RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379565.7

RPS6KA3-201, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KA3, Length 7,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3-201ENST00000379565 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA3-201ENST00000379565 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
RPS6KA3-201ENST00000379565 MRS2Q9HD23 443 aa23.2■■□□□ 1.3
RPS6KA3-201ENST00000379565 NBR1Q14596 966 aa23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA3-201ENST00000379565 TAOK2Q9UL54 1235 aa23.18■■□□□ 1.3
RPS6KA3-201ENST00000379565 SCRIBQ14160 1630 aa23.17■■□□□ 1.3
RPS6KA3-201ENST00000379565 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.16■■□□□ 1.3
RPS6KA3-201ENST00000379565 TPRNQ4KMQ1 711 aa23.16■■□□□ 1.3
RPS6KA3-201ENST00000379565 RGL3Q3MIN7 710 aa23.15■■□□□ 1.3
RPS6KA3-201ENST00000379565 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
RPS6KA3-201ENST00000379565 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
RPS6KA3-201ENST00000379565 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA3-201ENST00000379565 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA3-201ENST00000379565 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA3-201ENST00000379565 NCLP19338 710 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
RPS6KA3-201ENST00000379565 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
RPS6KA3-201ENST00000379565 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.07■■□□□ 1.28
RPS6KA3-201ENST00000379565 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
RPS6KA3-201ENST00000379565 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
RPS6KA3-201ENST00000379565 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.02■■□□□ 1.28
RPS6KA3-201ENST00000379565 CFAP53Q96M91 514 aa23■■□□□ 1.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 POGKQ9P215 609 aa22.96■■□□□ 1.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 NEUROD2Q15784 382 aa22.96■■□□□ 1.27
RPS6KA3-201ENST00000379565 GOLGA2Q08379 1002 aa22.93■■□□□ 1.26
RPS6KA3-201ENST00000379565 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.266e-6■■■■□ 25.1
RPS6KA3-201ENST00000379565 CASC1Q6TDU7 716 aa22.91■■□□□ 1.26
RPS6KA3-201ENST00000379565 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
RPS6KA3-201ENST00000379565 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
RPS6KA3-201ENST00000379565 MLECQ14165 292 aa22.9■■□□□ 1.26
RPS6KA3-201ENST00000379565 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.9■■□□□ 1.26
RPS6KA3-201ENST00000379565 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.88■■□□□ 1.25
RPS6KA3-201ENST00000379565 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
RPS6KA3-201ENST00000379565 BECN1Q14457 450 aa22.88■■□□□ 1.25
RPS6KA3-201ENST00000379565 SOX12O15370 315 aa22.87■■□□□ 1.25
RPS6KA3-201ENST00000379565 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.87■■□□□ 1.25
RPS6KA3-201ENST00000379565 CLSTN1O94985 981 aa22.87■■□□□ 1.25
RPS6KA3-201ENST00000379565 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
RPS6KA3-201ENST00000379565 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.86■■□□□ 1.25
RPS6KA3-201ENST00000379565 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
RPS6KA3-201ENST00000379565 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
RPS6KA3-201ENST00000379565 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
RPS6KA3-201ENST00000379565 FGD1P98174 961 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KA3-201ENST00000379565 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
RPS6KA3-201ENST00000379565 CDCA8Q53HL2 280 aa22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA3-201ENST00000379565 NUDCQ9Y266 331 aa22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA3-201ENST00000379565 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA3-201ENST00000379565 KCNJ4P48050 445 aa22.75■■□□□ 1.23
RPS6KA3-201ENST00000379565 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.74■■□□□ 1.23
RPS6KA3-201ENST00000379565 PLCB2Q00722 1185 aa22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA3-201ENST00000379565 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA3-201ENST00000379565 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA3-201ENST00000379565 ERCC6Q03468 1493 aa22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA3-201ENST00000379565 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.71■■□□□ 1.23
RPS6KA3-201ENST00000379565 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
RPS6KA3-201ENST00000379565 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.22
RPS6KA3-201ENST00000379565 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
RPS6KA3-201ENST00000379565 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
RPS6KA3-201ENST00000379565 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
RPS6KA3-201ENST00000379565 CLIP1P30622 1438 aa22.62■■□□□ 1.21
RPS6KA3-201ENST00000379565 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
RPS6KA3-201ENST00000379565 RGS3P49796 1198 aa22.6■■□□□ 1.21
RPS6KA3-201ENST00000379565 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
RPS6KA3-201ENST00000379565 MIER1Q8N108 512 aa22.59■■□□□ 1.21
RPS6KA3-201ENST00000379565 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
RPS6KA3-201ENST00000379565 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.58■■□□□ 1.21
RPS6KA3-201ENST00000379565 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
RPS6KA3-201ENST00000379565 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.55■■□□□ 1.2
RPS6KA3-201ENST00000379565 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
RPS6KA3-201ENST00000379565 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa22.52■■□□□ 1.2
RPS6KA3-201ENST00000379565 STK26Q9P289 416 aa22.52■■□□□ 1.2
RPS6KA3-201ENST00000379565 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
RPS6KA3-201ENST00000379565 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
RPS6KA3-201ENST00000379565 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
RPS6KA3-201ENST00000379565 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.49■■□□□ 1.19
RPS6KA3-201ENST00000379565 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
RPS6KA3-201ENST00000379565 KANK1Q14678 1352 aa22.47■■□□□ 1.19
RPS6KA3-201ENST00000379565 GGT6Q6P531 493 aa22.47■■□□□ 1.19
RPS6KA3-201ENST00000379565 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.19
RPS6KA3-201ENST00000379565 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
RPS6KA3-201ENST00000379565 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
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RPS6KA3-201ENST00000379565 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.42■■□□□ 1.18
RPS6KA3-201ENST00000379565 PRM3Q9NNZ6 103 aa22.42■■□□□ 1.18
RPS6KA3-201ENST00000379565 NRDCO43847 1150 aa22.4■■□□□ 1.18
RPS6KA3-201ENST00000379565 MS4A1P11836 297 aa22.4■■□□□ 1.18
RPS6KA3-201ENST00000379565 MORC1Q86VD1 984 aa22.39■■□□□ 1.18
RPS6KA3-201ENST00000379565 G3V3G9 751 aa22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA3-201ENST00000379565 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA3-201ENST00000379565 TMF1P82094 1093 aa22.38■■□□□ 1.17
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RPS6KA3-201ENST00000379565 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA3-201ENST00000379565 MCCP23508 829 aa22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA3-201ENST00000379565 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA3-201ENST00000379565 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA3-201ENST00000379565 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA3-201ENST00000379565 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 DRC7Q8IY82 874 aa22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 GOLGA3Q08378 1498 aa22.28■■□□□ 1.16
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