RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CBX1P4-201ENST00000439415 PLEKHG5O94827 1062 aa8.95□□□□□ -0.98
CBX1P4-201ENST00000439415 C14orf37Q86TY3 774 aa8.95□□□□□ -0.98
CBX1P4-201ENST00000439415 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CBX1P4-201ENST00000439415 SSUH2Q9Y2M2 353 aa8.9□□□□□ -0.98
CBX1P4-201ENST00000439415 SPDYE2BA6NHP3 402 aa8.89□□□□□ -0.99
CBX1P4-201ENST00000439415 SPDYE6P0CI01 402 aa8.89□□□□□ -0.99
CBX1P4-201ENST00000439415 SPDYE2Q495Y8 402 aa8.89□□□□□ -0.99
CBX1P4-201ENST00000439415 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
CBX1P4-201ENST00000439415 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
CBX1P4-201ENST00000439415 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP8.87□□□□□ -0.99
CBX1P4-201ENST00000439415 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
CBX1P4-201ENST00000439415 GSE1Q14687 1217 aa8.85□□□□□ -0.99
CBX1P4-201ENST00000439415 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
CBX1P4-201ENST00000439415 P3H3Q8IVL6 736 aa8.81□□□□□ -1
CBX1P4-201ENST00000439415 CHRDL2Q6WN34 429 aa8.8□□□□□ -1
CBX1P4-201ENST00000439415 OSCARQ8IYS5 282 aa8.8□□□□□ -1
CBX1P4-201ENST00000439415 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
CBX1P4-201ENST00000439415 STK25O00506 426 aa8.77□□□□□ -1.01
CBX1P4-201ENST00000439415 VGFO15240 615 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CBX1P4-201ENST00000439415 LMOD2Q6P5Q4 547 aa8.74□□□□□ -1.01
CBX1P4-201ENST00000439415 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.73□□□□□ -1.01
CBX1P4-201ENST00000439415 DCAF8Q5TAQ9 597 aa8.72□□□□□ -1.01
CBX1P4-201ENST00000439415 NUBP1P53384 320 aa8.71□□□□□ -1.02
CBX1P4-201ENST00000439415 AKT1S1Q96B36 256 aa8.71□□□□□ -1.02
CBX1P4-201ENST00000439415 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CBX1P4-201ENST00000439415 SGIP1Q9BQI5 828 aa8.7□□□□□ -1.02
CBX1P4-201ENST00000439415 WDR70Q9NW82 654 aa8.68□□□□□ -1.02
CBX1P4-201ENST00000439415 STK24Q9Y6E0 443 aa8.67□□□□□ -1.02
CBX1P4-201ENST00000439415 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNV2Q8TDN2 545 aa8.66□□□□□ -1.02
CBX1P4-201ENST00000439415 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CBX1P4-201ENST00000439415 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM212AQ96EL1 285 aa8.64□□□□□ -1.03
CBX1P4-201ENST00000439415 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CBX1P4-201ENST00000439415 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CBX1P4-201ENST00000439415 NEUROD2Q15784 382 aa8.61□□□□□ -1.03
CBX1P4-201ENST00000439415 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CBX1P4-201ENST00000439415 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CBX1P4-201ENST00000439415 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CBX1P4-201ENST00000439415 PODXL2Q9NZ53 605 aa8.57□□□□□ -1.04
CBX1P4-201ENST00000439415 PIP4P2Q8N4L2 257 aa8.56□□□□□ -1.04
CBX1P4-201ENST00000439415 CADPS2Q86UW7 1296 aa8.55□□□□□ -1.04
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC24A3Q9HC58 644 aa8.55□□□□□ -1.04
CBX1P4-201ENST00000439415 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CBX1P4-201ENST00000439415 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CBX1P4-201ENST00000439415 PITPNM1O00562 1244 aa8.51□□□□□ -1.05
CBX1P4-201ENST00000439415 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
CBX1P4-201ENST00000439415 PYGBP11216 843 aa8.48□□□□□ -1.05
CBX1P4-201ENST00000439415 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CBX1P4-201ENST00000439415 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CBX1P4-201ENST00000439415 RASEFQ8IZ41 740 aa8.47□□□□□ -1.05
CBX1P4-201ENST00000439415 UBTFP17480 764 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CBX1P4-201ENST00000439415 E2F4Q16254 413 aa8.46□□□□□ -1.06
CBX1P4-201ENST00000439415 CREBZFQ9NS37 354 aa8.46□□□□□ -1.06
CBX1P4-201ENST00000439415 ZMYND10O75800 440 aa8.45□□□□□ -1.06
CBX1P4-201ENST00000439415 SEMA3EO15041 775 aa8.44□□□□□ -1.06
CBX1P4-201ENST00000439415 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CBX1P4-201ENST00000439415 ZMYND15Q9H091 742 aa8.44□□□□□ -1.06
CBX1P4-201ENST00000439415 SMYD5Q6GMV2 418 aa8.43□□□□□ -1.06
CBX1P4-201ENST00000439415 HAX1O00165 279 aa8.42□□□□□ -1.06
CBX1P4-201ENST00000439415 RSPH6AQ9H0K4 717 aa8.41□□□□□ -1.06
CBX1P4-201ENST00000439415 PRR29P0C7W0 189 aa8.4□□□□□ -1.06
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CBX1P4-201ENST00000439415 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CBX1P4-201ENST00000439415 BARGINQ6ZT62 677 aa8.38□□□□□ -1.07
CBX1P4-201ENST00000439415 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CBX1P4-201ENST00000439415 MFRPQ9BY79 579 aa8.37□□□□□ -1.07
CBX1P4-201ENST00000439415 AK7Q96M32 723 aa8.36□□□□□ -1.07
CBX1P4-201ENST00000439415 CLEC11AQ9Y240 323 aa8.35□□□□□ -1.07
CBX1P4-201ENST00000439415 EVX2Q03828 476 aa8.33□□□□□ -1.08
CBX1P4-201ENST00000439415 IL27Q8NEV9 243 aa8.32□□□□□ -1.08
CBX1P4-201ENST00000439415 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP1R37O75864 691 aa8.31□□□□□ -1.08
CBX1P4-201ENST00000439415 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CBX1P4-201ENST00000439415 HRCP23327 699 aa8.3□□□□□ -1.08
CBX1P4-201ENST00000439415 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CBX1P4-201ENST00000439415 KDM4CQ9H3R0 1056 aa8.29□□□□□ -1.08
CBX1P4-201ENST00000439415 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CBX1P4-201ENST00000439415 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CBX1P4-201ENST00000439415 PSEN1P49768 467 aa8.28□□□□□ -1.08
CBX1P4-201ENST00000439415 NLRP6P59044 892 aa8.28□□□□□ -1.08
CBX1P4-201ENST00000439415 ARID3AQ99856 593 aa8.27□□□□□ -1.09
CBX1P4-201ENST00000439415 PCDHB8Q9UN66 801 aa8.27□□□□□ -1.09
CBX1P4-201ENST00000439415 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa8.27□□□□□ -1.09
CBX1P4-201ENST00000439415 PDE4AP27815 886 aa8.26□□□□□ -1.09
CBX1P4-201ENST00000439415 FBXO22Q8NEZ5 403 aa8.26□□□□□ -1.09
CBX1P4-201ENST00000439415 GPIHBP1Q8IV16 184 aa8.25□□□□□ -1.09
CBX1P4-201ENST00000439415 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CBX1P4-201ENST00000439415 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa8.25□□□□□ -1.09
CBX1P4-201ENST00000439415 C19orf67A6NJJ6 358 aa8.24□□□□□ -1.09
CBX1P4-201ENST00000439415 SOX12O15370 315 aa8.24□□□□□ -1.09
CBX1P4-201ENST00000439415 MFSD10Q14728 455 aa8.24□□□□□ -1.09
CBX1P4-201ENST00000439415 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CBX1P4-201ENST00000439415 TRIM66O15016 1216 aa8.23□□□□□ -1.09
CBX1P4-201ENST00000439415 PDE4DQ08499 809 aa8.23□□□□□ -1.09
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CBX1P4-201ENST00000439415 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CBX1P4-201ENST00000439415 C1orf115Q9H7X2 142 aa8.22□□□□□ -1.09
CBX1P4-201ENST00000439415 EFCAB3Q8N7B9 438 aa8.21□□□□□ -1.1
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