RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435348.5

TTC28-AS1-214, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 578 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SPDYE2Q495Y8 402 aa19.38■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-214ENST00000435348 EVX2Q03828 476 aa19.37■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-214ENST00000435348 FBLN2P98095 1184 aa19.34■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-214ENST00000435348 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.34■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-214ENST00000435348 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa19.31■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-214ENST00000435348 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa19.31■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-214ENST00000435348 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa19.31■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-214ENST00000435348 WIZO95785 1651 aa19.22■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ARHGEF11O15085 1522 aa19.19■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-214ENST00000435348 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SSUH2Q9Y2M2 353 aa19.16■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CFTRP13569 1480 aa19.16■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CLEC11AQ9Y240 323 aa19.15■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CYB5RLQ6IPT4 315 aa19.11■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-214ENST00000435348 IFT140Q96RY7 1462 aa19.05■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PRDM2Q13029 1718 aa18.98■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-214ENST00000435348 C19orf67A6NJJ6 358 aa18.98■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-214ENST00000435348 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ARAP1Q96P48 1450 aa18.94■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-214ENST00000435348 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CHADLQ6NUI6 762 aa18.92■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CHD1O14646 1710 aa18.91■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-214ENST00000435348 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-214ENST00000435348 TOPBP1Q92547 1522 aa18.88■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ABCC8Q09428 1581 aa18.85■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-214ENST00000435348 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP18.8■□□□□ 0.6
TTC28-AS1-214ENST00000435348 GABBR2O75899 941 aa18.79■□□□□ 0.6
TTC28-AS1-214ENST00000435348 DNMBPQ6XZF7 1577 aa18.78■□□□□ 0.6
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PRR29P0C7W0 189 aa18.75■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-214ENST00000435348 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CCDC88BA6NC98 1476 aa18.71■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CSRNP3Q8WYN3 585 aa18.67■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SYNJ1O43426 1573 aa18.66■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-214ENST00000435348 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CLASP1Q7Z460 1538 aa18.64■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa18.63■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-214ENST00000435348 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-214ENST00000435348 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa18.58■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SOGA1O94964 1423 aa18.57■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-214ENST00000435348 WDR97A6NE52 1622 aa18.56■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-214ENST00000435348 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-214ENST00000435348 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-214ENST00000435348 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.52■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CD44P16070 742 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-214ENST00000435348 LHX8Q68G74 356 aa18.5■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-214ENST00000435348 POTEIP0CG38 1075 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SYNJ2O15056 1496 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-214ENST00000435348 GRIN2BQ13224 1484 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-214ENST00000435348 FGD5Q6ZNL6 1462 aa18.46■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PBRM1Q86U86 1689 aa18.39■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CREBZFQ9NS37 354 aa18.32■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CUX1P39880 1505 aa18.32■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ERCC6L2Q5T890 1561 aa18.28■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-214ENST00000435348 KIF13AQ9H1H9 1805 aa18.25■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CEP170Q5SW79 1584 aa18.25■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-214ENST00000435348 GRIN2AQ12879 1464 aa18.24■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.23■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.2■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ZRANB1Q9UGI0 708 aa18.19■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-214ENST00000435348 EHMT2Q96KQ7 1210 aa18.18■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CLCN6P51797 869 aa18.17■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-214ENST00000435348 NUP160Q12769 1436 aa18.16■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-214ENST00000435348 FAM69CQ0P6D2 419 aa18.16■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ADAMTS12P58397 1594 aa18.16■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SPDYE4A6NLX3 237 aa18.15■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-214ENST00000435348 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP18.15■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SHROOM2Q13796 1616 aa18.15■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-214ENST00000435348 STAG3Q9UJ98 1225 aa18.13■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-214ENST00000435348 KDM6BO15054 1643 aa18.1■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-214ENST00000435348 DCBLD2Q96PD2 775 aa18.1■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ABCC10Q5T3U5 1492 aa18.09■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-214ENST00000435348 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.09■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-214ENST00000435348 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa18.09■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-214ENST00000435348 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-214ENST00000435348 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP18.06■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-214ENST00000435348 DIP2BQ9P265 1576 aa18.04■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-214ENST00000435348 MAPKBP1O60336 1514 aa18.03■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-214ENST00000435348 JPH4Q96JJ6 628 aa18.02■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-214ENST00000435348 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-214ENST00000435348 TSPOAP1O95153 1857 aa17.99■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ERICH3Q5RHP9 1530 aa17.98■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PHF12Q96QT6 1004 aa17.97■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ADCY10Q96PN6 1610 aa17.94■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-214ENST00000435348 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa17.91■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-214ENST00000435348 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa17.9■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-214ENST00000435348 POTEB2H3BUK9 544 aa17.89■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-214ENST00000435348 TOP2BQ02880 1626 aa17.89■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ADGRL1O94910 1474 aa17.87■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-214ENST00000435348 OTUD5Q96G74 571 aa17.83■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-214ENST00000435348 HECW2Q9P2P5 1572 aa17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.1 ms