RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303230.5

HCN1-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN1, Length 9,885 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN1-201ENST00000303230 GOLGA3Q08378 1498 aa22.11■■□□□ 1.13
HCN1-201ENST00000303230 PTMSP20962 102 aa22.1■■□□□ 1.13
HCN1-201ENST00000303230 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HCN1-201ENST00000303230 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
HCN1-201ENST00000303230 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.07■■□□□ 1.12
HCN1-201ENST00000303230 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
HCN1-201ENST00000303230 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HCN1-201ENST00000303230 CFAP44Q96MT7 982 aa21.99■■□□□ 1.11
HCN1-201ENST00000303230 CDCA8Q53HL2 280 aa21.96■■□□□ 1.11
HCN1-201ENST00000303230 MSNP26038 577 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
HCN1-201ENST00000303230 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
HCN1-201ENST00000303230 MS4A1P11836 297 aa21.95■■□□□ 1.1
HCN1-201ENST00000303230 CEP162Q5TB80 1403 aa21.93■■□□□ 1.1
HCN1-201ENST00000303230 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.93■■□□□ 1.1
HCN1-201ENST00000303230 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.88■■□□□ 1.09
HCN1-201ENST00000303230 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
HCN1-201ENST00000303230 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
HCN1-201ENST00000303230 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
HCN1-201ENST00000303230 ABCC9O60706 1549 aa21.84■■□□□ 1.09
HCN1-201ENST00000303230 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.82■■□□□ 1.08
HCN1-201ENST00000303230 CFAP53Q96M91 514 aa21.81■■□□□ 1.08
HCN1-201ENST00000303230 HSCBQ8IWL3 235 aa21.79■■□□□ 1.08
HCN1-201ENST00000303230 CCER2I3L3R5 266 aa21.78■■□□□ 1.08
HCN1-201ENST00000303230 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
HCN1-201ENST00000303230 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
HCN1-201ENST00000303230 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.77■■□□□ 1.08
HCN1-201ENST00000303230 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.76■■□□□ 1.07
HCN1-201ENST00000303230 USP35Q9P2H5 1018 aa21.76■■□□□ 1.07
HCN1-201ENST00000303230 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.76■■□□□ 1.07
HCN1-201ENST00000303230 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
HCN1-201ENST00000303230 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
HCN1-201ENST00000303230 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.73■■□□□ 1.07
HCN1-201ENST00000303230 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
HCN1-201ENST00000303230 GBP4Q96PP9 640 aa21.71■■□□□ 1.07
HCN1-201ENST00000303230 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.71■■□□□ 1.07
HCN1-201ENST00000303230 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
HCN1-201ENST00000303230 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
HCN1-201ENST00000303230 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.7■■□□□ 1.06
HCN1-201ENST00000303230 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
HCN1-201ENST00000303230 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.69■■□□□ 1.06
HCN1-201ENST00000303230 TSPY4P0CV99 314 aa21.66■■□□□ 1.06
HCN1-201ENST00000303230 TSPY10P0CW01 314 aa21.66■■□□□ 1.06
HCN1-201ENST00000303230 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.66■■□□□ 1.06
HCN1-201ENST00000303230 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
HCN1-201ENST00000303230 P3H3Q8IVL6 736 aa21.64■■□□□ 1.06
HCN1-201ENST00000303230 MCCP23508 829 aa21.64■■□□□ 1.05
HCN1-201ENST00000303230 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
HCN1-201ENST00000303230 FBLN2P98095 1184 aa21.6■■□□□ 1.05
HCN1-201ENST00000303230 NACADO15069 1562 aa21.59■■□□□ 1.05
HCN1-201ENST00000303230 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.59■■□□□ 1.05
HCN1-201ENST00000303230 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
HCN1-201ENST00000303230 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
HCN1-201ENST00000303230 PHF14O94880 888 aa21.57■■□□□ 1.04
HCN1-201ENST00000303230 KIF27Q86VH2 1401 aa21.55■■□□□ 1.04
HCN1-201ENST00000303230 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
HCN1-201ENST00000303230 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.51■■□□□ 1.03
HCN1-201ENST00000303230 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.51■■□□□ 1.03
HCN1-201ENST00000303230 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
HCN1-201ENST00000303230 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
HCN1-201ENST00000303230 RGS3P49796 1198 aa21.5■■□□□ 1.03
HCN1-201ENST00000303230 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
HCN1-201ENST00000303230 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.5■■□□□ 1.03
HCN1-201ENST00000303230 NUDCQ9Y266 331 aa21.49■■□□□ 1.03
HCN1-201ENST00000303230 DRC7Q8IY82 874 aa21.49■■□□□ 1.03
HCN1-201ENST00000303230 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
HCN1-201ENST00000303230 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa21.48■■□□□ 1.03
HCN1-201ENST00000303230 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa21.47■■□□□ 1.03
HCN1-201ENST00000303230 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
HCN1-201ENST00000303230 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
HCN1-201ENST00000303230 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa21.44■■□□□ 1.02
HCN1-201ENST00000303230 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
HCN1-201ENST00000303230 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.44■■□□□ 1.02
HCN1-201ENST00000303230 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.43■■□□□ 1.02
HCN1-201ENST00000303230 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.43■■□□□ 1.02
HCN1-201ENST00000303230 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.43■■□□□ 1.02
HCN1-201ENST00000303230 FGD1P98174 961 aa21.42■■□□□ 1.02
HCN1-201ENST00000303230 PLCB2Q00722 1185 aa21.42■■□□□ 1.02
HCN1-201ENST00000303230 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
HCN1-201ENST00000303230 ARID3CA6NKF2 412 aa21.4■■□□□ 1.02
HCN1-201ENST00000303230 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.4■■□□□ 1.02
HCN1-201ENST00000303230 CCDC34Q96HJ3 373 aa21.4■■□□□ 1.02
HCN1-201ENST00000303230 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.39■■□□□ 1.01
HCN1-201ENST00000303230 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
HCN1-201ENST00000303230 SETQ01105 290 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
HCN1-201ENST00000303230 KCNJ4P48050 445 aa21.37■■□□□ 1.01
HCN1-201ENST00000303230 TPM4P67936 248 aa21.37■■□□□ 1.01
HCN1-201ENST00000303230 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
HCN1-201ENST00000303230 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.36■■□□□ 1.01
HCN1-201ENST00000303230 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.36■■□□□ 1.01
HCN1-201ENST00000303230 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.35■■□□□ 1.01
HCN1-201ENST00000303230 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
HCN1-201ENST00000303230 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
HCN1-201ENST00000303230 RALBP1Q15311 655 aa21.32■■□□□ 1
HCN1-201ENST00000303230 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
HCN1-201ENST00000303230 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
HCN1-201ENST00000303230 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
HCN1-201ENST00000303230 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.3■■□□□ 1
HCN1-201ENST00000303230 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
HCN1-201ENST00000303230 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.29■■□□□ 1
HCN1-201ENST00000303230 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.29■■□□□ 1
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