RNA–Protein interactions for RNA: YMR196W

YMR196W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR196W, Length 3,267 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR196WYMR196W PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
YMR196WYMR196W MTC1P47018 478 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
YMR196WYMR196W SNT2P53127 1403 aa6.98□□□□□ -1.29
YMR196WYMR196W NTE1Q04958 1679 aa6.97□□□□□ -1.29
YMR196WYMR196W TRM732Q03496 1420 aa6.96□□□□□ -1.29
YMR196WYMR196W RPO21P04050 1733 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
YMR196WYMR196W TFA1P36100 482 aa6.93□□□□□ -1.3
YMR196WYMR196W GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
YMR196WYMR196W TY3B-GQ99315 1547 aa6.91□□□□□ -1.3
YMR196WYMR196W IRC20Q06554 1556 aa6.9□□□□□ -1.31
YMR196WYMR196W NUP159P40477 1460 aa6.9□□□□□ -1.31
YMR196WYMR196W NUP170P38181 1502 aa6.89□□□□□ -1.31
YMR196WYMR196W YRF1-1P0CX20 1796 aa6.89□□□□□ -1.31
YMR196WYMR196W YRF1-5P0CX21 1796 aa6.89□□□□□ -1.31
YMR196WYMR196W YRF1-8P0CX22 1796 aa6.89□□□□□ -1.31
YMR196WYMR196W GEA2P39993 1459 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
YMR196WYMR196W MET5P47169 1442 aa6.88□□□□□ -1.31
YMR196WYMR196W IFH1P39520 1085 aa6.88□□□□□ -1.31
YMR196WYMR196W IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
YMR196WYMR196W YBT1P32386 1661 aa6.87□□□□□ -1.31
YMR196WYMR196W URN1Q06525 465 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
YMR196WYMR196W PDR12Q02785 1511 aa6.83□□□□□ -1.32
YMR196WYMR196W VPS15P22219 1454 aa6.83□□□□□ -1.32
YMR196WYMR196W SPO14P36126 1683 aa6.82□□□□□ -1.32
YMR196WYMR196W RTT106P40161 455 aa6.81□□□□□ -1.32
YMR196WYMR196W CAT8P39113 1433 aa6.8□□□□□ -1.32
YMR196WYMR196W GDB1Q06625 1536 aa6.8□□□□□ -1.32
YMR196WYMR196W SSM4P40318 1319 aa6.8□□□□□ -1.32
YMR196WYMR196W PDR10P51533 1564 aa6.79□□□□□ -1.32
YMR196WYMR196W MET10P39692 1035 aa6.77□□□□□ -1.33
YMR196WYMR196W ARO1P08566 1588 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
YMR196WYMR196W NUP157P40064 1391 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
YMR196WYMR196W LTE1P07866 1435 aa6.71□□□□□ -1.34
YMR196WYMR196W BUD3P25558 1636 aa6.7□□□□□ -1.34
YMR196WYMR196W SRB8P25648 1427 aa6.7□□□□□ -1.34
YMR196WYMR196W IQG1Q12280 1495 aa6.69□□□□□ -1.34
YMR196WYMR196W YSP2Q06681 1438 aa6.69□□□□□ -1.34
YMR196WYMR196W SEC7P11075 2009 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
YMR196WYMR196W CKB1P43639 278 aa6.66□□□□□ -1.34
YMR196WYMR196W BNI1P41832 1953 aa6.64□□□□□ -1.35
YMR196WYMR196W DOP1Q03921 1698 aa6.62□□□□□ -1.35
YMR196WYMR196W GCN2P15442 1659 aa6.62□□□□□ -1.35
YMR196WYMR196W MMS1Q06211 1407 aa6.61□□□□□ -1.35
YMR196WYMR196W CHC1P22137 1653 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
YMR196WYMR196W DRS2P39524 1355 aa6.6□□□□□ -1.35
YMR196WYMR196W TRM3Q07527 1436 aa6.6□□□□□ -1.35
YMR196WYMR196W BNR1P40450 1375 aa6.58□□□□□ -1.36
YMR196WYMR196W ITT1Q04638 464 aa6.57□□□□□ -1.36
YMR196WYMR196W BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
YMR196WYMR196W YOR093CQ12275 1648 aa6.55□□□□□ -1.36
YMR196WYMR196W PDR5P33302 1511 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
YMR196WYMR196W VMR1P38735 1592 aa6.52□□□□□ -1.37
YMR196WYMR196W NUP188P52593 1655 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
YMR196WYMR196W DNF2Q12675 1612 aa6.48□□□□□ -1.37
YMR196WYMR196W PDR11P40550 1411 aa6.48□□□□□ -1.37
YMR196WYMR196W IML1P47170 1584 aa6.46□□□□□ -1.38
YMR196WYMR196W RAV1P47104 1357 aa6.43□□□□□ -1.38
YMR196WYMR196W SIS2P36024 562 aa6.42□□□□□ -1.38
YMR196WYMR196W NOP7P53261 605 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
YMR196WYMR196W PAF1P38351 445 aa6.4□□□□□ -1.38
YMR196WYMR196W NUP192P47054 1683 aa6.4□□□□□ -1.39
YMR196WYMR196W RTC1Q08281 1341 aa6.39□□□□□ -1.39
YMR196WYMR196W IPL1P38991 367 aa6.38□□□□□ -1.39
YMR196WYMR196W TYS1P36421 394 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
YMR196WYMR196W POL5P39985 1022 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
YMR196WYMR196W YAP3P38749 330 aa6.36□□□□□ -1.39
YMR196WYMR196W TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
YMR196WYMR196W HAP1P0CE41 1502 aa6.36□□□□□ -1.39
YMR196WYMR196W DNF3Q12674 1656 aa6.36□□□□□ -1.39
YMR196WYMR196W EBP2P36049 427 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
YMR196WYMR196W NAP1P25293 417 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
YMR196WYMR196W YRB30P53107 440 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
YMR196WYMR196W TAF5P38129 798 aa6.3□□□□□ -1.4
YMR196WYMR196W YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
YMR196WYMR196W IOC4Q04213 475 aa6.29□□□□□ -1.4
YMR196WYMR196W BCK1Q01389 1478 aa6.29□□□□□ -1.4
YMR196WYMR196W ESL2P36168 1195 aa6.28□□□□□ -1.4
YMR196WYMR196W YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
YMR196WYMR196W LEO1P38439 464 aa6.27□□□□□ -1.41
YMR196WYMR196W RAD9P14737 1309 aa6.27□□□□□ -1.41
YMR196WYMR196W ORC1P54784 914 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
YMR196WYMR196W ABP1P15891 592 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
YMR196WYMR196W CAB3P36076 571 aa6.26□□□□□ -1.41
YMR196WYMR196W MHP1P43638 1398 aa6.26□□□□□ -1.41
YMR196WYMR196W ALD4P46367 519 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
YMR196WYMR196W KIP3P53086 805 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
YMR196WYMR196W MAK10Q02197 733 aa6.23□□□□□ -1.41
YMR196WYMR196W CAB1Q04430 367 aa6.23□□□□□ -1.41
YMR196WYMR196W SEC3P33332 1336 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
YMR196WYMR196W SPT7P35177 1332 aa6.22□□□□□ -1.41
YMR196WYMR196W SPE2P21182 396 aa6.22□□□□□ -1.41
YMR196WYMR196W KRE5P22023 1365 aa6.22□□□□□ -1.41
YMR196WYMR196W TAF8Q03750 510 aa6.21□□□□□ -1.41
YMR196WYMR196W CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.41
YMR196WYMR196W USO1P25386 1790 aa6.21□□□□□ -1.42
YMR196WYMR196W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data6.2□□□□□ -1.42not detected
YMR196WYMR196W DMA1P38823 416 aa6.2□□□□□ -1.42
YMR196WYMR196W MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
YMR196WYMR196W TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
YMR196WYMR196W PSD2P53037 1138 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.7 ms