RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
RABGGTB-214ENST00000497648 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa14.02□□□□□ -0.17
RABGGTB-214ENST00000497648 PLCD3Q8N3E9 789 aa14□□□□□ -0.17
RABGGTB-214ENST00000497648 SCRIBQ14160 1630 aa14□□□□□ -0.17
RABGGTB-214ENST00000497648 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
RABGGTB-214ENST00000497648 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
RABGGTB-214ENST00000497648 BICRAQ9NZM4 1560 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGGTB-214ENST00000497648 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
RABGGTB-214ENST00000497648 PLEKHG5O94827 1062 aa13.9□□□□□ -0.19
RABGGTB-214ENST00000497648 BCL11AQ9H165 835 aa13.9□□□□□ -0.19
RABGGTB-214ENST00000497648 POTEHQ6S545 545 aa13.88□□□□□ -0.19
RABGGTB-214ENST00000497648 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
RABGGTB-214ENST00000497648 TAOK2Q9UL54 1235 aa13.83□□□□□ -0.2
RABGGTB-214ENST00000497648 KLHL34Q8N239 644 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGGTB-214ENST00000497648 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
RABGGTB-214ENST00000497648 BCANQ96GW7 911 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGGTB-214ENST00000497648 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP13.77□□□□□ -0.21
RABGGTB-214ENST00000497648 NUBP1P53384 320 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGGTB-214ENST00000497648 SPOCK2Q92563 424 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGGTB-214ENST00000497648 PODXL2Q9NZ53 605 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGGTB-214ENST00000497648 RASEFQ8IZ41 740 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGGTB-214ENST00000497648 C19orf67A6NJJ6 358 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGGTB-214ENST00000497648 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGGTB-214ENST00000497648 EVX2Q03828 476 aa13.63□□□□□ -0.23
RABGGTB-214ENST00000497648 CD44P16070 742 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
RABGGTB-214ENST00000497648 HAX1O00165 279 aa13.61□□□□□ -0.23
RABGGTB-214ENST00000497648 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
RABGGTB-214ENST00000497648 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM212AQ96EL1 285 aa13.57□□□□□ -0.24
RABGGTB-214ENST00000497648 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa13.57□□□□□ -0.24
RABGGTB-214ENST00000497648 DCAF8Q5TAQ9 597 aa13.55□□□□□ -0.24
RABGGTB-214ENST00000497648 ZRANB1Q9UGI0 708 aa13.54□□□□□ -0.24
RABGGTB-214ENST00000497648 CCDC61Q9Y6R9 512 aa13.54□□□□□ -0.24
RABGGTB-214ENST00000497648 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
RABGGTB-214ENST00000497648 GSE1Q14687 1217 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGGTB-214ENST00000497648 TPRNQ4KMQ1 711 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGGTB-214ENST00000497648 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
RABGGTB-214ENST00000497648 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
RABGGTB-214ENST00000497648 PKD2Q13563 968 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGGTB-214ENST00000497648 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
RABGGTB-214ENST00000497648 PHF12Q96QT6 1004 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGGTB-214ENST00000497648 CECR2Q9BXF3 1484 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGGTB-214ENST00000497648 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGGTB-214ENST00000497648 PYGBP11216 843 aa13.41□□□□□ -0.26
RABGGTB-214ENST00000497648 KIF12Q96FN5 646 aa13.4□□□□□ -0.26
RABGGTB-214ENST00000497648 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
RABGGTB-214ENST00000497648 SMARCA4P51532 1647 aa13.37□□□□□ -0.27
RABGGTB-214ENST00000497648 TRIM41Q8WV44 630 aa13.37□□□□□ -0.27
RABGGTB-214ENST00000497648 MAP3K13O43283 966 aa13.35□□□□□ -0.27
RABGGTB-214ENST00000497648 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
RABGGTB-214ENST00000497648 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
RABGGTB-214ENST00000497648 C14orf37Q86TY3 774 aa13.33□□□□□ -0.28
RABGGTB-214ENST00000497648 GABBR2O75899 941 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGGTB-214ENST00000497648 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
RABGGTB-214ENST00000497648 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
RABGGTB-214ENST00000497648 MROH2BQ7Z745 1585 aa13.3□□□□□ -0.28
RABGGTB-214ENST00000497648 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
RABGGTB-214ENST00000497648 MS4A3Q96HJ5 214 aa13.29□□□□□ -0.28
RABGGTB-214ENST00000497648 SGIP1Q9BQI5 828 aa13.29□□□□□ -0.28
RABGGTB-214ENST00000497648 RGL2O15211 777 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGGTB-214ENST00000497648 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
RABGGTB-214ENST00000497648 PLCB2Q00722 1185 aa13.28□□□□□ -0.28
RABGGTB-214ENST00000497648 NEFLP07196 543 aa13.27□□□□□ -0.29
RABGGTB-214ENST00000497648 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
RABGGTB-214ENST00000497648 IFNL1Q8IU54 200 aa13.27□□□□□ -0.29
RABGGTB-214ENST00000497648 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa13.27□□□□□ -0.29
RABGGTB-214ENST00000497648 CLCN6P51797 869 aa13.26□□□□□ -0.29
RABGGTB-214ENST00000497648 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
RABGGTB-214ENST00000497648 PCDHB8Q9UN66 801 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGGTB-214ENST00000497648 TRPC6Q9Y210 931 aa13.22□□□□□ -0.29
RABGGTB-214ENST00000497648 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa13.22□□□□□ -0.29
RABGGTB-214ENST00000497648 WIZO95785 1651 aa13.21□□□□□ -0.3
RABGGTB-214ENST00000497648 SMARCA2P51531 1590 aa13.2□□□□□ -0.3
RABGGTB-214ENST00000497648 PEG3Q9GZU2 1588 aa13.2□□□□□ -0.3
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM132AQ24JP5 1023 aa13.19□□□□□ -0.3
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
RABGGTB-214ENST00000497648 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
RABGGTB-214ENST00000497648 NCAPD3P42695 1498 aa13.18□□□□□ -0.3
RABGGTB-214ENST00000497648 HMGXB3Q12766 1538 aa13.15□□□□□ -0.31
RABGGTB-214ENST00000497648 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
RABGGTB-214ENST00000497648 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
RABGGTB-214ENST00000497648 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
RABGGTB-214ENST00000497648 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RABGGTB-214ENST00000497648 VGFO15240 615 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
RABGGTB-214ENST00000497648 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
RABGGTB-214ENST00000497648 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
RABGGTB-214ENST00000497648 TIE1P35590 1138 aa13.09□□□□□ -0.31
RABGGTB-214ENST00000497648 PSEN1P49768 467 aa13.09□□□□□ -0.31
RABGGTB-214ENST00000497648 POTEIP0CG38 1075 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGGTB-214ENST00000497648 TAF7LQ5H9L4 462 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGGTB-214ENST00000497648 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
RABGGTB-214ENST00000497648 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
RABGGTB-214ENST00000497648 PDE4CQ08493 712 aa13.06□□□□□ -0.32
RABGGTB-214ENST00000497648 TTLL13PA6NNM8 815 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGGTB-214ENST00000497648 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
RABGGTB-214ENST00000497648 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
RABGGTB-214ENST00000497648 BRD2P25440 801 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
RABGGTB-214ENST00000497648 PKNOX2Q96KN3 472 aa13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms