RNA–Protein interactions for RNA: YBL008W-A

YBL008W-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YBL008W-A, Length 240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL008W-AYBL008W-A HTA2P04912 132 aa7.85□□□□□ -1.15
YBL008W-AYBL008W-A RTG3P38165 486 aa7.83□□□□□ -1.16
YBL008W-AYBL008W-A YEL023CP39992 682 aa7.83□□□□□ -1.16
YBL008W-AYBL008W-A YDR344CQ05510 147 aa7.83□□□□□ -1.16
YBL008W-AYBL008W-A DCW1P36091 449 aa7.81□□□□□ -1.16
YBL008W-AYBL008W-A ELP4Q02884 456 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
YBL008W-AYBL008W-A SRC1Q03707 834 aa7.76□□□□□ -1.17
YBL008W-AYBL008W-A PML39Q03760 334 aa7.72□□□□□ -1.17
YBL008W-AYBL008W-A CST9Q06032 482 aa7.68□□□□□ -1.18
YBL008W-AYBL008W-A ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data7.65□□□□□ -1.18not detected
YBL008W-AYBL008W-A RCR1P38212 213 aa7.64□□□□□ -1.19
YBL008W-AYBL008W-A ARH1P48360 493 aa7.64□□□□□ -1.19
YBL008W-AYBL008W-A SPT23P35210 1082 aa7.57□□□□□ -1.2
YBL008W-AYBL008W-A SSP1P38871 571 aa7.55□□□□□ -1.2
YBL008W-AYBL008W-A MGA2P40578 1113 aa7.54□□□□□ -1.2
YBL008W-AYBL008W-A MID1P41821 548 aa7.54□□□□□ -1.2
YBL008W-AYBL008W-A GRE2Q12068 342 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
YBL008W-AYBL008W-A PEX29Q03370 554 aa7.46□□□□□ -1.22
YBL008W-AYBL008W-A HAP5Q02516 242 aa7.44□□□□□ -1.22
YBL008W-AYBL008W-A YML082WQ04533 649 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
YBL008W-AYBL008W-A RAS1P01119 309 aa7.42□□□□□ -1.22
YBL008W-AYBL008W-A BNI4P53858 892 aa7.42□□□□□ -1.22
YBL008W-AYBL008W-A NST1P53935 1240 aa7.42□□□□□ -1.22
YBL008W-AYBL008W-A ATH1P48016 1211 aa7.41□□□□□ -1.22
YBL008W-AYBL008W-A GUT1P32190 709 aa7.4□□□□□ -1.22
YBL008W-AYBL008W-A PTC2P39966 464 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
YBL008W-AYBL008W-A TFA1P36100 482 aa7.35□□□□□ -1.23
YBL008W-AYBL008W-A MPH3P0CE00 602 aa7.32□□□□□ -1.24
YBL008W-AYBL008W-A PTC3P34221 468 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
YBL008W-AYBL008W-A MIF2P35201 549 aa7.32□□□□□ -1.24
YBL008W-AYBL008W-A SOL3P38858 249 aa7.32□□□□□ -1.24
YBL008W-AYBL008W-A AI4P03878 556 aa7.31□□□□□ -1.24
YBL008W-AYBL008W-A TRK1P12685 1235 aa7.31□□□□□ -1.24
YBL008W-AYBL008W-A EDS1P38073 919 aa7.28□□□□□ -1.24
YBL008W-AYBL008W-A YPL062WQ02781 134 aa7.28□□□□□ -1.24
YBL008W-AYBL008W-A ILV3P39522 585 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
YBL008W-AYBL008W-A MPC54Q08550 464 aa7.27□□□□□ -1.25
YBL008W-AYBL008W-A NMA111P53920 997 aa7.23□□□□□ -1.25
YBL008W-AYBL008W-A AMS1P22855 1083 aa7.22□□□□□ -1.25
YBL008W-AYBL008W-A YPR015CQ12531 247 aa7.2□□□□□ -1.26
YBL008W-AYBL008W-A MAK11P20484 414 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
YBL008W-AYBL008W-A RAM1P22007 431 aa7.13□□□□□ -1.27
YBL008W-AYBL008W-A GYP1Q08484 637 aa7.13□□□□□ -1.27
YBL008W-AYBL008W-A DPL1Q05567 589 aa7.12□□□□□ -1.27
YBL008W-AYBL008W-A COQ8P27697 501 aa7.09□□□□□ -1.27
YBL008W-AYBL008W-A SLI15P38283 698 aa7.09□□□□□ -1.27
YBL008W-AYBL008W-A YGR273CP53329 174 aa7.08□□□□□ -1.28
YBL008W-AYBL008W-A SDH2P21801 266 aa7.07□□□□□ -1.28
YBL008W-AYBL008W-A RAM2P29703 316 aa7.07□□□□□ -1.28
YBL008W-AYBL008W-A SAS4Q04003 481 aa7.02□□□□□ -1.29
YBL008W-AYBL008W-A ISU2Q12056 156 aa7.02□□□□□ -1.29
