RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373212.5

SH3BGRL-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL, Length 1,923 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL-201ENST00000373212 MRC2Q9UBG0 1479 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BGRL-201ENST00000373212 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP11.86□□□□□ -0.51
SH3BGRL-201ENST00000373212 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
SH3BGRL-201ENST00000373212 PROM2Q8N271 834 aa11.85□□□□□ -0.51
SH3BGRL-201ENST00000373212 CYB5RLQ6IPT4 315 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BGRL-201ENST00000373212 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
SH3BGRL-201ENST00000373212 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BGRL-201ENST00000373212 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
SH3BGRL-201ENST00000373212 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BGRL-201ENST00000373212 ARXQ96QS3 562 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BGRL-201ENST00000373212 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BGRL-201ENST00000373212 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
SH3BGRL-201ENST00000373212 NBR1Q14596 966 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BGRL-201ENST00000373212 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
SH3BGRL-201ENST00000373212 ARAP1Q96P48 1450 aa11.73□□□□□ -0.53
SH3BGRL-201ENST00000373212 KLHL34Q8N239 644 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BGRL-201ENST00000373212 SMARCA4P51532 1647 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BGRL-201ENST00000373212 SPOCK2Q92563 424 aa11.67□□□□□ -0.54
SH3BGRL-201ENST00000373212 CADPSQ9ULU8 1353 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BGRL-201ENST00000373212 RGL2O15211 777 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BGRL-201ENST00000373212 CEP164Q9UPV0 1460 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BGRL-201ENST00000373212 ERICH6Q7L0X2 663 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BGRL-201ENST00000373212 PEG3Q9GZU2 1588 aa11.59□□□□□ -0.55
SH3BGRL-201ENST00000373212 CHGAP10645 457 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
SH3BGRL-201ENST00000373212 APLP2Q06481 763 aa11.56□□□□□ -0.56
SH3BGRL-201ENST00000373212 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
SH3BGRL-201ENST00000373212 HOMEZQ8IX15 550 aa11.54□□□□□ -0.56
SH3BGRL-201ENST00000373212 FANCD2Q9BXW9 1451 aa11.54□□□□□ -0.56
SH3BGRL-201ENST00000373212 TMEM132AQ24JP5 1023 aa11.52□□□□□ -0.56
SH3BGRL-201ENST00000373212 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
SH3BGRL-201ENST00000373212 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
SH3BGRL-201ENST00000373212 C14orf37Q86TY3 774 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BGRL-201ENST00000373212 CHD1O14646 1710 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BGRL-201ENST00000373212 PLCD3Q8N3E9 789 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BGRL-201ENST00000373212 IFT140Q96RY7 1462 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BGRL-201ENST00000373212 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
SH3BGRL-201ENST00000373212 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BGRL-201ENST00000373212 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
SH3BGRL-201ENST00000373212 POLA2Q14181 598 aa11.4□□□□□ -0.58
SH3BGRL-201ENST00000373212 MROH2BQ7Z745 1585 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BGRL-201ENST00000373212 CFTRP13569 1480 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BGRL-201ENST00000373212 CLASP1Q7Z460 1538 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BGRL-201ENST00000373212 MIER1Q8N108 512 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BGRL-201ENST00000373212 ERCC6L2Q5T890 1561 aa11.33□□□□□ -0.59
SH3BGRL-201ENST00000373212 FBXO41Q8TF61 875 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BGRL-201ENST00000373212 STAG3Q9UJ98 1225 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BGRL-201ENST00000373212 HS6ST3Q8IZP7 471 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BGRL-201ENST00000373212 LMTK3Q96Q04 1460 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BGRL-201ENST00000373212 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP11.28□□□□□ -0.6
SH3BGRL-201ENST00000373212 GAPVD1Q14C86 1478 aa11.27□□□□□ -0.6
SH3BGRL-201ENST00000373212 HECW2Q9P2P5 1572 aa11.26□□□□□ -0.61
SH3BGRL-201ENST00000373212 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
SH3BGRL-201ENST00000373212 SOCS7O14512 581 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BGRL-201ENST00000373212 SYNJ1O43426 1573 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BGRL-201ENST00000373212 KIF13AQ9H1H9 1805 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BGRL-201ENST00000373212 TOPBP1Q92547 1522 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BGRL-201ENST00000373212 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
SH3BGRL-201ENST00000373212 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
SH3BGRL-201ENST00000373212 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
SH3BGRL-201ENST00000373212 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
SH3BGRL-201ENST00000373212 WIZO95785 1651 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BGRL-201ENST00000373212 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
SH3BGRL-201ENST00000373212 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
SH3BGRL-201ENST00000373212 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BGRL-201ENST00000373212 CAPN15O75808 1086 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BGRL-201ENST00000373212 ILDR2Q71H61 639 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BGRL-201ENST00000373212 KDM6BO15054 1643 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BGRL-201ENST00000373212 PLEKHG5O94827 1062 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BGRL-201ENST00000373212 PRDM2Q13029 1718 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BGRL-201ENST00000373212 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
SH3BGRL-201ENST00000373212 PODXL2Q9NZ53 605 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL-201ENST00000373212 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL-201ENST00000373212 ADGRL1O94910 1474 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL-201ENST00000373212 ABCC8Q09428 1581 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BGRL-201ENST00000373212 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL-201ENST00000373212 DNMBPQ6XZF7 1577 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BGRL-201ENST00000373212 SYNJ2O15056 1496 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BGRL-201ENST00000373212 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
SH3BGRL-201ENST00000373212 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
SH3BGRL-201ENST00000373212 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
SH3BGRL-201ENST00000373212 LMOD2Q6P5Q4 547 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BGRL-201ENST00000373212 ABCB7O75027 752 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BGRL-201ENST00000373212 FAM69CQ0P6D2 419 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BGRL-201ENST00000373212 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
SH3BGRL-201ENST00000373212 ABCC10Q5T3U5 1492 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BGRL-201ENST00000373212 STK25O00506 426 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BGRL-201ENST00000373212 P3H3Q8IVL6 736 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BGRL-201ENST00000373212 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
SH3BGRL-201ENST00000373212 DISP3Q9P2K9 1392 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BGRL-201ENST00000373212 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BGRL-201ENST00000373212 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
SH3BGRL-201ENST00000373212 WDR97A6NE52 1622 aa11.02□□□□□ -0.64
SH3BGRL-201ENST00000373212 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP11.02□□□□□ -0.65
SH3BGRL-201ENST00000373212 DIP2BQ9P265 1576 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BGRL-201ENST00000373212 GSE1Q14687 1217 aa11□□□□□ -0.65
SH3BGRL-201ENST00000373212 NEUROD2Q15784 382 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BGRL-201ENST00000373212 GRIN2BQ13224 1484 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BGRL-201ENST00000373212 SSUH2Q9Y2M2 353 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BGRL-201ENST00000373212 CEP170Q5SW79 1584 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BGRL-201ENST00000373212 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms