RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 J3QLW9 94 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 J3QRE1 110 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 PRM2P04554 102 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 S100A3P33764 101 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 BLCAPP62952 87 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 SPG11Q96JI7 2443 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 APCP25054 2843 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 ABCA4P78363 2273 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 H3BVH4 76 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 IFI6P09912 130 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 GNLYP22749 145 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 RHOHQ15669 191 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 C1orf100Q5SVJ3 147 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 SCXQ7RTU7 201 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 C11orf52Q96A22 123 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 C8orf49Q96NF6 230 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 OSTCQ9NRP0 149 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 ALPK2Q86TB3 2170 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 IGHV3-9P01782 118 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 FHL2Q14192 279 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 Q6ZSN1 163 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 GPHB5Q86YW7 130 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 TTTY12Q9BZ98 90 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 ROS1P08922 2347 aa6.46□□□□□ -1.37
RABGGTB-214ENST00000497648 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 H7BZZ5 65 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 J3QKU1 62 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 CRYBA2P53672 197 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 ESRGQ1W209 222 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 PRNTQ86SH4 94 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.45□□□□□ -1.38
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RABGGTB-214ENST00000497648 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 UBE2D1P51668 147 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 LINC00205P59089 165 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.45□□□□□ -1.38
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RABGGTB-214ENST00000497648 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF524Q96C55 264 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 CCDC168Q8NDH2 2452 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 CACNA1DQ01668 2161 aa6.44□□□□□ -1.38
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RABGGTB-214ENST00000497648 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 Q6JHZ5 121 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.43□□□□□ -1.38
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RABGGTB-214ENST00000497648 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 CD28P10747 220 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 RPRMLQ8N4K4 120 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM216BQ8N7L0 139 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 PLCE1Q9P212 2302 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 CSMD2Q7Z408 3487 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF702PQ9H963 129 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 CADP27708 2225 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 MYO9AB2RTY4 2548 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa6.41□□□□□ -1.38
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RABGGTB-214ENST00000497648 ATP6V0E1O15342 81 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 RMI2Q96E14 147 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-214ENST00000497648 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.4□□□□□ -1.39
RABGGTB-214ENST00000497648 A6NN06 94 aa6.4□□□□□ -1.39
RABGGTB-214ENST00000497648 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.4□□□□□ -1.39
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RABGGTB-214ENST00000497648 Q96M85 177 aa6.4□□□□□ -1.39
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.4□□□□□ -1.39
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RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
RABGGTB-214ENST00000497648 V9GYV3 84 aa6.4□□□□□ -1.39
RABGGTB-214ENST00000497648 DYSFO75923 2080 aa6.4□□□□□ -1.39
RABGGTB-214ENST00000497648 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-214ENST00000497648 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-214ENST00000497648 IQCF6A8MYZ5 107 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-214ENST00000497648 FXYD6P3P58550 94 aa6.39□□□□□ -1.39
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