RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468148.5

RAB23-202, Transcript of RAB23, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB23, Length 4,837 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23-202ENST00000468148 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.94■■□□□ 1.26
RAB23-202ENST00000468148 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.9■■□□□ 1.26
RAB23-202ENST00000468148 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
RAB23-202ENST00000468148 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.88■■□□□ 1.25
RAB23-202ENST00000468148 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
RAB23-202ENST00000468148 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.87■■□□□ 1.25
RAB23-202ENST00000468148 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.86■■□□□ 1.25
RAB23-202ENST00000468148 KCNH8Q96L42 1107 aa22.86■■□□□ 1.25
RAB23-202ENST00000468148 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.85■■□□□ 1.25
RAB23-202ENST00000468148 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.83■■□□□ 1.25
RAB23-202ENST00000468148 NACADO15069 1562 aa22.83■■□□□ 1.24
RAB23-202ENST00000468148 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
RAB23-202ENST00000468148 FBLN2P98095 1184 aa22.79■■□□□ 1.24
RAB23-202ENST00000468148 CCER2I3L3R5 266 aa22.74■■□□□ 1.23
RAB23-202ENST00000468148 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.74■■□□□ 1.23
RAB23-202ENST00000468148 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
RAB23-202ENST00000468148 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
RAB23-202ENST00000468148 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
RAB23-202ENST00000468148 KIF27Q86VH2 1401 aa22.68■■□□□ 1.22
RAB23-202ENST00000468148 ARXQ96QS3 562 aa22.68■■□□□ 1.22
RAB23-202ENST00000468148 WIZO95785 1651 aa22.67■■□□□ 1.22
RAB23-202ENST00000468148 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
RAB23-202ENST00000468148 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.65■■□□□ 1.22
RAB23-202ENST00000468148 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.65■■□□□ 1.22
RAB23-202ENST00000468148 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
RAB23-202ENST00000468148 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.62■■□□□ 1.21
RAB23-202ENST00000468148 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.6■■□□□ 1.21
RAB23-202ENST00000468148 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
RAB23-202ENST00000468148 NEFMP07197 916 aa22.56■■□□□ 1.2
RAB23-202ENST00000468148 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
RAB23-202ENST00000468148 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
RAB23-202ENST00000468148 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
RAB23-202ENST00000468148 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
RAB23-202ENST00000468148 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
RAB23-202ENST00000468148 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.19
RAB23-202ENST00000468148 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.47■■□□□ 1.19
RAB23-202ENST00000468148 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.47■■□□□ 1.19
RAB23-202ENST00000468148 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
RAB23-202ENST00000468148 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
RAB23-202ENST00000468148 TSPY4P0CV99 314 aa22.41■■□□□ 1.18
RAB23-202ENST00000468148 TSPY10P0CW01 314 aa22.41■■□□□ 1.18
RAB23-202ENST00000468148 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.4■■□□□ 1.18
RAB23-202ENST00000468148 FOXD1Q16676 465 aa22.39■■□□□ 1.17
RAB23-202ENST00000468148 RGL3Q3MIN7 710 aa22.39■■□□□ 1.17
RAB23-202ENST00000468148 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.38■■□□□ 1.17
RAB23-202ENST00000468148 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.38■■□□□ 1.17
RAB23-202ENST00000468148 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.38■■□□□ 1.17
RAB23-202ENST00000468148 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
RAB23-202ENST00000468148 RGS3P49796 1198 aa22.34■■□□□ 1.17
RAB23-202ENST00000468148 CUX2O14529 1486 aa22.33■■□□□ 1.17
RAB23-202ENST00000468148 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
RAB23-202ENST00000468148 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
RAB23-202ENST00000468148 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.28■■□□□ 1.16
RAB23-202ENST00000468148 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
RAB23-202ENST00000468148 BECN1Q14457 450 aa22.26■■□□□ 1.15
RAB23-202ENST00000468148 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
RAB23-202ENST00000468148 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
RAB23-202ENST00000468148 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
RAB23-202ENST00000468148 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.21■■□□□ 1.15
RAB23-202ENST00000468148 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.2■■□□□ 1.15
RAB23-202ENST00000468148 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.18■■□□□ 1.14
RAB23-202ENST00000468148 NUDCQ9Y266 331 aa22.17■■□□□ 1.14
RAB23-202ENST00000468148 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
RAB23-202ENST00000468148 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.16■■□□□ 1.14
RAB23-202ENST00000468148 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.14■■□□□ 1.14
RAB23-202ENST00000468148 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.14■■□□□ 1.13
RAB23-202ENST00000468148 NEUROD2Q15784 382 aa22.13■■□□□ 1.13
RAB23-202ENST00000468148 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
RAB23-202ENST00000468148 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
RAB23-202ENST00000468148 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
RAB23-202ENST00000468148 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
RAB23-202ENST00000468148 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.08■■□□□ 1.12
RAB23-202ENST00000468148 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
RAB23-202ENST00000468148 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
RAB23-202ENST00000468148 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.06■■□□□ 1.12
RAB23-202ENST00000468148 FMN1Q68DA7 1419 aa22.06■■□□□ 1.12
RAB23-202ENST00000468148 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
RAB23-202ENST00000468148 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
RAB23-202ENST00000468148 KIF21BO75037 1637 aa22.05■■□□□ 1.12
RAB23-202ENST00000468148 PKD2Q13563 968 aa22.04■■□□□ 1.12
RAB23-202ENST00000468148 SMARCA4P51532 1647 aa22.03■■□□□ 1.12
RAB23-202ENST00000468148 SMARCA2P51531 1590 aa22.03■■□□□ 1.12
RAB23-202ENST00000468148 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.02■■□□□ 1.12
RAB23-202ENST00000468148 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.01■■□□□ 1.11
RAB23-202ENST00000468148 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
RAB23-202ENST00000468148 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa21.97■■□□□ 1.11
RAB23-202ENST00000468148 PDE4AP27815 886 aa21.95■■□□□ 1.1
RAB23-202ENST00000468148 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.95■■□□□ 1.1
RAB23-202ENST00000468148 SLC4A3P48751 1232 aa21.94■■□□□ 1.1
RAB23-202ENST00000468148 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
RAB23-202ENST00000468148 CDCA8Q53HL2 280 aa21.94■■□□□ 1.1
RAB23-202ENST00000468148 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
RAB23-202ENST00000468148 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
RAB23-202ENST00000468148 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
RAB23-202ENST00000468148 RALBP1Q15311 655 aa21.92■■□□□ 1.1
RAB23-202ENST00000468148 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
RAB23-202ENST00000468148 TMF1P82094 1093 aa21.92■■□□□ 1.1
RAB23-202ENST00000468148 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.92■■□□□ 1.1
RAB23-202ENST00000468148 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.9■■□□□ 1.1
RAB23-202ENST00000468148 PLIN1O60240 522 aa21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms