RNA–Protein interactions for RNA: YAL056C-A

YAL056C-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YAL056C-A, Length 351 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YAL056C-AYAL056C-A MMS22Q06164 1454 aa9.13□□□□□ -0.95
YAL056C-AYAL056C-A DRS2P39524 1355 aa9.12□□□□□ -0.95
YAL056C-AYAL056C-A TRM732Q03496 1420 aa9.12□□□□□ -0.95
YAL056C-AYAL056C-A DNF2Q12675 1612 aa9.12□□□□□ -0.95
YAL056C-AYAL056C-A VPS15P22219 1454 aa9.1□□□□□ -0.95
YAL056C-AYAL056C-A TOP2P06786 1428 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
YAL056C-AYAL056C-A NUP159P40477 1460 aa9.08□□□□□ -0.96
YAL056C-AYAL056C-A TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
YAL056C-AYAL056C-A TY1B-ER2Q03619 1755 aa9.05□□□□□ -0.96
YAL056C-AYAL056C-A TY1B-MR1Q04214 1755 aa9.05□□□□□ -0.96
YAL056C-AYAL056C-A TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
YAL056C-AYAL056C-A TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
YAL056C-AYAL056C-A TY1B-NL1Q12112 1755 aa9.05□□□□□ -0.96
YAL056C-AYAL056C-A TY1B-GR1Q12141 1755 aa9.05□□□□□ -0.96
YAL056C-AYAL056C-A TY1B-BLQ12490 1755 aa9.05□□□□□ -0.96
YAL056C-AYAL056C-A NTE1Q04958 1679 aa9.05□□□□□ -0.96
YAL056C-AYAL056C-A RPO21P04050 1733 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
YAL056C-AYAL056C-A YOR093CQ12275 1648 aa8.95□□□□□ -0.98
YAL056C-AYAL056C-A SPP41P38904 1435 aa8.95□□□□□ -0.98
YAL056C-AYAL056C-A DOP1Q03921 1698 aa8.94□□□□□ -0.98
YAL056C-AYAL056C-A NUP170P38181 1502 aa8.93□□□□□ -0.98
YAL056C-AYAL056C-A VTH1P40438 1549 aa8.9□□□□□ -0.98
YAL056C-AYAL056C-A VTH2P40890 1549 aa8.9□□□□□ -0.98
YAL056C-AYAL056C-A SPO14P36126 1683 aa8.89□□□□□ -0.99
YAL056C-AYAL056C-A POL1P13382 1468 aa8.87□□□□□ -0.99
YAL056C-AYAL056C-A TSC11P40061 1430 aa8.87□□□□□ -0.99
YAL056C-AYAL056C-A SMC4Q12267 1418 aa8.87□□□□□ -0.99
YAL056C-AYAL056C-A YOR1P53049 1477 aa8.86□□□□□ -0.99
YAL056C-AYAL056C-A STU1P38198 1513 aa8.84□□□□□ -0.99
YAL056C-AYAL056C-A ULS1Q08562 1619 aa8.83□□□□□ -1
YAL056C-AYAL056C-A CDC27P38042 758 aa8.78□□□□□ -1
YAL056C-AYAL056C-A UBP10P53874 792 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
YAL056C-AYAL056C-A SNT2P53127 1403 aa8.77□□□□□ -1.01
YAL056C-AYAL056C-A SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
YAL056C-AYAL056C-A MYO4P32492 1471 aa8.75□□□□□ -1.01
YAL056C-AYAL056C-A UBP9P39967 754 aa8.73□□□□□ -1.01
YAL056C-AYAL056C-A MAP2P38174 421 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
YAL056C-AYAL056C-A MET10P39692 1035 aa8.7□□□□□ -1.02
YAL056C-AYAL056C-A PDR10P51533 1564 aa8.68□□□□□ -1.02
YAL056C-AYAL056C-A DNF3Q12674 1656 aa8.65□□□□□ -1.03
YAL056C-AYAL056C-A PDR12Q02785 1511 aa8.64□□□□□ -1.03
YAL056C-AYAL056C-A IQG1Q12280 1495 aa8.64□□□□□ -1.03
YAL056C-AYAL056C-A TRM3Q07527 1436 aa8.63□□□□□ -1.03
YAL056C-AYAL056C-A PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
YAL056C-AYAL056C-A GDB1Q06625 1536 aa8.63□□□□□ -1.03
YAL056C-AYAL056C-A ARO1P08566 1588 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
YAL056C-AYAL056C-A CHC1P22137 1653 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
YAL056C-AYAL056C-A NUP157P40064 1391 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
YAL056C-AYAL056C-A RTT106P40161 455 aa8.57□□□□□ -1.04
YAL056C-AYAL056C-A YTA7P40340 1379 aa8.57□□□□□ -1.04
