RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419302.1

PDCL2P1-201, Transcript of phosducin-like 2 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PDCL2P1, Length 352 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2P1-201ENST00000419302 PLCD3Q8N3E9 789 aa10.94□□□□□ -0.66
PDCL2P1-201ENST00000419302 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
PDCL2P1-201ENST00000419302 POTEMA6NI47 508 aa10.81□□□□□ -0.68
PDCL2P1-201ENST00000419302 POTEJP0CG39 1038 aa10.81□□□□□ -0.68
PDCL2P1-201ENST00000419302 MS4A3Q96HJ5 214 aa10.81□□□□□ -0.68
PDCL2P1-201ENST00000419302 FBXO3Q9UK99 471 aa10.8□□□□□ -0.68
PDCL2P1-201ENST00000419302 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
PDCL2P1-201ENST00000419302 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
PDCL2P1-201ENST00000419302 POTEGQ6S5H5 508 aa10.77□□□□□ -0.69
PDCL2P1-201ENST00000419302 RASEFQ8IZ41 740 aa10.77□□□□□ -0.69
PDCL2P1-201ENST00000419302 CCDC61Q9Y6R9 512 aa10.77□□□□□ -0.69
PDCL2P1-201ENST00000419302 METRNQ9UJH8 293 aa10.76□□□□□ -0.69
PDCL2P1-201ENST00000419302 KIF12Q96FN5 646 aa10.71□□□□□ -0.69
PDCL2P1-201ENST00000419302 SLC39A7Q92504 469 aa10.7□□□□□ -0.7
PDCL2P1-201ENST00000419302 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
PDCL2P1-201ENST00000419302 FAM212AQ96EL1 285 aa10.69□□□□□ -0.7
PDCL2P1-201ENST00000419302 C7P10643 843 aa10.68□□□□□ -0.7
PDCL2P1-201ENST00000419302 MAP3K13O43283 966 aa10.67□□□□□ -0.7
PDCL2P1-201ENST00000419302 NUBP1P53384 320 aa10.67□□□□□ -0.7
PDCL2P1-201ENST00000419302 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
PDCL2P1-201ENST00000419302 POTEFA5A3E0 1075 aa10.65□□□□□ -0.7
PDCL2P1-201ENST00000419302 TRPC6Q9Y210 931 aa10.65□□□□□ -0.7
PDCL2P1-201ENST00000419302 KLHL34Q8N239 644 aa10.64□□□□□ -0.71
PDCL2P1-201ENST00000419302 VASPP50552 380 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
PDCL2P1-201ENST00000419302 DCAF8Q5TAQ9 597 aa10.61□□□□□ -0.71
PDCL2P1-201ENST00000419302 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa10.61□□□□□ -0.71
PDCL2P1-201ENST00000419302 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PDCL2P1-201ENST00000419302 TIE1P35590 1138 aa10.58□□□□□ -0.72
PDCL2P1-201ENST00000419302 MAMSTRQ6ZN01 415 aa10.58□□□□□ -0.72
PDCL2P1-201ENST00000419302 SGIP1Q9BQI5 828 aa10.57□□□□□ -0.72
PDCL2P1-201ENST00000419302 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
PDCL2P1-201ENST00000419302 PCDH10Q9P2E7 1040 aa10.55□□□□□ -0.72
PDCL2P1-201ENST00000419302 SCUBE2Q9NQ36 999 aa10.53□□□□□ -0.72
PDCL2P1-201ENST00000419302 TTLL13PA6NNM8 815 aa10.52□□□□□ -0.73
PDCL2P1-201ENST00000419302 PYGBP11216 843 aa10.52□□□□□ -0.73
PDCL2P1-201ENST00000419302 IFNL1Q8IU54 200 aa10.52□□□□□ -0.73
PDCL2P1-201ENST00000419302 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PDCL2P1-201ENST00000419302 GSE1Q14687 1217 aa10.49□□□□□ -0.73
PDCL2P1-201ENST00000419302 SEC24BO95487 1268 aa10.48□□□□□ -0.73
PDCL2P1-201ENST00000419302 TRIM35Q9UPQ4 493 aa10.48□□□□□ -0.73
PDCL2P1-201ENST00000419302 TMEM106CQ9BVX2 250 aa10.47□□□□□ -0.73
PDCL2P1-201ENST00000419302 SPOCK2Q92563 424 aa10.42□□□□□ -0.74
PDCL2P1-201ENST00000419302 IER5LQ5T953 404 aa10.41□□□□□ -0.74
PDCL2P1-201ENST00000419302 PCDHB8Q9UN66 801 aa10.41□□□□□ -0.74
PDCL2P1-201ENST00000419302 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
PDCL2P1-201ENST00000419302 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
PDCL2P1-201ENST00000419302 PLCG2P16885 1265 aa10.36□□□□□ -0.75
PDCL2P1-201ENST00000419302 CDAN1Q8IWY9 1227 aa10.34□□□□□ -0.75
PDCL2P1-201ENST00000419302 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
PDCL2P1-201ENST00000419302 GOLGA2Q08379 1002 aa10.32□□□□□ -0.76
PDCL2P1-201ENST00000419302 ST18O60284 1047 aa10.3□□□□□ -0.76
PDCL2P1-201ENST00000419302 SLAIN1Q8ND83 568 aa10.28□□□□□ -0.76
PDCL2P1-201ENST00000419302 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
PDCL2P1-201ENST00000419302 PSEN1P49768 467 aa10.26□□□□□ -0.77
PDCL2P1-201ENST00000419302 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PDCL2P1-201ENST00000419302 OCEL1Q9H607 264 aa10.26□□□□□ -0.77
PDCL2P1-201ENST00000419302 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PDCL2P1-201ENST00000419302 TRIM41Q8WV44 630 aa10.21□□□□□ -0.77
PDCL2P1-201ENST00000419302 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP10.18□□□□□ -0.78
PDCL2P1-201ENST00000419302 CABP2Q9NPB3 220 aa10.16□□□□□ -0.78
PDCL2P1-201ENST00000419302 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
PDCL2P1-201ENST00000419302 C3orf67Q6ZVT6 689 aa10.13□□□□□ -0.79
PDCL2P1-201ENST00000419302 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PDCL2P1-201ENST00000419302 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PDCL2P1-201ENST00000419302 MMRN1Q13201 1228 aa10.12□□□□□ -0.79
PDCL2P1-201ENST00000419302 SPNS2Q8IVW8 549 aa10.12□□□□□ -0.79
PDCL2P1-201ENST00000419302 G3V3G9 751 aa10.1□□□□□ -0.79
PDCL2P1-201ENST00000419302 MARVELD3Q96A59 401 aa10.09□□□□□ -0.79
PDCL2P1-201ENST00000419302 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
PDCL2P1-201ENST00000419302 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PDCL2P1-201ENST00000419302 SNPHO15079 494 aa10.05□□□□□ -0.8
PDCL2P1-201ENST00000419302 EFCAB3Q8N7B9 438 aa10.03□□□□□ -0.8
PDCL2P1-201ENST00000419302 VGFO15240 615 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
PDCL2P1-201ENST00000419302 DPY19L2Q6NUT2 758 aa10.02□□□□□ -0.81
PDCL2P1-201ENST00000419302 POTEB3A0JP26 581 aa10.01□□□□□ -0.81
PDCL2P1-201ENST00000419302 POTEBQ6S5H4 581 aa10.01□□□□□ -0.81
PDCL2P1-201ENST00000419302 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PDCL2P1-201ENST00000419302 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PDCL2P1-201ENST00000419302 TAOK2Q9UL54 1235 aa10□□□□□ -0.81
PDCL2P1-201ENST00000419302 BOLA1Q9Y3E2 137 aa10□□□□□ -0.81
PDCL2P1-201ENST00000419302 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PDCL2P1-201ENST00000419302 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.96□□□□□ -0.82
PDCL2P1-201ENST00000419302 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.96□□□□□ -0.82
PDCL2P1-201ENST00000419302 SOX12O15370 315 aa9.94□□□□□ -0.82
PDCL2P1-201ENST00000419302 EMP3P54852 163 aa9.93□□□□□ -0.82
PDCL2P1-201ENST00000419302 HS3ST6Q96QI5 342 aa9.92□□□□□ -0.82
PDCL2P1-201ENST00000419302 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PDCL2P1-201ENST00000419302 STK24Q9Y6E0 443 aa9.91□□□□□ -0.82
PDCL2P1-201ENST00000419302 FAM205CA6NFA0 338 aa9.89□□□□□ -0.83
PDCL2P1-201ENST00000419302 PHF8Q9UPP1 1060 aa9.89□□□□□ -0.83
PDCL2P1-201ENST00000419302 STK25O00506 426 aa9.88□□□□□ -0.83
PDCL2P1-201ENST00000419302 MICALL2Q8IY33 904 aa9.86□□□□□ -0.83
PDCL2P1-201ENST00000419302 NLRP6P59044 892 aa9.85□□□□□ -0.83
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.85□□□□□ -0.83
PDCL2P1-201ENST00000419302 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PDCL2P1-201ENST00000419302 PKD2Q13563 968 aa9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms