RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616504.1

KCNQ1OT1_3.1-201, humanhuman

BASIC

Gene KCNQ1OT1_3, Length 116 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 CCDC61Q9Y6R9 512 aa11.44□□□□□ -0.58
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 FBXO3Q9UK99 471 aa11.42□□□□□ -0.58
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 MS4A3Q96HJ5 214 aa11.41□□□□□ -0.58
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 NUBP1P53384 320 aa11.38□□□□□ -0.59
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 KIF12Q96FN5 646 aa11.35□□□□□ -0.59
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 VASPP50552 380 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 MAP3K13O43283 966 aa11.31□□□□□ -0.6
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 TRPC6Q9Y210 931 aa11.27□□□□□ -0.61
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 FAM212AQ96EL1 285 aa11.26□□□□□ -0.61
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 KLHL34Q8N239 644 aa11.23□□□□□ -0.61
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 DCAF8Q5TAQ9 597 aa11.2□□□□□ -0.62
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa11.2□□□□□ -0.62
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 POTEB2H3BUK9 544 aa11.19□□□□□ -0.62
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 SGIP1Q9BQI5 828 aa11.17□□□□□ -0.62
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 METRNQ9UJH8 293 aa11.17□□□□□ -0.62
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 TIE1P35590 1138 aa11.16□□□□□ -0.62
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 IFNL1Q8IU54 200 aa11.16□□□□□ -0.62
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 PYGBP11216 843 aa11.15□□□□□ -0.62
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 SLC39A7Q92504 469 aa11.15□□□□□ -0.62
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 TTLL13PA6NNM8 815 aa11.13□□□□□ -0.63
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 C7P10643 843 aa11.13□□□□□ -0.63
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 GSE1Q14687 1217 aa11.08□□□□□ -0.64
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 OTUD5Q96G74 571 aa11.08□□□□□ -0.64
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 POTEFA5A3E0 1075 aa11.07□□□□□ -0.64
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 SPOCK2Q92563 424 aa11.06□□□□□ -0.64
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 TRIM35Q9UPQ4 493 aa11.06□□□□□ -0.64
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 POTEJP0CG39 1038 aa11.05□□□□□ -0.64
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 PCDHB8Q9UN66 801 aa11.05□□□□□ -0.64
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 TMEM106CQ9BVX2 250 aa11.04□□□□□ -0.64
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 SEC24BO95487 1268 aa10.96□□□□□ -0.65
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 IER5LQ5T953 404 aa10.96□□□□□ -0.65
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 POTEMA6NI47 508 aa10.94□□□□□ -0.66
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 MAMSTRQ6ZN01 415 aa10.91□□□□□ -0.66
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 POTEGQ6S5H5 508 aa10.88□□□□□ -0.67
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 SCUBE2Q9NQ36 999 aa10.88□□□□□ -0.67
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 PSEN1P49768 467 aa10.87□□□□□ -0.67
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 PLCG2P16885 1265 aa10.86□□□□□ -0.67
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 OCEL1Q9H607 264 aa10.82□□□□□ -0.68
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 GOLGA2Q08379 1002 aa10.79□□□□□ -0.68
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 TRIM41Q8WV44 630 aa10.79□□□□□ -0.68
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 CABP2Q9NPB3 220 aa10.75□□□□□ -0.69
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 PCDH10Q9P2E7 1040 aa10.74□□□□□ -0.69
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP10.73□□□□□ -0.69
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 SLAIN1Q8ND83 568 aa10.72□□□□□ -0.69
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 DPY19L2Q6NUT2 758 aa10.67□□□□□ -0.7
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 EFCAB3Q8N7B9 438 aa10.65□□□□□ -0.7
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 VGFO15240 615 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 C3orf67Q6ZVT6 689 aa10.6□□□□□ -0.71
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 PKD2Q13563 968 aa10.59□□□□□ -0.71
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 ST18O60284 1047 aa10.56□□□□□ -0.72
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 BOLA1Q9Y3E2 137 aa10.56□□□□□ -0.72
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 RGL2O15211 777 aa10.53□□□□□ -0.72
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 G3V3G9 751 aa10.52□□□□□ -0.73
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 SOX12O15370 315 aa10.52□□□□□ -0.73
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 PHF8Q9UPP1 1060 aa10.52□□□□□ -0.73
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 MS4A4AQ96JQ5 239 aa10.51□□□□□ -0.73
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 TAOK2Q9UL54 1235 aa10.5□□□□□ -0.73
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 STK24Q9Y6E0 443 aa10.5□□□□□ -0.73
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 SNPHO15079 494 aa10.49□□□□□ -0.73
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 STK25O00506 426 aa10.48□□□□□ -0.73
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 MICALL2Q8IY33 904 aa10.45□□□□□ -0.74
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 FBXO22Q8NEZ5 403 aa10.43□□□□□ -0.74
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 MARVELD3Q96A59 401 aa10.42□□□□□ -0.74
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 MFRPQ9BY79 579 aa10.42□□□□□ -0.74
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 NLRP6P59044 892 aa10.41□□□□□ -0.74
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 TMEM92Q6UXU6 159 aa10.41□□□□□ -0.74
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 CDAN1Q8IWY9 1227 aa10.4□□□□□ -0.74
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 EMP3P54852 163 aa10.33□□□□□ -0.76
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 DOK7Q18PE1 504 aa10.3□□□□□ -0.76
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 POTEB3A0JP26 581 aa10.29□□□□□ -0.76
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 POTEBQ6S5H4 581 aa10.29□□□□□ -0.76
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 ZNF710Q8N1W2 664 aa10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69 ms