RNA–Protein interactions for RNA: YMR317W

YMR317W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR317W, Length 3,423 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR317WYMR317W NUP170P38181 1502 aa4.93□□□□□ -1.62
YMR317WYMR317W IRC20Q06554 1556 aa4.93□□□□□ -1.62
YMR317WYMR317W MET5P47169 1442 aa4.93□□□□□ -1.62
YMR317WYMR317W STH1P32597 1359 aa4.92□□□□□ -1.62
YMR317WYMR317W TRM732Q03496 1420 aa4.91□□□□□ -1.62
YMR317WYMR317W YRF1-1P0CX20 1796 aa4.9□□□□□ -1.62
YMR317WYMR317W YRF1-5P0CX21 1796 aa4.9□□□□□ -1.62
YMR317WYMR317W YRF1-8P0CX22 1796 aa4.9□□□□□ -1.62
YMR317WYMR317W GEA2P39993 1459 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
YMR317WYMR317W PDR12Q02785 1511 aa4.9□□□□□ -1.63
YMR317WYMR317W TAF7Q05021 590 aa4.9□□□□□ -1.63
YMR317WYMR317W YBT1P32386 1661 aa4.89□□□□□ -1.63
YMR317WYMR317W TY3B-GQ99315 1547 aa4.88□□□□□ -1.63
YMR317WYMR317W NUP159P40477 1460 aa4.87□□□□□ -1.63
YMR317WYMR317W GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
YMR317WYMR317W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
YMR317WYMR317W GDB1Q06625 1536 aa4.85□□□□□ -1.63
YMR317WYMR317W CAT8P39113 1433 aa4.85□□□□□ -1.63
YMR317WYMR317W PDR10P51533 1564 aa4.84□□□□□ -1.63
YMR317WYMR317W SPO14P36126 1683 aa4.84□□□□□ -1.63
YMR317WYMR317W AVT3P36062 692 aa4.84□□□□□ -1.63
YMR317WYMR317W VPS15P22219 1454 aa4.82□□□□□ -1.64
YMR317WYMR317W IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
YMR317WYMR317W LTE1P07866 1435 aa4.8□□□□□ -1.64
YMR317WYMR317W DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
YMR317WYMR317W ARO1P08566 1588 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
YMR317WYMR317W BUD3P25558 1636 aa4.79□□□□□ -1.64
YMR317WYMR317W SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
YMR317WYMR317W RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
YMR317WYMR317W DOP1Q03921 1698 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR317WYMR317W IQG1Q12280 1495 aa4.76□□□□□ -1.65
YMR317WYMR317W CHC1P22137 1653 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
YMR317WYMR317W TRM3Q07527 1436 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR317WYMR317W MET10P39692 1035 aa4.74□□□□□ -1.65
YMR317WYMR317W SEC7P11075 2009 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
YMR317WYMR317W BNI1P41832 1953 aa4.73□□□□□ -1.65
YMR317WYMR317W GCN2P15442 1659 aa4.73□□□□□ -1.65
YMR317WYMR317W SRB8P25648 1427 aa4.72□□□□□ -1.65
YMR317WYMR317W RTT106P40161 455 aa4.72□□□□□ -1.65
YMR317WYMR317W NUP157P40064 1391 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
YMR317WYMR317W YSP2Q06681 1438 aa4.71□□□□□ -1.66
YMR317WYMR317W MMS1Q06211 1407 aa4.7□□□□□ -1.66
YMR317WYMR317W SSM4P40318 1319 aa4.69□□□□□ -1.66
YMR317WYMR317W PDR5P33302 1511 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
YMR317WYMR317W IFH1P39520 1085 aa4.69□□□□□ -1.66
YMR317WYMR317W PRI1P10363 409 aa4.67□□□□□ -1.66
YMR317WYMR317W YOR093CQ12275 1648 aa4.67□□□□□ -1.66
YMR317WYMR317W DRS2P39524 1355 aa4.67□□□□□ -1.66
YMR317WYMR317W NOP2P40991 618 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
YMR317WYMR317W DNF2Q12675 1612 aa4.66□□□□□ -1.66
YMR317WYMR317W HAP1P0CE41 1502 aa4.65□□□□□ -1.67
YMR317WYMR317W NUP188P52593 1655 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
YMR317WYMR317W VMR1P38735 1592 aa4.62□□□□□ -1.67
YMR317WYMR317W BNR1P40450 1375 aa4.61□□□□□ -1.67
YMR317WYMR317W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data4.6□□□□□ -1.67not detected
YMR317WYMR317W FAP1P53971 965 aa4.59□□□□□ -1.68
YMR317WYMR317W IML1P47170 1584 aa4.57□□□□□ -1.68
YMR317WYMR317W ITT1Q04638 464 aa4.57□□□□□ -1.68
YMR317WYMR317W ISW2Q08773 1120 aa4.57□□□□□ -1.68
YMR317WYMR317W CKB1P43639 278 aa4.56□□□□□ -1.68
YMR317WYMR317W DNF3Q12674 1656 aa4.55□□□□□ -1.68
YMR317WYMR317W BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
YMR317WYMR317W TFA1P36100 482 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR317WYMR317W RPG1P38249 964 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
YMR317WYMR317W RAV1P47104 1357 aa4.53□□□□□ -1.68
YMR317WYMR317W NUP192P47054 1683 aa4.52□□□□□ -1.69
YMR317WYMR317W PDR11P40550 1411 aa4.51□□□□□ -1.69
YMR317WYMR317W TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
YMR317WYMR317W AAD16Q02895 342 aa4.5□□□□□ -1.69
YMR317WYMR317W RTC1Q08281 1341 aa4.49□□□□□ -1.69
YMR317WYMR317W URN1Q06525 465 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
YMR317WYMR317W TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
YMR317WYMR317W EBP2P36049 427 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
YMR317WYMR317W YAP3P38749 330 aa4.45□□□□□ -1.7
YMR317WYMR317W IPL1P38991 367 aa4.45□□□□□ -1.7
YMR317WYMR317W BCK1Q01389 1478 aa4.45□□□□□ -1.7
YMR317WYMR317W PAF1P38351 445 aa4.44□□□□□ -1.7
YMR317WYMR317W NOP7P53261 605 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
YMR317WYMR317W USO1P25386 1790 aa4.4□□□□□ -1.7
YMR317WYMR317W YCK3P39962 524 aa4.4□□□□□ -1.71
YMR317WYMR317W CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
YMR317WYMR317W YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
YMR317WYMR317W TYS1P36421 394 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
YMR317WYMR317W CAB3P36076 571 aa4.39□□□□□ -1.71
YMR317WYMR317W SCT1P32784 759 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR317WYMR317W ESL2P36168 1195 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR317WYMR317W POL5P39985 1022 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
YMR317WYMR317W MHP1P43638 1398 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR317WYMR317W MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
YMR317WYMR317W YPR148CQ06523 435 aa4.37□□□□□ -1.71
YMR317WYMR317W SEC3P33332 1336 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
YMR317WYMR317W SPT21P35209 758 aa4.36□□□□□ -1.71
YMR317WYMR317W MAK10Q02197 733 aa4.35□□□□□ -1.71
YMR317WYMR317W ALD4P46367 519 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
YMR317WYMR317W PRY3P47033 881 aa4.34□□□□□ -1.72
YMR317WYMR317W ABP1P15891 592 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
YMR317WYMR317W RAD9P14737 1309 aa4.33□□□□□ -1.72
YMR317WYMR317W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
YMR317WYMR317W RPL17AP05740 184 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
YMR317WYMR317W RPL17BP46990 184 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 8.4 ms