YAL056C-AYAL056C-A MLP2P40457 1679 aa8.56□□□□□ -1.04
YAL056C-AYAL056C-A USO1P25386 1790 aa8.53□□□□□ -1.04
YAL056C-AYAL056C-A STH1P32597 1359 aa8.52□□□□□ -1.05
YAL056C-AYAL056C-A BUD3P25558 1636 aa8.51□□□□□ -1.05
YAL056C-AYAL056C-A DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
YAL056C-AYAL056C-A TGL3P40308 642 aa8.43□□□□□ -1.06
YAL056C-AYAL056C-A YSP2Q06681 1438 aa8.43□□□□□ -1.06
YAL056C-AYAL056C-A MAK10Q02197 733 aa8.41□□□□□ -1.06
YAL056C-AYAL056C-A YAP3P38749 330 aa8.4□□□□□ -1.06
YAL056C-AYAL056C-A TY3B-GQ99315 1547 aa8.39□□□□□ -1.07
YAL056C-AYAL056C-A SEC7P11075 2009 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
YAL056C-AYAL056C-A REB1P21538 810 aa8.35□□□□□ -1.07
YAL056C-AYAL056C-A TIF4632P39936 914 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YAL056C-AYAL056C-A BNR1P40450 1375 aa8.33□□□□□ -1.08
YAL056C-AYAL056C-A THI12P42883 340 aa8.29□□□□□ -1.08
YAL056C-AYAL056C-A THI5P43534 340 aa8.29□□□□□ -1.08
YAL056C-AYAL056C-A THI11P47183 340 aa8.29□□□□□ -1.08
YAL056C-AYAL056C-A THI13Q07748 340 aa8.29□□□□□ -1.08
YAL056C-AYAL056C-A YBT1P32386 1661 aa8.27□□□□□ -1.09
YAL056C-AYAL056C-A RPL17AP05740 184 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
YAL056C-AYAL056C-A RPL17BP46990 184 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
YAL056C-AYAL056C-A GLN1P32288 370 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
YAL056C-AYAL056C-A YKR023WP36119 530 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
YAL056C-AYAL056C-A IFH1P39520 1085 aa8.24□□□□□ -1.09
YAL056C-AYAL056C-A IML1P47170 1584 aa8.22□□□□□ -1.09
YAL056C-AYAL056C-A CKB1P43639 278 aa8.21□□□□□ -1.1
YAL056C-AYAL056C-A SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
YAL056C-AYAL056C-A NUP188P52593 1655 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
YAL056C-AYAL056C-A TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
YAL056C-AYAL056C-A CAT8P39113 1433 aa8.15□□□□□ -1.1
YAL056C-AYAL056C-A YMR196WQ04336 1088 aa8.15□□□□□ -1.1
YAL056C-AYAL056C-A SLX5P32828 619 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
YAL056C-AYAL056C-A APP1P53933 587 aa8.14□□□□□ -1.11
YAL056C-AYAL056C-A HAP1P0CE41 1502 aa8.13□□□□□ -1.11
YAL056C-AYAL056C-A URN1Q06525 465 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
YAL056C-AYAL056C-A SCY1P53009 804 aa8.11□□□□□ -1.11
YAL056C-AYAL056C-A YAH1Q12184 172 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
YAL056C-AYAL056C-A VMR1P38735 1592 aa8.1□□□□□ -1.11
YAL056C-AYAL056C-A YIL055CP40523 627 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
YAL056C-AYAL056C-A GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
YAL056C-AYAL056C-A AVT3P36062 692 aa8.09□□□□□ -1.11
YAL056C-AYAL056C-A TYS1P36421 394 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
YAL056C-AYAL056C-A IPL1P38991 367 aa8.07□□□□□ -1.12
YAL056C-AYAL056C-A TFC8Q12308 588 aa8.05□□□□□ -1.12
YAL056C-AYAL056C-A DCD1P06773 312 aa8.03□□□□□ -1.12
YAL056C-AYAL056C-A TAF7Q05021 590 aa8.01□□□□□ -1.13
YAL056C-AYAL056C-A YBL029C-AQ3E756 94 aa8.01□□□□□ -1.13
YAL056C-AYAL056C-A HOP09932 586 aa7.99□□□□□ -1.13
YAL056C-AYAL056C-A YMR074CQ04773 145 aa7.96□□□□□ -1.14
YAL056C-AYAL056C-A PDR5P33302 1511 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 32.2 ms