RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A YDR344CQ05510 147 aa8.5□□□□□ -1.05
YMR001C-AYMR001C-A HTA1P04911 132 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
YMR001C-AYMR001C-A HTA2P04912 132 aa8.46□□□□□ -1.06
YMR001C-AYMR001C-A YEL023CP39992 682 aa8.46□□□□□ -1.06
YMR001C-AYMR001C-A PTC4P38089 393 aa8.45□□□□□ -1.06
YMR001C-AYMR001C-A ABP1P15891 592 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
YMR001C-AYMR001C-A VRP1P37370 817 aa8.37□□□□□ -1.07
YMR001C-AYMR001C-A XDJ1P39102 459 aa8.35□□□□□ -1.07
YMR001C-AYMR001C-A PML39Q03760 334 aa8.32□□□□□ -1.08
YMR001C-AYMR001C-A ELP4Q02884 456 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
YMR001C-AYMR001C-A GRE2Q12068 342 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
YMR001C-AYMR001C-A MID1P41821 548 aa8.23□□□□□ -1.09
YMR001C-AYMR001C-A DPS1P04802 557 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
YMR001C-AYMR001C-A NST1P53935 1240 aa8.22□□□□□ -1.09
YMR001C-AYMR001C-A RAM2P29703 316 aa8.2□□□□□ -1.1
YMR001C-AYMR001C-A EDS1P38073 919 aa8.2□□□□□ -1.1
YMR001C-AYMR001C-A ARH1P48360 493 aa8.19□□□□□ -1.1
YMR001C-AYMR001C-A MIF2P35201 549 aa8.16□□□□□ -1.1
YMR001C-AYMR001C-A SOL3P38858 249 aa8.16□□□□□ -1.1
YMR001C-AYMR001C-A PTC3P34221 468 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
YMR001C-AYMR001C-A GUT1P32190 709 aa8.14□□□□□ -1.11
YMR001C-AYMR001C-A ATH1P48016 1211 aa8.13□□□□□ -1.11
YMR001C-AYMR001C-A SRC1Q03707 834 aa8.13□□□□□ -1.11
YMR001C-AYMR001C-A MAK11P20484 414 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
YMR001C-AYMR001C-A ILV3P39522 585 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
YMR001C-AYMR001C-A RGA2Q06407 1009 aa8.09□□□□□ -1.11
YMR001C-AYMR001C-A SPT23P35210 1082 aa8.08□□□□□ -1.12
YMR001C-AYMR001C-A PEX29Q03370 554 aa8.05□□□□□ -1.12
YMR001C-AYMR001C-A MPH3P0CE00 602 aa8.04□□□□□ -1.12
YMR001C-AYMR001C-A COQ8P27697 501 aa8.03□□□□□ -1.12
YMR001C-AYMR001C-A AI4P03878 556 aa8.01□□□□□ -1.13
YMR001C-AYMR001C-A HAP5Q02516 242 aa8.01□□□□□ -1.13
YMR001C-AYMR001C-A BNI4P53858 892 aa7.97□□□□□ -1.13
YMR001C-AYMR001C-A YML082WQ04533 649 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
YMR001C-AYMR001C-A MPC54Q08550 464 aa7.95□□□□□ -1.14
YMR001C-AYMR001C-A RGA1P39083 1007 aa7.94□□□□□ -1.14
YMR001C-AYMR001C-A RAS1P01119 309 aa7.92□□□□□ -1.14
YMR001C-AYMR001C-A PTC2P39966 464 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
YMR001C-AYMR001C-A YGR273CP53329 174 aa7.89□□□□□ -1.15
YMR001C-AYMR001C-A NMA111P53920 997 aa7.89□□□□□ -1.15
YMR001C-AYMR001C-A YPR015CQ12531 247 aa7.88□□□□□ -1.15
YMR001C-AYMR001C-A SLI15P38283 698 aa7.85□□□□□ -1.15
YMR001C-AYMR001C-A RAM1P22007 431 aa7.81□□□□□ -1.16
YMR001C-AYMR001C-A NOP53Q12080 455 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
YMR001C-AYMR001C-A DPL1Q05567 589 aa7.79□□□□□ -1.16
YMR001C-AYMR001C-A SET1P38827 1080 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
YMR001C-AYMR001C-A SDH2P21801 266 aa7.72□□□□□ -1.17
YMR001C-AYMR001C-A CDC73Q06697 393 aa7.7□□□□□ -1.18
YMR001C-AYMR001C-A AMS1P22855 1083 aa7.69□□□□□ -1.18
YMR001C-AYMR001C-A ISU2Q12056 156 aa7.69□□□□□ -1.18
YMR001C-AYMR001C-A KEX1P09620 729 aa7.68□□□□□ -1.18
YMR001C-AYMR001C-A PDR1P12383 1068 aa7.68□□□□□ -1.18
YMR001C-AYMR001C-A TRK1P12685 1235 aa7.67□□□□□ -1.18
YMR001C-AYMR001C-A GYP1Q08484 637 aa7.66□□□□□ -1.18
YMR001C-AYMR001C-A VHR2P40041 505 aa7.63□□□□□ -1.19
YMR001C-AYMR001C-A UBP14P38237 781 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
YMR001C-AYMR001C-A YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
YMR001C-AYMR001C-A PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data7.56□□□□□ -1.2not detected
YMR001C-AYMR001C-A SAS4Q04003 481 aa7.54□□□□□ -1.2
YMR001C-AYMR001C-A RAD54P32863 898 aa7.52□□□□□ -1.21
YMR001C-AYMR001C-A YDR090CQ03193 310 aa7.51□□□□□ -1.21
YMR001C-AYMR001C-A IFH1P39520 1085 aa7.5□□□□□ -1.21
YMR001C-AYMR001C-A YPL062WQ02781 134 aa7.5□□□□□ -1.21
YMR001C-AYMR001C-A YPR148CQ06523 435 aa7.49□□□□□ -1.21
YMR001C-AYMR001C-A BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
YMR001C-AYMR001C-A VPS70P47161 811 aa7.48□□□□□ -1.21
YMR001C-AYMR001C-A YEL077CQ3E7X8 1277 aa7.46□□□□□ -1.22
YMR001C-AYMR001C-A REF2P42073 533 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
YMR001C-AYMR001C-A KIC1P38692 1080 aa7.43□□□□□ -1.22
YMR001C-AYMR001C-A AIR1P40507 360 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
YMR001C-AYMR001C-A CLA4P48562 842 aa7.43□□□□□ -1.22
YMR001C-AYMR001C-A STR2P47164 639 aa7.42□□□□□ -1.22
YMR001C-AYMR001C-A PRT1P06103 763 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
YMR001C-AYMR001C-A ISM1P48526 1002 aa7.4□□□□□ -1.22
YMR001C-AYMR001C-A YRR1Q12172 810 aa7.4□□□□□ -1.22
YMR001C-AYMR001C-A MRF1P30775 413 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
YMR001C-AYMR001C-A CST6P40535 587 aa7.39□□□□□ -1.23
YMR001C-AYMR001C-A RPP1BP10622 106 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
YMR001C-AYMR001C-A BRE2P43132 505 aa7.36□□□□□ -1.23
YMR001C-AYMR001C-A GAP1P19145 602 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
YMR001C-AYMR001C-A DMA1P38823 416 aa7.34□□□□□ -1.23
YMR001C-AYMR001C-A PEX21P50091 288 aa7.34□□□□□ -1.23
YMR001C-AYMR001C-A COX6P00427 148 aa7.33□□□□□ -1.24
YMR001C-AYMR001C-A GAR1P28007 205 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
YMR001C-AYMR001C-A ORC6P38826 435 aa7.32□□□□□ -1.24
YMR001C-AYMR001C-A ERG12P07277 443 aa7.31□□□□□ -1.24
YMR001C-AYMR001C-A NUD1P32336 851 aa7.31□□□□□ -1.24
YMR001C-AYMR001C-A CSC1Q06538 782 aa7.31□□□□□ -1.24
YMR001C-AYMR001C-A TUM1Q08686 304 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
YMR001C-AYMR001C-A TY1A-DR4O74302 440 aa7.3□□□□□ -1.24
YMR001C-AYMR001C-A TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
YMR001C-AYMR001C-A TY1A-AP0CX57 440 aa7.3□□□□□ -1.24
YMR001C-AYMR001C-A TY1A-PR1P0CX58 440 aa7.3□□□□□ -1.24
YMR001C-AYMR001C-A TY1A-ORP0CX59 440 aa7.3□□□□□ -1.24
YMR001C-AYMR001C-A TY1A-PR2P0CX60 440 aa7.3□□□□□ -1.24
YMR001C-AYMR001C-A TY1A-DR5P0CX65 440 aa7.3□□□□□ -1.24
YMR001C-AYMR001C-A TY1A-ER2P0CX66 440 aa7.3□□□□□ -1.24
YMR001C-AYMR001C-A TY1A-GR3P0CX67 440 aa7.3□□□□□ -1.24
YMR001C-AYMR001C-A TY1A-LR1P0CX68 440 aa7.3□□□□□ -1.24
YMR001C-AYMR001C-A TY1A-MR2P0CX69 440 aa7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.3 ms