.44	□□□□□ -0.58
RNQ1	YCL028W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
RNQ1	YCL028W	FUI1	P38196	639 aa		11.44	□□□□□ -0.58
RNQ1	YCL028W	ATG12	P38316	186 aa		11.44	□□□□□ -0.58
RNQ1	YCL028W	YAT2	P40017	923 aa		11.44	□□□□□ -0.58
RNQ1	YCL028W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
RNQ1	YCL028W	SAE2	P46946	345 aa		11.44	□□□□□ -0.58
RNQ1	YCL028W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
RNQ1	YCL028W	ADI1	Q03677	179 aa		11.44	□□□□□ -0.58
RNQ1	YCL028W	USA1	Q03714	838 aa		11.44	□□□□□ -0.58
RNQ1	YCL028W	YMR160W	Q03823	816 aa		11.44	□□□□□ -0.58
RNQ1	YCL028W	ARP9	Q05123	467 aa		11.44	□□□□□ -0.58
RNQ1	YCL028W	SWC7	Q06707	132 aa		11.44	□□□□□ -0.58
RNQ1	YCL028W	YOR387C	Q08910	206 aa		11.44	□□□□□ -0.58
RNQ1	YCL028W	AFI1	Q99222	893 aa		11.44	□□□□□ -0.58
RNQ1	YCL028W	APE1	P14904	514 aa		11.43	□□□□□ -0.58
RNQ1	YCL028W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
RNQ1	YCL028W	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58

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