RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411331.1

RNU6-387P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 387, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-387P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-387P-201ENST00000411331 PCDH10Q9P2E7 1040 aa8.58□□□□□ -1.04
RNU6-387P-201ENST00000411331 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
RNU6-387P-201ENST00000411331 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RNU6-387P-201ENST00000411331 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RNU6-387P-201ENST00000411331 RGL2O15211 777 aa8.53□□□□□ -1.04
RNU6-387P-201ENST00000411331 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RNU6-387P-201ENST00000411331 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RNU6-387P-201ENST00000411331 DCAF8Q5TAQ9 597 aa8.48□□□□□ -1.05
RNU6-387P-201ENST00000411331 OTUD5Q96G74 571 aa8.47□□□□□ -1.05
RNU6-387P-201ENST00000411331 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP8.46□□□□□ -1.06
RNU6-387P-201ENST00000411331 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
RNU6-387P-201ENST00000411331 FAM212AQ96EL1 285 aa8.45□□□□□ -1.06
RNU6-387P-201ENST00000411331 GSE1Q14687 1217 aa8.44□□□□□ -1.06
RNU6-387P-201ENST00000411331 PYGBP11216 843 aa8.43□□□□□ -1.06
RNU6-387P-201ENST00000411331 DCAF8L2P0C7V8 631 aa8.42□□□□□ -1.06
RNU6-387P-201ENST00000411331 CCDC61Q9Y6R9 512 aa8.41□□□□□ -1.06
RNU6-387P-201ENST00000411331 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RNU6-387P-201ENST00000411331 TRIM41Q8WV44 630 aa8.36□□□□□ -1.07
RNU6-387P-201ENST00000411331 CD44P16070 742 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RNU6-387P-201ENST00000411331 PHF12Q96QT6 1004 aa8.34□□□□□ -1.07
RNU6-387P-201ENST00000411331 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RNU6-387P-201ENST00000411331 ZRANB1Q9UGI0 708 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-387P-201ENST00000411331 PCDHB8Q9UN66 801 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-387P-201ENST00000411331 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-387P-201ENST00000411331 MAP3K13O43283 966 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-387P-201ENST00000411331 KIF12Q96FN5 646 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-387P-201ENST00000411331 POTEB2H3BUK9 544 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-387P-201ENST00000411331 CHGAP10645 457 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RNU6-387P-201ENST00000411331 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RNU6-387P-201ENST00000411331 IFNL1Q8IU54 200 aa8.28□□□□□ -1.08
RNU6-387P-201ENST00000411331 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RNU6-387P-201ENST00000411331 TRPC6Q9Y210 931 aa8.28□□□□□ -1.08
RNU6-387P-201ENST00000411331 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
RNU6-387P-201ENST00000411331 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
RNU6-387P-201ENST00000411331 HS6ST3Q8IZP7 471 aa8.26□□□□□ -1.09
RNU6-387P-201ENST00000411331 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RNU6-387P-201ENST00000411331 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RNU6-387P-201ENST00000411331 VGFO15240 615 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RNU6-387P-201ENST00000411331 PLCB2Q00722 1185 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-387P-201ENST00000411331 MS4A3Q96HJ5 214 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-387P-201ENST00000411331 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
RNU6-387P-201ENST00000411331 DCBLD2Q96PD2 775 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-387P-201ENST00000411331 SGIP1Q9BQI5 828 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-387P-201ENST00000411331 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
RNU6-387P-201ENST00000411331 STK25O00506 426 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-387P-201ENST00000411331 SLC24A1O60721 1099 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-387P-201ENST00000411331 CLCN6P51797 869 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-387P-201ENST00000411331 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
RNU6-387P-201ENST00000411331 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
RNU6-387P-201ENST00000411331 PSEN1P49768 467 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-387P-201ENST00000411331 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-387P-201ENST00000411331 STK24Q9Y6E0 443 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-387P-201ENST00000411331 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
RNU6-387P-201ENST00000411331 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
RNU6-387P-201ENST00000411331 CFAP44Q96MT7 982 aa8.15□□□□□ -1.1
RNU6-387P-201ENST00000411331 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
RNU6-387P-201ENST00000411331 EFCAB3Q8N7B9 438 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU6-387P-201ENST00000411331 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
RNU6-387P-201ENST00000411331 TAOK2Q9UL54 1235 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU6-387P-201ENST00000411331 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
RNU6-387P-201ENST00000411331 TMEM106CQ9BVX2 250 aa8.1□□□□□ -1.11
RNU6-387P-201ENST00000411331 MFRPQ9BY79 579 aa8.1□□□□□ -1.11
RNU6-387P-201ENST00000411331 CABP2Q9NPB3 220 aa8.1□□□□□ -1.11
RNU6-387P-201ENST00000411331 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
RNU6-387P-201ENST00000411331 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa8.09□□□□□ -1.11
RNU6-387P-201ENST00000411331 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa8.09□□□□□ -1.11
RNU6-387P-201ENST00000411331 TTLL13PA6NNM8 815 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU6-387P-201ENST00000411331 PHF8Q9UPP1 1060 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU6-387P-201ENST00000411331 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU6-387P-201ENST00000411331 TIE1P35590 1138 aa8.05□□□□□ -1.12
RNU6-387P-201ENST00000411331 FBXO22Q8NEZ5 403 aa8.05□□□□□ -1.12
RNU6-387P-201ENST00000411331 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RNU6-387P-201ENST00000411331 PPP1R37O75864 691 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU6-387P-201ENST00000411331 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
RNU6-387P-201ENST00000411331 CDAN1Q8IWY9 1227 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU6-387P-201ENST00000411331 MS4A4AQ96JQ5 239 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU6-387P-201ENST00000411331 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
RNU6-387P-201ENST00000411331 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
RNU6-387P-201ENST00000411331 TRIM35Q9UPQ4 493 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU6-387P-201ENST00000411331 POTEJP0CG39 1038 aa8.01□□□□□ -1.13
RNU6-387P-201ENST00000411331 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
RNU6-387P-201ENST00000411331 CADPS2Q86UW7 1296 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-387P-201ENST00000411331 MMRN1Q13201 1228 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-387P-201ENST00000411331 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
RNU6-387P-201ENST00000411331 SOX12O15370 315 aa7.96□□□□□ -1.14
RNU6-387P-201ENST00000411331 DPY19L2Q6NUT2 758 aa7.96□□□□□ -1.14
RNU6-387P-201ENST00000411331 POTEFA5A3E0 1075 aa7.94□□□□□ -1.14
RNU6-387P-201ENST00000411331 NLRP6P59044 892 aa7.94□□□□□ -1.14
RNU6-387P-201ENST00000411331 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
RNU6-387P-201ENST00000411331 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
RNU6-387P-201ENST00000411331 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
RNU6-387P-201ENST00000411331 VSIG10Q8N0Z9 540 aa7.92□□□□□ -1.14
RNU6-387P-201ENST00000411331 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP7.92□□□□□ -1.14
RNU6-387P-201ENST00000411331 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
RNU6-387P-201ENST00000411331 GOLGA2Q08379 1002 aa7.91□□□□□ -1.14
RNU6-387P-201ENST00000411331 MAMSTRQ6ZN01 415 aa7.9□□□□□ -1.14
RNU6-387P-201ENST00000411331 SPNS2Q8IVW8 549 aa7.89□□□□□ -1.15
RNU6-387P-201ENST00000411331 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
RNU6-387P-201ENST00000411331 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa7.86□□□□□ -1.15
RNU6-387P-201ENST00000411331 IER5LQ5T953 404 aa7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms