RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.87■■■□□ 2.21
PTPRJ-201ENST00000418331 MIER1Q8N108 512 aa28.87■■■□□ 2.21
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PTPRJ-201ENST00000418331 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.79■■■□□ 2.2
PTPRJ-201ENST00000418331 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP28.79■■■□□ 2.2
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC136Q96JN2 1154 aa28.72■■■□□ 2.19
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PTPRJ-201ENST00000418331 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
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PTPRJ-201ENST00000418331 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
PTPRJ-201ENST00000418331 ERCC6Q03468 1493 aa28.47■■■□□ 2.15
PTPRJ-201ENST00000418331 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
PTPRJ-201ENST00000418331 CUX2O14529 1486 aa28.46■■■□□ 2.15
PTPRJ-201ENST00000418331 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.45■■■□□ 2.15
PTPRJ-201ENST00000418331 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.45■■■□□ 2.14
PTPRJ-201ENST00000418331 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.43■■■□□ 2.14
PTPRJ-201ENST00000418331 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.41■■■□□ 2.14
PTPRJ-201ENST00000418331 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.41■■■□□ 2.14
PTPRJ-201ENST00000418331 CDCA8Q53HL2 280 aa28.39■■■□□ 2.13
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.36■■■□□ 2.13
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PTPRJ-201ENST00000418331 MYH16Q9H6N6 1097 aa28.27■■■□□ 2.12
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PTPRJ-201ENST00000418331 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.23■■■□□ 2.11
PTPRJ-201ENST00000418331 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
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PTPRJ-201ENST00000418331 NBR1Q14596 966 aa28.19■■■□□ 2.1
PTPRJ-201ENST00000418331 PLEKHG5O94827 1062 aa28.19■■■□□ 2.1
PTPRJ-201ENST00000418331 SMARCA2P51531 1590 aa28.18■■■□□ 2.1
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PTPRJ-201ENST00000418331 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.14■■■□□ 2.1
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PTPRJ-201ENST00000418331 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.09■■■□□ 2.09
PTPRJ-201ENST00000418331 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.08■■■□□ 2.09
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PTPRJ-201ENST00000418331 NEUROD2Q15784 382 aa28.06■■■□□ 2.08
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PTPRJ-201ENST00000418331 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.04■■■□□ 2.08
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PTPRJ-201ENST00000418331 WIZO95785 1651 aa27.96■■■□□ 2.07
PTPRJ-201ENST00000418331 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.96■■■□□ 2.07
PTPRJ-201ENST00000418331 BECN1Q14457 450 aa27.96■■■□□ 2.07
PTPRJ-201ENST00000418331 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
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PTPRJ-201ENST00000418331 LMOD2Q6P5Q4 547 aa27.8■■■□□ 2.04
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PTPRJ-201ENST00000418331 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.72■■■□□ 2.03
PTPRJ-201ENST00000418331 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.71■■■□□ 2.03
PTPRJ-201ENST00000418331 MORC1Q86VD1 984 aa27.71■■■□□ 2.03
PTPRJ-201ENST00000418331 CASC1Q6TDU7 716 aa27.71■■■□□ 2.03
PTPRJ-201ENST00000418331 MS4A1P11836 297 aa27.71■■■□□ 2.03
PTPRJ-201ENST00000418331 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa27.7■■■□□ 2.03
PTPRJ-201ENST00000418331 GOLGA6L22H0YM25 854 aa27.7■■■□□ 2.02
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