RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508936.1

SMAD1-AS2-201, SMAD1 antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD1-AS2, Length 1,090 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C7P10643 843 aa15.82■□□□□ 0.12
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 POTEMA6NI47 508 aa15.76■□□□□ 0.11
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PROM2Q8N271 834 aa15.76■□□□□ 0.11
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MAMSTRQ6ZN01 415 aa15.74■□□□□ 0.11
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 POTEGQ6S5H5 508 aa15.71■□□□□ 0.11
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PLEKHG5O94827 1062 aa15.7■□□□□ 0.1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CCDC61Q9Y6R9 512 aa15.7■□□□□ 0.1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KIF12Q96FN5 646 aa15.65■□□□□ 0.1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 POTEJP0CG39 1038 aa15.63■□□□□ 0.09
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SCUBE2Q9NQ36 999 aa15.62■□□□□ 0.09
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PCDH10Q9P2E7 1040 aa15.61■□□□□ 0.09
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MIER1Q8N108 512 aa15.6■□□□□ 0.09
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MAP3K13O43283 966 aa15.53■□□□□ 0.08
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TIE1P35590 1138 aa15.53■□□□□ 0.08
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RASEFQ8IZ41 740 aa15.5■□□□□ 0.07
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TRPC6Q9Y210 931 aa15.48■□□□□ 0.07
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 POTEFA5A3E0 1075 aa15.44■□□□□ 0.06
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SEC24BO95487 1268 aa15.44■□□□□ 0.06
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PLCD3Q8N3E9 789 aa15.44■□□□□ 0.06
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TTLL13PA6NNM8 815 aa15.41■□□□□ 0.06
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SGIP1Q9BQI5 828 aa15.4■□□□□ 0.06
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 IER5LQ5T953 404 aa15.35■□□□□ 0.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa15.35■□□□□ 0.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TRIM35Q9UPQ4 493 aa15.32■□□□□ 0.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NUBP1P53384 320 aa15.26■□□□□ 0.03
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FAM212AQ96EL1 285 aa15.25■□□□□ 0.03
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 IFNL1Q8IU54 200 aa15.22■□□□□ 0.03
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TMEM106CQ9BVX2 250 aa15.2■□□□□ 0.02
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PLCG2P16885 1265 aa15.17■□□□□ 0.02
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLAIN1Q8ND83 568 aa15.17■□□□□ 0.02
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CDAN1Q8IWY9 1227 aa15.13■□□□□ 0.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ST18O60284 1047 aa15.06■□□□□ 0
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DCAF8Q5TAQ9 597 aa15.05■□□□□ -0
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 OCEL1Q9H607 264 aa15.03■□□□□ -0
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FKBP8Q14318 412 aa15.02■□□□□ -0
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PYGBP11216 843 aa14.99□□□□□ -0.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SNPHO15079 494 aa14.96□□□□□ -0.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FBXO3Q9UK99 471 aa14.94□□□□□ -0.02
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PCDHB8Q9UN66 801 aa14.92□□□□□ -0.02
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GOLGA2Q08379 1002 aa14.83□□□□□ -0.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GSE1Q14687 1217 aa14.83□□□□□ -0.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.8□□□□□ -0.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KLHL34Q8N239 644 aa14.8□□□□□ -0.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MARVELD3Q96A59 401 aa14.77□□□□□ -0.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MMRN1Q13201 1228 aa14.76□□□□□ -0.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPNS2Q8IVW8 549 aa14.76□□□□□ -0.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 VASPP50552 380 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 EMP3P54852 163 aa14.68□□□□□ -0.06
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PSEN1P49768 467 aa14.67□□□□□ -0.06
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 G3V3G9 751 aa14.56□□□□□ -0.08
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FAM205CA6NFA0 338 aa14.55□□□□□ -0.08
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HS3ST6Q96QI5 342 aa14.55□□□□□ -0.08
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CABP2Q9NPB3 220 aa14.49□□□□□ -0.09
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.49□□□□□ -0.09
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.48□□□□□ -0.09
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa14.48□□□□□ -0.09
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa14.48□□□□□ -0.09
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 POTEB3A0JP26 581 aa14.47□□□□□ -0.09
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 POTEBQ6S5H4 581 aa14.47□□□□□ -0.09
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPOCK2Q92563 424 aa14.46□□□□□ -0.09
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZNF710Q8N1W2 664 aa14.43□□□□□ -0.1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DOK7Q18PE1 504 aa14.38□□□□□ -0.11
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RIMBP2O15034 1052 aa14.33□□□□□ -0.12
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ERBB3P21860 1342 aa14.33□□□□□ -0.12
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TRIM41Q8WV44 630 aa14.28□□□□□ -0.12
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 EFCAB3Q8N7B9 438 aa14.26□□□□□ -0.13
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa14.21□□□□□ -0.13
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MICALL2Q8IY33 904 aa14.17□□□□□ -0.14
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SOX12O15370 315 aa14.14□□□□□ -0.15
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZNF687Q8N1G0 1237 aa14.12□□□□□ -0.15
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MYT1LQ9UL68 1186 aa14.12□□□□□ -0.15
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TMEM92Q6UXU6 159 aa14.1□□□□□ -0.15
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GPR153Q6NV75 609 aa14.08□□□□□ -0.16
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PTGER2P43116 358 aa14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms