RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 MS4A3Q96HJ5 214 aa17.26■□□□□ 0.35
PTPRK-211ENST00000429595 KIF12Q96FN5 646 aa17.16■□□□□ 0.34
PTPRK-211ENST00000429595 NUBP1P53384 320 aa17.14■□□□□ 0.33
PTPRK-211ENST00000429595 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
PTPRK-211ENST00000429595 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
PTPRK-211ENST00000429595 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
PTPRK-211ENST00000429595 MAP3K13O43283 966 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRK-211ENST00000429595 FBXO3Q9UK99 471 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRK-211ENST00000429595 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
PTPRK-211ENST00000429595 TRPC6Q9Y210 931 aa17.04■□□□□ 0.32
PTPRK-211ENST00000429595 POTEB2H3BUK9 544 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRK-211ENST00000429595 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
PTPRK-211ENST00000429595 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
PTPRK-211ENST00000429595 VASPP50552 380 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
PTPRK-211ENST00000429595 FAM212AQ96EL1 285 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRK-211ENST00000429595 METRNQ9UJH8 293 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRK-211ENST00000429595 SLC39A7Q92504 469 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRK-211ENST00000429595 C7P10643 843 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRK-211ENST00000429595 TIE1P35590 1138 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRK-211ENST00000429595 OTUD5Q96G74 571 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRK-211ENST00000429595 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRK-211ENST00000429595 SGIP1Q9BQI5 828 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRK-211ENST00000429595 TTLL13PA6NNM8 815 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRK-211ENST00000429595 IFNL1Q8IU54 200 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRK-211ENST00000429595 POTEJP0CG39 1038 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRK-211ENST00000429595 DCAF8Q5TAQ9 597 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRK-211ENST00000429595 KLHL34Q8N239 644 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRK-211ENST00000429595 POTEFA5A3E0 1075 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRK-211ENST00000429595 PYGBP11216 843 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRK-211ENST00000429595 TRIM35Q9UPQ4 493 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRK-211ENST00000429595 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
PTPRK-211ENST00000429595 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM106CQ9BVX2 250 aa16.66■□□□□ 0.26
PTPRK-211ENST00000429595 PCDHB8Q9UN66 801 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRK-211ENST00000429595 GSE1Q14687 1217 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRK-211ENST00000429595 IER5LQ5T953 404 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRK-211ENST00000429595 SEC24BO95487 1268 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRK-211ENST00000429595 MAMSTRQ6ZN01 415 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRK-211ENST00000429595 SPOCK2Q92563 424 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRK-211ENST00000429595 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
PTPRK-211ENST00000429595 SCUBE2Q9NQ36 999 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-211ENST00000429595 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
PTPRK-211ENST00000429595 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
PTPRK-211ENST00000429595 PLCG2P16885 1265 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRK-211ENST00000429595 PSEN1P49768 467 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRK-211ENST00000429595 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRK-211ENST00000429595 OCEL1Q9H607 264 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRK-211ENST00000429595 POTEMA6NI47 508 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRK-211ENST00000429595 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
PTPRK-211ENST00000429595 POTEGQ6S5H5 508 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRK-211ENST00000429595 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
PTPRK-211ENST00000429595 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
PTPRK-211ENST00000429595 GOLGA2Q08379 1002 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRK-211ENST00000429595 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
PTPRK-211ENST00000429595 SLAIN1Q8ND83 568 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRK-211ENST00000429595 TRIM41Q8WV44 630 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRK-211ENST00000429595 CABP2Q9NPB3 220 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRK-211ENST00000429595 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
PTPRK-211ENST00000429595 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP16.16■□□□□ 0.183e-9■■■□□ 14.9
PTPRK-211ENST00000429595 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
PTPRK-211ENST00000429595 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PTPRK-211ENST00000429595 DPY19L2Q6NUT2 758 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRK-211ENST00000429595 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PTPRK-211ENST00000429595 PLSCR2Q9NRY7 297 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRK-211ENST00000429595 ST18O60284 1047 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRK-211ENST00000429595 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PTPRK-211ENST00000429595 C3orf67Q6ZVT6 689 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRK-211ENST00000429595 EFCAB3Q8N7B9 438 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRK-211ENST00000429595 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRK-211ENST00000429595 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRK-211ENST00000429595 PCDH10Q9P2E7 1040 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRK-211ENST00000429595 VGFO15240 615 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PTPRK-211ENST00000429595 BOLA1Q9Y3E2 137 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRK-211ENST00000429595 SNPHO15079 494 aa15.88■□□□□ 0.13
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PTPRK-211ENST00000429595 MS4A4AQ96JQ5 239 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRK-211ENST00000429595 G3V3G9 751 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRK-211ENST00000429595 PKD2Q13563 968 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRK-211ENST00000429595 CDAN1Q8IWY9 1227 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRK-211ENST00000429595 SOX12O15370 315 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRK-211ENST00000429595 PHF8Q9UPP1 1060 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRK-211ENST00000429595 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
PTPRK-211ENST00000429595 MARVELD3Q96A59 401 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRK-211ENST00000429595 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRK-211ENST00000429595 MICALL2Q8IY33 904 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRK-211ENST00000429595 RGL2O15211 777 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRK-211ENST00000429595 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM92Q6UXU6 159 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRK-211ENST00000429595 STK24Q9Y6E0 443 aa15.72■□□□□ 0.11
PTPRK-211ENST00000429595 TAOK2Q9UL54 1235 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRK-211ENST00000429595 FBXO22Q8NEZ5 403 aa15.69■□□□□ 0.1
PTPRK-211ENST00000429595 STK25O00506 426 aa15.67■□□□□ 0.1
PTPRK-211ENST00000429595 MFRPQ9BY79 579 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRK-211ENST00000429595 EMP3P54852 163 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRK-211ENST00000429595 NLRP6P59044 892 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRK-211ENST00000429595 POTEB3A0JP26 581 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRK-211ENST00000429595 POTEBQ6S5H4 581 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRK-211ENST00000429595 FAM205CA6NFA0 338 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRK-211ENST00000429595 HS3ST6Q96QI5 342 aa15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms