RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Eid3Q3V124 375 aa24.9■■□□□ 1.58
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Naip1Q9QWK5 1403 aa24.89■■□□□ 1.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pcf11G3X9Z4 1553 aa24.87■■□□□ 1.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slx4Q6P1D7 1565 aa24.87■■□□□ 1.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Baz1bQ9Z277 1479 aa24.84■■□□□ 1.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 BlmO88700 1416 aa24.77■■□□□ 1.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Aplp2Q06335 707 aa24.73■■□□□ 1.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cux1P53564 1515 aa24.69■■□□□ 1.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa24.62■■□□□ 1.53
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Peg3Q3URU2 1571 aa24.59■■□□□ 1.53
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cux2P70298 1426 aa24.58■■□□□ 1.53
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Carmil1Q6EDY6 1374 aa24.58■■□□□ 1.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CntlnA2AM05 1397 aa24.56■■□□□ 1.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Efcab5A0JP43 1406 aa24.55■■□□□ 1.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm38655A0A286YDK6 273 aa24.54■■□□□ 1.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lmod2Q3UHZ5 550 aa24.54■■□□□ 1.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rpap1Q80TE0 1409 aa24.52■■□□□ 1.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Duox2A2AQ99 1517 aa24.48■■□□□ 1.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fyco1Q8VDC1 1437 aa24.46■■□□□ 1.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fhad1A6PWD2 1420 aa24.46■■□□□ 1.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 UacaQ8CGB3 1411 aa24.46■■□□□ 1.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa24.45■■□□□ 1.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Samd9lQ69Z37 1561 aa24.43■■□□□ 1.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa24.42■■□□□ 1.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SynmQ70IV5 1561 aa24.42■■□□□ 1.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa24.41■■□□□ 1.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CenpbP27790 599 aa24.4■■□□□ 1.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vps8Q0P5W1 1427 aa24.39■■□□□ 1.5
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa24.39■■□□□ 1.49
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Crocc2F6XLV1 1638 aa24.39■■□□□ 1.49
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Naip2Q9QUK4 1447 aa24.37■■□□□ 1.49
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mia2Q91ZV0 1396 aa24.37■■□□□ 1.49
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NclP09405 707 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ubl4bQ9CQ84 188 aa24.35■■□□□ 1.49
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Aebp1Q640N1 1128 aa24.33■■□□□ 1.49
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 A2mQ6GQT1 1474 aa24.29■■□□□ 1.48
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam135aQ6NS59 1506 aa24.29■■□□□ 1.48
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccer2J3QPU5 274 aa24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rad54l2Q99NG0 1466 aa24.26■■□□□ 1.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cul7Q8VE73 1689 aa24.26■■□□□ 1.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tnnt3Q9QZ47 272 aa24.25■■□□□ 1.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm13697A2AK42 830 aa24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf710Q3U288 666 aa24.21■■□□□ 1.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Camsap2Q8C1B1 1461 aa24.2■■□□□ 1.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa24.17■■□□□ 1.46
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Naip5Q9R016 1403 aa24.16■■□□□ 1.46
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fhod3Q76LL6 1578 aa24.15■■□□□ 1.46
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccnb3Q810T2 1396 aa24.14■■□□□ 1.46
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Abca5Q8K448 1642 aa24.14■■□□□ 1.45
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pla2r1Q62028 1487 aa24.12■■□□□ 1.45
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kif21aQ9QXL2 1672 aa24.11■■□□□ 1.45
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gpatch8A2A6A1 1505 aa24.11■■□□□ 1.45
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gcc2Q8CHG3 1679 aa24.1■■□□□ 1.45
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ncoa2Q61026 1462 aa24.1■■□□□ 1.45
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Chic2Q9D9G3 165 aa24.08■■□□□ 1.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CadpsQ80TJ1 1355 aa24.03■■□□□ 1.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NexmifQ5DTT1 1515 aa24.03■■□□□ 1.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Magi3Q9EQJ9 1476 aa24.02■■□□□ 1.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Stra8P70278 393 aa24.02■■□□□ 1.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 BC005561E9Q5E2 1589 aa24.02■■□□□ 1.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pprc1Q6NZN1 1644 aa24.01■■□□□ 1.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Setbp1Q9Z180 1582 aa23.99■■□□□ 1.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 WizO88286 1684 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ube2uB1AUC4 352 aa23.97■■□□□ 1.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Myt1Q8CFC2 1127 aa23.97■■□□□ 1.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kif27Q7M6Z4 1394 aa23.96■■□□□ 1.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam71e1A1L3C1 212 aa23.94■■□□□ 1.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adamts12Q811B3 1600 aa23.92■■□□□ 1.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Grin2aP35436 1464 aa23.91■■□□□ 1.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mphosph9A6H5Y1 991 aa23.89■■□□□ 1.41
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Setd1bQ8CFT2 1985 aa23.88■■□□□ 1.41
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rfx7F8VPJ6 1459 aa23.88■■□□□ 1.41
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mug1P28665 1476 aa23.87■■□□□ 1.41
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Soga1E1U8D0 1418 aa23.83■■□□□ 1.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PxdnQ3UQ28 1475 aa23.81■■□□□ 1.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa23.8■■□□□ 1.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Abca16E9PWJ7 1678 aa23.8■■□□□ 1.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cabp1Q9JLK7 227 aa23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Disp1Q3TDN0 1521 aa23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ift140E9PY46 1464 aa23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Abcc5Q9R1X5 1436 aa23.78■■□□□ 1.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp644E9QA22 1323 aa23.78■■□□□ 1.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa23.78■■□□□ 1.4
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