RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365426.1

RNU6-1335P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1335, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1335P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PHF12Q96QT6 1004 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MARVELD3Q96A59 401 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SSUH2Q9Y2M2 353 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PRR29P0C7W0 189 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1335P-201ENST00000365426 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MS4A3Q96HJ5 214 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SLAIN1Q8ND83 568 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HS3ST6Q96QI5 342 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
RNU6-1335P-201ENST00000365426 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MYT1LQ9UL68 1186 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TRPC6Q9Y210 931 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FAM205CA6NFA0 338 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CREBZFQ9NS37 354 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-1335P-201ENST00000365426 EMP3P54852 163 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SNPHO15079 494 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LCE2BO14633 110 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SEC24BO95487 1268 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TIE1P35590 1138 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IER5LQ5T953 404 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TTLL13PA6NNM8 815 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KIF12Q96FN5 646 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CCDC61Q9Y6R9 512 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RGS20O76081 388 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FBLN2P98095 1184 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PTGER2P43116 358 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TRIM35Q9UPQ4 493 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-1335P-201ENST00000365426 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MAP3K13O43283 966 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZNF687Q8N1G0 1237 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1335P-201ENST00000365426 Q6ZNB5 142 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HCSTQ9UBK5 93 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PLCG2P16885 1265 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ERBB3P21860 1342 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1335P-201ENST00000365426 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IFFO2Q5TF58 517 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OCEL1Q9H607 264 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TRAF7Q6Q0C0 670 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1335P-201ENST00000365426 A0A0G2JS52 829 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1335P-201ENST00000365426 POTEEQ6S8J3 1075 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SGIP1Q9BQI5 828 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZNF787Q6DD87 383 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TMEM106CQ9BVX2 250 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1335P-201ENST00000365426 STAG3Q9UJ98 1225 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GPR153Q6NV75 609 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IFNL1Q8IU54 200 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KCNA4P22459 653 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C3orf67Q6ZVT6 689 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ATXN8OSP0DMR3 200 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FOXD4L1Q9NU39 408 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LAPTM4AQ15012 233 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TREML4Q6UXN2 200 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZNF710Q8N1W2 664 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-1335P-201ENST00000365426 STK17AQ9UEE5 414 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HRO43593 1189 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DOK7Q18PE1 504 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RASEFQ8IZ41 740 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-1335P-201ENST00000365426 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GFRA3O60609 400 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1335P-201ENST00000365426 XP32Q5T750 250 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ADGRD1Q6QNK2 874 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1335P-201ENST00000365426 AXIN2Q9Y2T1 843 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-1335P-201ENST00000365426 POTECB2RU33 542 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PBX2P40425 430 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1335P-201ENST00000365426 WIPF1O43516 503 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LCE3BQ5TA77 95 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DPY19L2Q6NUT2 758 aa3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.7 ms