RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
RABGGTB-204ENST00000461653 KLHL34Q8N239 644 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM212AQ96EL1 285 aa13.63□□□□□ -0.23
RABGGTB-204ENST00000461653 DCBLD2Q96PD2 775 aa13.61□□□□□ -0.23
RABGGTB-204ENST00000461653 POTEIP0CG38 1075 aa13.6□□□□□ -0.23
RABGGTB-204ENST00000461653 MS4A3Q96HJ5 214 aa13.6□□□□□ -0.23
RABGGTB-204ENST00000461653 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
RABGGTB-204ENST00000461653 KIF12Q96FN5 646 aa13.59□□□□□ -0.23
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RABGGTB-204ENST00000461653 TRPC6Q9Y210 931 aa13.42□□□□□ -0.26
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RABGGTB-204ENST00000461653 SLC39A7Q92504 469 aa13.29□□□□□ -0.28
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RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM106CQ9BVX2 250 aa13.25□□□□□ -0.29
RABGGTB-204ENST00000461653 C7P10643 843 aa13.25□□□□□ -0.29
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RABGGTB-204ENST00000461653 POTEB2H3BUK9 544 aa13.16□□□□□ -0.3
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RABGGTB-204ENST00000461653 PSEN1P49768 467 aa13.13□□□□□ -0.31
RABGGTB-204ENST00000461653 POTEFA5A3E0 1075 aa13.11□□□□□ -0.31
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RABGGTB-204ENST00000461653 SEC24BO95487 1268 aa13.1□□□□□ -0.31
RABGGTB-204ENST00000461653 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
RABGGTB-204ENST00000461653 OTUD5Q96G74 571 aa13.04□□□□□ -0.32
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RABGGTB-204ENST00000461653 GOLGA2Q08379 1002 aa13.03□□□□□ -0.32
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RABGGTB-204ENST00000461653 PLCG2P16885 1265 aa13.02□□□□□ -0.33
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RABGGTB-204ENST00000461653 RGL2O15211 777 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGGTB-204ENST00000461653 EFCAB3Q8N7B9 438 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGGTB-204ENST00000461653 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
RABGGTB-204ENST00000461653 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
RABGGTB-204ENST00000461653 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
RABGGTB-204ENST00000461653 STK24Q9Y6E0 443 aa12.78□□□□□ -0.36
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RABGGTB-204ENST00000461653 SLAIN1Q8ND83 568 aa12.75□□□□□ -0.37
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RABGGTB-204ENST00000461653 BOLA1Q9Y3E2 137 aa12.7□□□□□ -0.38
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RABGGTB-204ENST00000461653 MFRPQ9BY79 579 aa12.62□□□□□ -0.39
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RABGGTB-204ENST00000461653 MICALL2Q8IY33 904 aa12.59□□□□□ -0.39
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RABGGTB-204ENST00000461653 POTEMA6NI47 508 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGGTB-204ENST00000461653 SNPHO15079 494 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGGTB-204ENST00000461653 POTEGQ6S5H5 508 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGGTB-204ENST00000461653 ST18O60284 1047 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGGTB-204ENST00000461653 DCAF8L2P0C7V8 631 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM92Q6UXU6 159 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGGTB-204ENST00000461653 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGGTB-204ENST00000461653 PPP1R37O75864 691 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGGTB-204ENST00000461653 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
RABGGTB-204ENST00000461653 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
RABGGTB-204ENST00000461653 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
RABGGTB-204ENST00000461653 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
RABGGTB-204ENST00000461653 DOK7Q18PE1 504 aa12.35□□□□□ -0.43
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