YBL008W-AYBL008W-A YEL077CQ3E7X8 1277 aa7.01□□□□□ -1.29
YBL008W-AYBL008W-A GAR1P28007 205 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
YBL008W-AYBL008W-A GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data6.99□□□□□ -1.29not detected
YBL008W-AYBL008W-A BRE2P43132 505 aa6.96□□□□□ -1.3
YBL008W-AYBL008W-A PDR1P12383 1068 aa6.94□□□□□ -1.3
YBL008W-AYBL008W-A GCR2Q01722 534 aa6.91□□□□□ -1.3
YBL008W-AYBL008W-A CDC73Q06697 393 aa6.9□□□□□ -1.3
YBL008W-AYBL008W-A NOP53Q12080 455 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
YBL008W-AYBL008W-A MRF1P30775 413 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
YBL008W-AYBL008W-A AIR1P40507 360 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
YBL008W-AYBL008W-A KEX1P09620 729 aa6.84□□□□□ -1.31
YBL008W-AYBL008W-A CLA4P48562 842 aa6.8□□□□□ -1.32
YBL008W-AYBL008W-A MET22P32179 357 aa6.78□□□□□ -1.32
YBL008W-AYBL008W-A BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
YBL008W-AYBL008W-A ERG12P07277 443 aa6.77□□□□□ -1.33
YBL008W-AYBL008W-A PRT1P06103 763 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
YBL008W-AYBL008W-A CST6P40535 587 aa6.75□□□□□ -1.33
YBL008W-AYBL008W-A ENV9Q08651 330 aa6.74□□□□□ -1.33
YBL008W-AYBL008W-A LAM6Q08001 693 aa6.69□□□□□ -1.34
YBL008W-AYBL008W-A CDC4P07834 779 aa6.68□□□□□ -1.34
YBL008W-AYBL008W-A YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
YBL008W-AYBL008W-A STR2P47164 639 aa6.67□□□□□ -1.34
YBL008W-AYBL008W-A RPP1BP10622 106 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
YBL008W-AYBL008W-A YDR444WQ04093 687 aa6.66□□□□□ -1.34
YBL008W-AYBL008W-A UBP14P38237 781 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
YBL008W-AYBL008W-A PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data6.64□□□□□ -1.35not detected
YBL008W-AYBL008W-A ISM1P48526 1002 aa6.64□□□□□ -1.35
YBL008W-AYBL008W-A YRR1Q12172 810 aa6.63□□□□□ -1.35
YBL008W-AYBL008W-A YDL176WQ12027 708 aa6.62□□□□□ -1.35
YBL008W-AYBL008W-A VHR2P40041 505 aa6.61□□□□□ -1.35
YBL008W-AYBL008W-A FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
YBL008W-AYBL008W-A RAD54P32863 898 aa6.6□□□□□ -1.35
YBL008W-AYBL008W-A MTC5Q03897 1148 aa6.58□□□□□ -1.36
YBL008W-AYBL008W-A NUD1P32336 851 aa6.57□□□□□ -1.36
YBL008W-AYBL008W-A SPT16P32558 1035 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
YBL008W-AYBL008W-A PEX21P50091 288 aa6.57□□□□□ -1.36
YBL008W-AYBL008W-A LCB5Q06147 687 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
YBL008W-AYBL008W-A BDP1P46678 594 aa6.55□□□□□ -1.36
YBL008W-AYBL008W-A HED1Q03937 162 aa6.54□□□□□ -1.36
YBL008W-AYBL008W-A TY1A-DR4O74302 440 aa6.52□□□□□ -1.37
YBL008W-AYBL008W-A TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
YBL008W-AYBL008W-A TY1A-AP0CX57 440 aa6.52□□□□□ -1.37
YBL008W-AYBL008W-A TY1A-PR1P0CX58 440 aa6.52□□□□□ -1.37
YBL008W-AYBL008W-A TY1A-ORP0CX59 440 aa6.52□□□□□ -1.37
YBL008W-AYBL008W-A TY1A-PR2P0CX60 440 aa6.52□□□□□ -1.37
YBL008W-AYBL008W-A TY1A-DR5P0CX65 440 aa6.52□□□□□ -1.37
YBL008W-AYBL008W-A TY1A-ER2P0CX66 440 aa6.52□□□□□ -1.37
YBL008W-AYBL008W-A TY1A-GR3P0CX67 440 aa6.52□□□□□ -1.37
YBL008W-AYBL008W-A TY1A-LR1P0CX68 440 aa6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 68.2 ms