RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPNS2Q8IVW8 549 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLCD3Q8N3E9 789 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-227P-201ENST00000362865 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RNU6-227P-201ENST00000362865 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RNU6-227P-201ENST00000362865 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLEKHG5O94827 1062 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-227P-201ENST00000362865 KLHL34Q8N239 644 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-227P-201ENST00000362865 MAMSTRQ6ZN01 415 aa7.46□□□□□ -1.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPOCK2Q92563 424 aa7.44□□□□□ -1.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 METRNQ9UJH8 293 aa7.43□□□□□ -1.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 NUBP1P53384 320 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZRANB1Q9UGI0 708 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-227P-201ENST00000362865 SCUBE2Q9NQ36 999 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 RASEFQ8IZ41 740 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 C7P10643 843 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 PKD2Q13563 968 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 DCAF8Q5TAQ9 597 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC39A7Q92504 469 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM212AQ96EL1 285 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 ST18O60284 1047 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 GSE1Q14687 1217 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC61Q9Y6R9 512 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 PHF12Q96QT6 1004 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 PYGBP11216 843 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 POTEFA5A3E0 1075 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRIM41Q8WV44 630 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
RNU6-227P-201ENST00000362865 RGL2O15211 777 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-227P-201ENST00000362865 KIF12Q96FN5 646 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-227P-201ENST00000362865 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RNU6-227P-201ENST00000362865 MAP3K13O43283 966 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-227P-201ENST00000362865 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-227P-201ENST00000362865 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RNU6-227P-201ENST00000362865 IFNL1Q8IU54 200 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-227P-201ENST00000362865 SGIP1Q9BQI5 828 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-227P-201ENST00000362865 PCDHB8Q9UN66 801 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-227P-201ENST00000362865 MS4A3Q96HJ5 214 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RNU6-227P-201ENST00000362865 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
RNU6-227P-201ENST00000362865 DCAF8L2P0C7V8 631 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRPC6Q9Y210 931 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-227P-201ENST00000362865 VGFO15240 615 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
RNU6-227P-201ENST00000362865 PSEN1P49768 467 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-227P-201ENST00000362865 MARVELD3Q96A59 401 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
RNU6-227P-201ENST00000362865 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RNU6-227P-201ENST00000362865 CHGAP10645 457 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
RNU6-227P-201ENST00000362865 TAOK2Q9UL54 1235 aa7.04□□□□□ -1.28
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLAIN1Q8ND83 568 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RNU6-227P-201ENST00000362865 STK25O00506 426 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-227P-201ENST00000362865 HS6ST3Q8IZP7 471 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-227P-201ENST00000362865 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RNU6-227P-201ENST00000362865 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RNU6-227P-201ENST00000362865 TIE1P35590 1138 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM106CQ9BVX2 250 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-227P-201ENST00000362865 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RNU6-227P-201ENST00000362865 TTLL13PA6NNM8 815 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-227P-201ENST00000362865 STK24Q9Y6E0 443 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-227P-201ENST00000362865 POTEB3A0JP26 581 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-227P-201ENST00000362865 POTEBQ6S5H4 581 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-227P-201ENST00000362865 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-227P-201ENST00000362865 CABP2Q9NPB3 220 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-227P-201ENST00000362865 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RNU6-227P-201ENST00000362865 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRIM35Q9UPQ4 493 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-227P-201ENST00000362865 EFCAB3Q8N7B9 438 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-227P-201ENST00000362865 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RNU6-227P-201ENST00000362865 GOLGA2Q08379 1002 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-227P-201ENST00000362865 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RNU6-227P-201ENST00000362865 MFRPQ9BY79 579 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-227P-201ENST00000362865 HS3ST6Q96QI5 342 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RNU6-227P-201ENST00000362865 PHF8Q9UPP1 1060 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-227P-201ENST00000362865 SOX12O15370 315 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-227P-201ENST00000362865 SEC24BO95487 1268 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-227P-201ENST00000362865 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RNU6-227P-201ENST00000362865 IER5LQ5T953 404 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-227P-201ENST00000362865 FBXO22Q8NEZ5 403 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-227P-201ENST00000362865 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RNU6-227P-201ENST00000362865 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RNU6-227P-201ENST00000362865 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RNU6-227P-201ENST00000362865 MS4A4AQ96JQ5 239 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-227P-201ENST00000362865 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.1 ms