RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000177421.3

Gm20554-201, mousemouse

BASIC

Gene Gm20554, Length 2,352 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20554-201ENSMUST00000177421 NrkQ9R0G8 1455 aa18.27■□□□□ 0.52
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Ubl4bQ9CQ84 188 aa18.27■□□□□ 0.52
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Shroom4Q1W617 1475 aa18.27■□□□□ 0.51
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Ccdc18Q640L5 1455 aa18.26■□□□□ 0.51
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Cux2P70298 1426 aa18.23■□□□□ 0.51
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Grin2bQ01097 1482 aa18.23■□□□□ 0.51
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Znf710Q3U288 666 aa18.18■□□□□ 0.5
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Arap1Q4LDD4 1452 aa18.17■□□□□ 0.5
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Anp32aO35381 247 aa18.17■□□□□ 0.5
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Kdm5bQ80Y84 1544 aa18.15■□□□□ 0.5
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Setd5Q5XJV7 1441 aa18.12■□□□□ 0.49
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Eea1Q8BL66 1411 aa18.11■□□□□ 0.49
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa18.11■□□□□ 0.49
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Rpap1Q80TE0 1409 aa18.09■□□□□ 0.49
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Mrc2Q64449 1479 aa18.09■□□□□ 0.49
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa18.09■□□□□ 0.49
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Eid3Q3V124 375 aa18.08■□□□□ 0.48
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Map3k1P53349 1493 aa18.06■□□□□ 0.48
Gm20554-201ENSMUST00000177421 PrkcshO08795 521 aa18.04■□□□□ 0.48
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa18.04■□□□□ 0.48
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Rtl5Q5DTT4 599 aa18.02■□□□□ 0.48
Gm20554-201ENSMUST00000177421 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Ankrd26Q811D2 1581 aa18.01■□□□□ 0.47
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Duox2A2AQ99 1517 aa18■□□□□ 0.47
Gm20554-201ENSMUST00000177421 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Stra8P70278 393 aa17.98■□□□□ 0.47
Gm20554-201ENSMUST00000177421 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Erich3F6QRE9 1637 aa17.95■□□□□ 0.46
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Pcf11G3X9Z4 1553 aa17.95■□□□□ 0.46
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Samd9lQ69Z37 1561 aa17.95■□□□□ 0.46
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Lmod2Q3UHZ5 550 aa17.94■□□□□ 0.46
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Cux1P53564 1515 aa17.94■□□□□ 0.46
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Tiam1Q60610 1591 aa17.94■□□□□ 0.46
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Efcab5A0JP43 1406 aa17.93■□□□□ 0.46
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Calr4Q3TQS0 420 aa17.93■□□□□ 0.46
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Slx4Q6P1D7 1565 aa17.92■□□□□ 0.46
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
Gm20554-201ENSMUST00000177421 BlmO88700 1416 aa17.91■□□□□ 0.46
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Rad54l2Q99NG0 1466 aa17.9■□□□□ 0.46
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Kif21aQ9QXL2 1672 aa17.9■□□□□ 0.46
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Naip1Q9QWK5 1403 aa17.89■□□□□ 0.45
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Supt16hQ920B9 1047 aa17.87■□□□□ 0.45
Gm20554-201ENSMUST00000177421 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa17.87■□□□□ 0.45
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Carmil1Q6EDY6 1374 aa17.86■□□□□ 0.45
Gm20554-201ENSMUST00000177421 SynmQ70IV5 1561 aa17.84■□□□□ 0.45
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Crocc2F6XLV1 1638 aa17.82■□□□□ 0.44
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
Gm20554-201ENSMUST00000177421 UacaQ8CGB3 1411 aa17.78■□□□□ 0.44
Gm20554-201ENSMUST00000177421 NclP09405 707 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Washc2Q6PGL7 1334 aa17.77■□□□□ 0.43
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Gm13697A2AK42 830 aa17.75■□□□□ 0.43
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Aebp1Q640N1 1128 aa17.71■□□□□ 0.43
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Fyco1Q8VDC1 1437 aa17.71■□□□□ 0.43
Gm20554-201ENSMUST00000177421 CntlnA2AM05 1397 aa17.69■□□□□ 0.42
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Setd1bQ8CFT2 1985 aa17.68■□□□□ 0.42
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Pla2r1Q62028 1487 aa17.68■□□□□ 0.42
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Plb1Q3TTY0 1478 aa17.67■□□□□ 0.42
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa17.67■□□□□ 0.42
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
Gm20554-201ENSMUST00000177421 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa17.66■□□□□ 0.42
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa17.66■□□□□ 0.42
Gm20554-201ENSMUST00000177421 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Magi3Q9EQJ9 1476 aa17.64■□□□□ 0.41
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
Gm20554-201ENSMUST00000177421 WizO88286 1684 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa17.61■□□□□ 0.41
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Grin2aP35436 1464 aa17.61■□□□□ 0.41
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Peg3Q3URU2 1571 aa17.61■□□□□ 0.41
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa17.6■□□□□ 0.41
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Liat1Q810M6 228 aa17.6■□□□□ 0.41
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa17.6■□□□□ 0.41
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Pak3Q61036 559 aa17.59■□□□□ 0.41
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Ncoa2Q61026 1462 aa17.57■□□□□ 0.4
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Camsap2Q8C1B1 1461 aa17.56■□□□□ 0.4
Gm20554-201ENSMUST00000177421 CadpsQ80TJ1 1355 aa17.56■□□□□ 0.4
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Abca5Q8K448 1642 aa17.56■□□□□ 0.4
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Disp1Q3TDN0 1521 aa17.56■□□□□ 0.4
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Gpatch8A2A6A1 1505 aa17.55■□□□□ 0.4
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa17.55■□□□□ 0.4
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Egfem1Q8C088 590 aa17.54■□□□□ 0.4
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Slc24a1Q91WD8 1130 aa17.54■□□□□ 0.4
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Chic2Q9D9G3 165 aa17.52■□□□□ 0.4
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.39
Gm20554-201ENSMUST00000177421 PxdnQ3UQ28 1475 aa17.51■□□□□ 0.39
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Fhad1A6PWD2 1420 aa17.51■□□□□ 0.39
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Ccer2J3QPU5 274 aa17.51■□□□□ 0.39
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Ccnb3Q810T2 1396 aa17.49■□□□□ 0.39
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Ccdc27Q3V036 639 aa17.48■□□□□ 0.39
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Kif27Q7M6Z4 1394 aa17.48■□□□□ 0.39
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Abca16E9PWJ7 1678 aa17.48■□□□□ 0.39
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Adamts12Q811B3 1600 aa17.48■□□□□ 0.39
Gm20554-201ENSMUST00000177421 Ift140E9PY46 1464 aa17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 49.3 ms