RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516208.1

RNU6-1194P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1194, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1194P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1194P-201ENST00000516208 STAG3Q9UJ98 1225 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-1194P-201ENST00000516208 SLC39A7Q92504 469 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-1194P-201ENST00000516208 C7P10643 843 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1194P-201ENST00000516208 EHMT2Q96KQ7 1210 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1194P-201ENST00000516208 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1194P-201ENST00000516208 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1194P-201ENST00000516208 MAMSTRQ6ZN01 415 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1194P-201ENST00000516208 SCUBE2Q9NQ36 999 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1194P-201ENST00000516208 POTEFA5A3E0 1075 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-1194P-201ENST00000516208 SPDYE4A6NLX3 237 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-1194P-201ENST00000516208 CDAN1Q8IWY9 1227 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-1194P-201ENST00000516208 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
RNU6-1194P-201ENST00000516208 TRPC6Q9Y210 931 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-1194P-201ENST00000516208 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
RNU6-1194P-201ENST00000516208 CCDC61Q9Y6R9 512 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-1194P-201ENST00000516208 KIF12Q96FN5 646 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-1194P-201ENST00000516208 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
RNU6-1194P-201ENST00000516208 MAP3K13O43283 966 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-1194P-201ENST00000516208 SEC24BO95487 1268 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ST18O60284 1047 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-1194P-201ENST00000516208 TIE1P35590 1138 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-1194P-201ENST00000516208 TTLL13PA6NNM8 815 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1194P-201ENST00000516208 SLAIN1Q8ND83 568 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1194P-201ENST00000516208 MMRN1Q13201 1228 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1194P-201ENST00000516208 SPNS2Q8IVW8 549 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1194P-201ENST00000516208 RASEFQ8IZ41 740 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1194P-201ENST00000516208 TRIM35Q9UPQ4 493 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1194P-201ENST00000516208 IER5LQ5T953 404 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-1194P-201ENST00000516208 MARVELD3Q96A59 401 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-1194P-201ENST00000516208 MIER1Q8N108 512 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PLCG2P16885 1265 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1194P-201ENST00000516208 IFNL1Q8IU54 200 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1194P-201ENST00000516208 TMEM106CQ9BVX2 250 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PLEKHG5O94827 1062 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PROM2Q8N271 834 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1194P-201ENST00000516208 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1194P-201ENST00000516208 SGIP1Q9BQI5 828 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1194P-201ENST00000516208 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1194P-201ENST00000516208 SNPHO15079 494 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PLCD3Q8N3E9 789 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1194P-201ENST00000516208 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1194P-201ENST00000516208 POTEB3A0JP26 581 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1194P-201ENST00000516208 NUBP1P53384 320 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1194P-201ENST00000516208 EMP3P54852 163 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1194P-201ENST00000516208 POTEBQ6S5H4 581 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1194P-201ENST00000516208 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1194P-201ENST00000516208 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1194P-201ENST00000516208 OCEL1Q9H607 264 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1194P-201ENST00000516208 FAM205CA6NFA0 338 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1194P-201ENST00000516208 HS3ST6Q96QI5 342 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1194P-201ENST00000516208 FAM212AQ96EL1 285 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PYGBP11216 843 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1194P-201ENST00000516208 C3orf67Q6ZVT6 689 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PCDHB8Q9UN66 801 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1194P-201ENST00000516208 DCAF8Q5TAQ9 597 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1194P-201ENST00000516208 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1194P-201ENST00000516208 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1194P-201ENST00000516208 GOLGA2Q08379 1002 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1194P-201ENST00000516208 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1194P-201ENST00000516208 FKBP8Q14318 412 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1194P-201ENST00000516208 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1194P-201ENST00000516208 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1194P-201ENST00000516208 DPY19L2Q6NUT2 758 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ERBB3P21860 1342 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1194P-201ENST00000516208 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ZNF710Q8N1W2 664 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1194P-201ENST00000516208 MYT1LQ9UL68 1186 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1194P-201ENST00000516208 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PSEN1P49768 467 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-1194P-201ENST00000516208 G3V3G9 751 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1194P-201ENST00000516208 DOK7Q18PE1 504 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1194P-201ENST00000516208 BOLA1Q9Y3E2 137 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1194P-201ENST00000516208 CABP2Q9NPB3 220 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1194P-201ENST00000516208 GSE1Q14687 1217 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ZNF687Q8N1G0 1237 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1194P-201ENST00000516208 KLHL34Q8N239 644 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1194P-201ENST00000516208 RIMBP2O15034 1052 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1194P-201ENST00000516208 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1194P-201ENST00000516208 TMEM92Q6UXU6 159 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PTGER2P43116 358 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1194P-201ENST00000516208 GPR153Q6NV75 609 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ARSIQ5FYB1 569 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1194P-201ENST00000516208 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1194P-201ENST00000516208 VASPP50552 380 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1194P-201ENST00000516208 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1194P-201ENST00000516208 MICALL2Q8IY33 904 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1194P-201ENST00000516208 EFCAB3Q8N7B9 438 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1194P-201ENST00000516208 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-1194P-201ENST00000516208 FBXO3Q9UK99 471 aa3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms