RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC61Q9Y6R9 512 aa17.65■□□□□ 0.42
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PTPRC-202ENST00000367364 HS3ST6Q96QI5 342 aa16.2■□□□□ 0.18
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PTPRC-202ENST00000367364 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
PTPRC-202ENST00000367364 SOX12O15370 315 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRC-202ENST00000367364 PHF8Q9UPP1 1060 aa15.84■□□□□ 0.13
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PTPRC-202ENST00000367364 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
PTPRC-202ENST00000367364 VGFO15240 615 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
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