RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557667.5

RBM23-233, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 1 (best)

Gene RBM23, Length 4,240 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-233	ENST00000557667	LYRM9	A8MSI8	78 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	LEPROT	O15243	131 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	GNRH2	O43555	120 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	KRTAP10-9	P60411	292 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667		Q6ZS46	218 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	PROK1	P58294	105 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667		J3QL48	77 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	RNF183	Q96D59	192 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	TMEM238	C9JI98	176 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	CRYGD	P07320	174 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	MUC7	Q8TAX7	377 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	SMKR1	H3BMG3	65 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667		K7EQD1	137 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	TIMM17B	O60830	172 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	HERVK_113	P63121	156 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	IL17D	Q8TAD2	202 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	VPREB1	P12018	145 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	COX11	Q9Y6N1	276 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667		A0A096LNJ9	63 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	AZU1	P20160	251 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	LINC00315	P59091	139 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	BAALC	Q8WXS3	180 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	UBE2L6	O14933	153 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	CD28	P10747	220 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	IFITM1	P13164	125 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	PRR31	Q5SQ13	230 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	CST9L	Q9H4G1	147 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667		F6UB75	175 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	TM2D2	Q9BX73	214 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	KNCN	A6PVL3	124 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	CRLF1	O75462	422 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	FABP2	P12104	132 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	HERV-K104	P63124	156 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	ATOH7	Q8N100	152 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	LAMA1	P25391	3075 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	IGIP	A6NJ69	53 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	hDV102S1	A0JD36	115 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	NACA	E9PAV3	2078 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	FRYL	O94915	3013 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	C9orf118	A6NHY6	69 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	CR1	P17927	2039 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	WIPF1	O43516	503 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	LY6G6D	O95868	133 aa		6.21	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		6.21	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF575	Q86XF7	245 aa		6.21	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	CEND1	Q8N111	149 aa		6.21	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	MTURN	Q8N3F0	131 aa		6.21	□□□□□ -1.41
RBM23-233	ENST00000557667	UBE2V1	Q13404	147 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RBM23-233	ENST00000557667	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RBM23-233	ENST00000557667	HIST1H4G	Q99525	98 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RBM23-233	ENST00000557667	PLXNB1	O43157	2135 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RBM23-233	ENST00000557667	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RBM23-233	ENST00000557667	MIF	P14174	115 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RBM23-233	ENST00000557667	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RBM23-233	ENST00000557667	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RBM23-233	ENST00000557667	TSHB	P01222	138 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RBM23-233	ENST00000557667	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RBM23-233	ENST00000557667	TMEM243	Q9BU79	118 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RBM23-233	ENST00000557667	AMELX	Q99217	191 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RBM23-233	ENST00000557667	FGF6	P10767	208 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RBM23-233	ENST00000557667	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RBM23-233	ENST00000557667	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
RBM23-233	ENST00000557667	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		6.19	□□□□□ -1.42
RBM23-233	ENST00000557667	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		6.19	□□□□□ -1.42
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF815P	A8K554	130 aa		6.19	□□□□□ -1.42
RBM23-233	ENST00000557667	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		6.19	□□□□□ -1.42
RBM23-233	ENST00000557667	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		6.19	□□□□□ -1.42
RBM23-233	ENST00000557667	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		6.19	□□□□□ -1.42
RBM23-233	ENST00000557667	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		6.19	□□□□□ -1.42
RBM23-233	ENST00000557667	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		6.19	□□□□□ -1.42

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